RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612516.4

CCL23-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 23, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL23, Length 569 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23-201ENST00000612516 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CCL23-201ENST00000612516 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa9.65□□□□□ -0.87
CCL23-201ENST00000612516 POGZQ7Z3K3 1410 aa9.62□□□□□ -0.87
CCL23-201ENST00000612516 RICTORQ6R327 1708 aa9.62□□□□□ -0.87
CCL23-201ENST00000612516 CCNB3Q8WWL7 1395 aa9.62□□□□□ -0.87
CCL23-201ENST00000612516 MAGI2Q86UL8 1455 aa9.61□□□□□ -0.87
CCL23-201ENST00000612516 AFAP1Q8N556 730 aa9.61□□□□□ -0.87
CCL23-201ENST00000612516 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CCL23-201ENST00000612516 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa9.61□□□□□ -0.87
CCL23-201ENST00000612516 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa9.61□□□□□ -0.87
CCL23-201ENST00000612516 APLP2Q06481 763 aa9.6□□□□□ -0.87
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CCL23-201ENST00000612516 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa9.59□□□□□ -0.87
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CCL23-201ENST00000612516 YEATS2Q9ULM3 1422 aa9.58□□□□□ -0.88
CCL23-201ENST00000612516 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa9.58□□□□□ -0.88
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CCL23-201ENST00000612516 PREX2Q70Z35 1606 aa9.58□□□□□ -0.88
CCL23-201ENST00000612516 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa9.58□□□□□ -0.88
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CCL23-201ENST00000612516 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CCL23-201ENST00000612516 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa9.56□□□□□ -0.88
CCL23-201ENST00000612516 VPS8Q8N3P4 1428 aa9.56□□□□□ -0.88
CCL23-201ENST00000612516 BCORL1Q5H9F3 1711 aa9.55□□□□□ -0.88
CCL23-201ENST00000612516 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa9.55□□□□□ -0.88
CCL23-201ENST00000612516 C9orf84Q5VXU9 1444 aa9.55□□□□□ -0.88
CCL23-201ENST00000612516 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
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CCL23-201ENST00000612516 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa9.54□□□□□ -0.88
CCL23-201ENST00000612516 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa9.54□□□□□ -0.88
CCL23-201ENST00000612516 ADAMTSL3P82987 1691 aa9.54□□□□□ -0.88
CCL23-201ENST00000612516 ABCC1P33527 1531 aa9.53□□□□□ -0.88
CCL23-201ENST00000612516 HECW2Q9P2P5 1572 aa9.53□□□□□ -0.88
CCL23-201ENST00000612516 MLH3Q9UHC1 1453 aa9.53□□□□□ -0.88
CCL23-201ENST00000612516 ITSN2Q9NZM3 1697 aa9.52□□□□□ -0.89
CCL23-201ENST00000612516 KDM5CP41229 1560 aa9.52□□□□□ -0.89
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CCL23-201ENST00000612516 SYCP2Q9BX26 1530 aa9.51□□□□□ -0.89
CCL23-201ENST00000612516 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa9.51□□□□□ -0.89
CCL23-201ENST00000612516 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CCL23-201ENST00000612516 TIAM1Q13009 1591 aa9.51□□□□□ -0.89
CCL23-201ENST00000612516 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa9.51□□□□□ -0.89
CCL23-201ENST00000612516 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa9.51□□□□□ -0.89
CCL23-201ENST00000612516 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CCL23-201ENST00000612516 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CCL23-201ENST00000612516 RSPH4AQ5TD94 716 aa9.5□□□□□ -0.89
CCL23-201ENST00000612516 NCOA2Q15596 1464 aa9.5□□□□□ -0.89
