RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 FMN1Q68DA7 1419 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CTDP1-208ENST00000613122 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.91■■□□□ 1.74
CTDP1-208ENST00000613122 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
CTDP1-208ENST00000613122 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.9■■□□□ 1.74
CTDP1-208ENST00000613122 NUP155O75694 1391 aa25.89■■□□□ 1.74
CTDP1-208ENST00000613122 KIF3BO15066 747 aa25.89■■□□□ 1.73
CTDP1-208ENST00000613122 EID1Q9Y6B2 187 aa25.88■■□□□ 1.73
CTDP1-208ENST00000613122 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.88■■□□□ 1.73
CTDP1-208ENST00000613122 FOXD1Q16676 465 aa25.87■■□□□ 1.73
CTDP1-208ENST00000613122 PTMAP06454 111 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CTDP1-208ENST00000613122 ABCC8Q09428 1581 aa25.85■■□□□ 1.73
CTDP1-208ENST00000613122 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CTDP1-208ENST00000613122 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.85■■□□□ 1.73
CTDP1-208ENST00000613122 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
CTDP1-208ENST00000613122 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
CTDP1-208ENST00000613122 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
CTDP1-208ENST00000613122 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CTDP1-208ENST00000613122 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
CTDP1-208ENST00000613122 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.8■■□□□ 1.72
CTDP1-208ENST00000613122 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CTDP1-208ENST00000613122 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.79■■□□□ 1.723e-6■■■■□ 24
CTDP1-208ENST00000613122 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.79■■□□□ 1.72
CTDP1-208ENST00000613122 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
CTDP1-208ENST00000613122 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.78■■□□□ 1.72
CTDP1-208ENST00000613122 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa25.77■■□□□ 1.72
CTDP1-208ENST00000613122 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CTDP1-208ENST00000613122 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.71
CTDP1-208ENST00000613122 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.75■■□□□ 1.71
CTDP1-208ENST00000613122 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
CTDP1-208ENST00000613122 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
CTDP1-208ENST00000613122 MCCP23508 829 aa25.74■■□□□ 1.71
CTDP1-208ENST00000613122 JPH4Q96JJ6 628 aa25.71■■□□□ 1.71
CTDP1-208ENST00000613122 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CTDP1-208ENST00000613122 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.71■■□□□ 1.71
CTDP1-208ENST00000613122 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.71
CTDP1-208ENST00000613122 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.69■■□□□ 1.7
CTDP1-208ENST00000613122 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.69■■□□□ 1.7
CTDP1-208ENST00000613122 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.68■■□□□ 1.7
CTDP1-208ENST00000613122 CFAP44Q96MT7 982 aa25.68■■□□□ 1.7
CTDP1-208ENST00000613122 PLCB2Q00722 1185 aa25.67■■□□□ 1.7
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa25.66■■□□□ 1.7
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa25.66■■□□□ 1.7
CTDP1-208ENST00000613122 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
CTDP1-208ENST00000613122 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
CTDP1-208ENST00000613122 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.64■■□□□ 1.7
CTDP1-208ENST00000613122 CCER2I3L3R5 266 aa25.64■■□□□ 1.7
CTDP1-208ENST00000613122 APBB1O00213 710 aa25.64■■□□□ 1.69
CTDP1-208ENST00000613122 RALBP1Q15311 655 aa25.64■■□□□ 1.69
CTDP1-208ENST00000613122 HSCBQ8IWL3 235 aa25.64■■□□□ 1.69
CTDP1-208ENST00000613122 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDP1-208ENST00000613122 STK31Q9BXU1 1019 aa25.62■■□□□ 1.69
CTDP1-208ENST00000613122 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.61■■□□□ 1.69
CTDP1-208ENST00000613122 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa25.59■■□□□ 1.69
CTDP1-208ENST00000613122 AMPHP49418 695 aa25.58■■□□□ 1.69
CTDP1-208ENST00000613122 CLSTN1O94985 981 aa25.57■■□□□ 1.68
CTDP1-208ENST00000613122 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.57■■□□□ 1.68
CTDP1-208ENST00000613122 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.56■■□□□ 1.68
CTDP1-208ENST00000613122 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
CTDP1-208ENST00000613122 NRDCO43847 1150 aa25.55■■□□□ 1.68
CTDP1-208ENST00000613122 NUTM2FA1L443 756 aa25.54■■□□□ 1.68
CTDP1-208ENST00000613122 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.54■■□□□ 1.68
CTDP1-208ENST00000613122 GORABQ5T7V8 394 aa25.54■■□□□ 1.68
CTDP1-208ENST00000613122 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.54■■□□□ 1.68
CTDP1-208ENST00000613122 WIZO95785 1651 aa25.53■■□□□ 1.68
CTDP1-208ENST00000613122 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.52■■□□□ 1.68
CTDP1-208ENST00000613122 OSCARQ8IYS5 282 aa25.51■■□□□ 1.67
CTDP1-208ENST00000613122 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
CTDP1-208ENST00000613122 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.51■■□□□ 1.67
CTDP1-208ENST00000613122 PTPRGP23470 1445 aa25.5■■□□□ 1.67
CTDP1-208ENST00000613122 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDP1-208ENST00000613122 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CTDP1-208ENST00000613122 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.48■■□□□ 1.67
CTDP1-208ENST00000613122 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDP1-208ENST00000613122 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDP1-208ENST00000613122 G3V3G9 751 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDP1-208ENST00000613122 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDP1-208ENST00000613122 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDP1-208ENST00000613122 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.45■■□□□ 1.67
CTDP1-208ENST00000613122 GPATCH3Q96I76 525 aa25.45■■□□□ 1.66
CTDP1-208ENST00000613122 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.44■■□□□ 1.66
CTDP1-208ENST00000613122 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CTDP1-208ENST00000613122 UACAQ9BZF9 1416 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.41■■□□□ 1.66
CTDP1-208ENST00000613122 HMMRO75330 724 aa25.41■■□□□ 1.66
CTDP1-208ENST00000613122 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CTDP1-208ENST00000613122 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CTDP1-208ENST00000613122 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDP1-208ENST00000613122 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.37■■□□□ 1.65
CTDP1-208ENST00000613122 EVA1CP58658 441 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDP1-208ENST00000613122 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDP1-208ENST00000613122 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.35■■□□□ 1.65
CTDP1-208ENST00000613122 COG3Q96JB2 828 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDP1-208ENST00000613122 NLRP13Q86W25 1043 aa25.33■■□□□ 1.65
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.32■■□□□ 1.64
CTDP1-208ENST00000613122 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
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