CCL23-201ENST00000612516 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa9.49□□□□□ -0.89
CCL23-201ENST00000612516 TSPY4P0CV99 314 aa9.49□□□□□ -0.89
CCL23-201ENST00000612516 TSPY10P0CW01 314 aa9.49□□□□□ -0.89
CCL23-201ENST00000612516 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CCL23-201ENST00000612516 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa9.49□□□□□ -0.89
CCL23-201ENST00000612516 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL23-201ENST00000612516 MAP3K1Q13233 1512 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL23-201ENST00000612516 ABCA6Q8N139 1617 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL23-201ENST00000612516 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CCL23-201ENST00000612516 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa9.47□□□□□ -0.89
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CCL23-201ENST00000612516 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa9.46□□□□□ -0.89
CCL23-201ENST00000612516 GGT6Q6P531 493 aa9.46□□□□□ -0.9
CCL23-201ENST00000612516 REREQ9P2R6 1566 aa9.46□□□□□ -0.9
CCL23-201ENST00000612516 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa9.45□□□□□ -0.9
CCL23-201ENST00000612516 AGLP35573 1532 aa9.45□□□□□ -0.9
CCL23-201ENST00000612516 HSPA2P54652 639 aa9.44□□□□□ -0.9
CCL23-201ENST00000612516 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa9.44□□□□□ -0.9
CCL23-201ENST00000612516 A2MP01023 1474 aa9.44□□□□□ -0.9
CCL23-201ENST00000612516 CCDC141Q6ZP82 1450 aa9.43□□□□□ -0.9
CCL23-201ENST00000612516 MBD5Q9P267 1494 aa9.43□□□□□ -0.9
CCL23-201ENST00000612516 MYOM3Q5VTT5 1437 aa9.43□□□□□ -0.9
CCL23-201ENST00000612516 CNTLNQ9NXG0 1405 aa9.43□□□□□ -0.9
CCL23-201ENST00000612516 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
CCL23-201ENST00000612516 MIA2Q96PC5 1412 aa9.42□□□□□ -0.9
CCL23-201ENST00000612516 KIF3BO15066 747 aa9.42□□□□□ -0.9
CCL23-201ENST00000612516 PPP6R1Q9UPN7 881 aa9.42□□□□□ -0.9
CCL23-201ENST00000612516 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
CCL23-201ENST00000612516 ADGBQ8N7X0 1667 aa9.41□□□□□ -0.9
CCL23-201ENST00000612516 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa9.4□□□□□ -0.9
CCL23-201ENST00000612516 LMTK3Q96Q04 1460 aa9.4□□□□□ -0.91
CCL23-201ENST00000612516 ZMYM3Q14202 1370 aa9.39□□□□□ -0.91
CCL23-201ENST00000612516 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa9.39□□□□□ -0.91
CCL23-201ENST00000612516 ARHGEF5Q12774 1597 aa9.39□□□□□ -0.91
CCL23-201ENST00000612516 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CCL23-201ENST00000612516 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CCL23-201ENST00000612516 DMRT2Q9Y5R5 561 aa9.38□□□□□ -0.91
CCL23-201ENST00000612516 C3P01024 1663 aa9.37□□□□□ -0.91
CCL23-201ENST00000612516 PREX1Q8TCU6 1659 aa9.37□□□□□ -0.91
CCL23-201ENST00000612516 PLXNC1O60486 1568 aa9.37□□□□□ -0.91
CCL23-201ENST00000612516 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa9.36□□□□□ -0.91
CCL23-201ENST00000612516 CHIC2Q9UKJ5 165 aa9.36□□□□□ -0.91
CCL23-201ENST00000612516 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
CCL23-201ENST00000612516 PTPN23Q9H3S7 1636 aa9.35□□□□□ -0.91
CCL23-201ENST00000612516 FGD6Q6ZV73 1430 aa9.35□□□□□ -0.91
CCL23-201ENST00000612516 MROH2AA6NES4 1674 aa9.35□□□□□ -0.91
CCL23-201ENST00000612516 NPATQ14207 1427 aa9.34□□□□□ -0.91
CCL23-201ENST00000612516 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
CCL23-201ENST00000612516 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP9.33□□□□□ -0.92
CCL23-201ENST00000612516 MAST1Q9Y2H9 1570 aa9.33□□□□□ -0.92
CCL23-201ENST00000612516 DAPK1P53355 1430 aa9.32□□□□□ -0.92
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