RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612143.1

AL139384.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AL139384.1, Length 3,047 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AL139384.1-201ENST00000612143 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
AL139384.1-201ENST00000612143 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.4■■□□□ 1.34
AL139384.1-201ENST00000612143 PLEKHG5O94827 1062 aa23.39■■□□□ 1.34
AL139384.1-201ENST00000612143 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.38■■□□□ 1.33
AL139384.1-201ENST00000612143 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
AL139384.1-201ENST00000612143 NUP160Q12769 1436 aa23.37■■□□□ 1.33
AL139384.1-201ENST00000612143 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.36■■□□□ 1.33
AL139384.1-201ENST00000612143 HECW1Q76N89 1606 aa23.34■■□□□ 1.33
AL139384.1-201ENST00000612143 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.34■■□□□ 1.33
AL139384.1-201ENST00000612143 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
AL139384.1-201ENST00000612143 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
AL139384.1-201ENST00000612143 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.29■■□□□ 1.32
AL139384.1-201ENST00000612143 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.29■■□□□ 1.32
AL139384.1-201ENST00000612143 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.28■■□□□ 1.32
AL139384.1-201ENST00000612143 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.28■■□□□ 1.32
AL139384.1-201ENST00000612143 CCER2I3L3R5 266 aa23.28■■□□□ 1.32
AL139384.1-201ENST00000612143 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
AL139384.1-201ENST00000612143 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
AL139384.1-201ENST00000612143 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.27■■□□□ 1.32
AL139384.1-201ENST00000612143 CHD1O14646 1710 aa23.26■■□□□ 1.31
AL139384.1-201ENST00000612143 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.25■■□□□ 1.31
AL139384.1-201ENST00000612143 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
AL139384.1-201ENST00000612143 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.22■■□□□ 1.31
AL139384.1-201ENST00000612143 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.22■■□□□ 1.31
AL139384.1-201ENST00000612143 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.22■■□□□ 1.31
AL139384.1-201ENST00000612143 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.22■■□□□ 1.31
AL139384.1-201ENST00000612143 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.22■■□□□ 1.31
AL139384.1-201ENST00000612143 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
AL139384.1-201ENST00000612143 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
AL139384.1-201ENST00000612143 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.2■■□□□ 1.3
AL139384.1-201ENST00000612143 MAPKBP1O60336 1514 aa23.2■■□□□ 1.3
AL139384.1-201ENST00000612143 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.18■■□□□ 1.3
AL139384.1-201ENST00000612143 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
AL139384.1-201ENST00000612143 PTPRGP23470 1445 aa23.18■■□□□ 1.3
AL139384.1-201ENST00000612143 ARHGEF11O15085 1522 aa23.17■■□□□ 1.3
AL139384.1-201ENST00000612143 ANP32CO43423 234 aa23.16■■□□□ 1.3
AL139384.1-201ENST00000612143 FOXD1Q16676 465 aa23.16■■□□□ 1.3
AL139384.1-201ENST00000612143 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
AL139384.1-201ENST00000612143 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.14■■□□□ 1.29
AL139384.1-201ENST00000612143 KIF14Q15058 1648 aa23.13■■□□□ 1.29
AL139384.1-201ENST00000612143 NAIPQ13075 1403 aa23.13■■□□□ 1.29
AL139384.1-201ENST00000612143 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
AL139384.1-201ENST00000612143 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
AL139384.1-201ENST00000612143 ATP10BO94823 1461 aa23.11■■□□□ 1.29
AL139384.1-201ENST00000612143 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.29
AL139384.1-201ENST00000612143 ZMYND15Q9H091 742 aa23.09■■□□□ 1.29
AL139384.1-201ENST00000612143 NEFMP07197 916 aa23.09■■□□□ 1.29
AL139384.1-201ENST00000612143 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
AL139384.1-201ENST00000612143 KDM6BO15054 1643 aa23.07■■□□□ 1.28
AL139384.1-201ENST00000612143 HFM1A2PYH4 1435 aa23.06■■□□□ 1.28
AL139384.1-201ENST00000612143 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.06■■□□□ 1.28
AL139384.1-201ENST00000612143 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
AL139384.1-201ENST00000612143 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
AL139384.1-201ENST00000612143 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.03■■□□□ 1.28
AL139384.1-201ENST00000612143 ABCA8O94911 1581 aa23.02■■□□□ 1.28
AL139384.1-201ENST00000612143 USP35Q9P2H5 1018 aa23.02■■□□□ 1.28
AL139384.1-201ENST00000612143 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa23.01■■□□□ 1.27
AL139384.1-201ENST00000612143 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
AL139384.1-201ENST00000612143 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
AL139384.1-201ENST00000612143 ABCC5O15440 1437 aa23■■□□□ 1.27
AL139384.1-201ENST00000612143 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
AL139384.1-201ENST00000612143 MIA2Q96PC5 1412 aa22.99■■□□□ 1.27
AL139384.1-201ENST00000612143 DAPK1P53355 1430 aa22.98■■□□□ 1.27
AL139384.1-201ENST00000612143 UACAQ9BZF9 1416 aa22.94■■□□□ 1.26
AL139384.1-201ENST00000612143 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.94■■□□□ 1.26
AL139384.1-201ENST00000612143 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.9■■□□□ 1.26
AL139384.1-201ENST00000612143 GSE1Q14687 1217 aa22.89■■□□□ 1.25
AL139384.1-201ENST00000612143 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
AL139384.1-201ENST00000612143 SHROOM2Q13796 1616 aa22.85■■□□□ 1.25
AL139384.1-201ENST00000612143 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.84■■□□□ 1.25
AL139384.1-201ENST00000612143 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
AL139384.1-201ENST00000612143 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
AL139384.1-201ENST00000612143 TONSLQ96HA7 1378 aa22.84■■□□□ 1.25
AL139384.1-201ENST00000612143 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.82■■□□□ 1.24
AL139384.1-201ENST00000612143 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
AL139384.1-201ENST00000612143 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.82■■□□□ 1.24
AL139384.1-201ENST00000612143 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.81■■□□□ 1.24
AL139384.1-201ENST00000612143 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
AL139384.1-201ENST00000612143 AKNAQ7Z591 1439 aa22.79■■□□□ 1.24
AL139384.1-201ENST00000612143 NCOA1Q15788 1441 aa22.78■■□□□ 1.24
AL139384.1-201ENST00000612143 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
AL139384.1-201ENST00000612143 TSPY4P0CV99 314 aa22.77■■□□□ 1.24
AL139384.1-201ENST00000612143 TSPY10P0CW01 314 aa22.77■■□□□ 1.24
AL139384.1-201ENST00000612143 ABCC2Q92887 1545 aa22.75■■□□□ 1.23
AL139384.1-201ENST00000612143 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.75■■□□□ 1.23
AL139384.1-201ENST00000612143 OSCARQ8IYS5 282 aa22.75■■□□□ 1.23
AL139384.1-201ENST00000612143 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.74■■□□□ 1.23
AL139384.1-201ENST00000612143 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.74■■□□□ 1.23
AL139384.1-201ENST00000612143 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.72■■□□□ 1.23
AL139384.1-201ENST00000612143 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
AL139384.1-201ENST00000612143 ROCK1Q13464 1354 aa22.71■■□□□ 1.23
AL139384.1-201ENST00000612143 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.71■■□□□ 1.23
AL139384.1-201ENST00000612143 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.71■■□□□ 1.23
AL139384.1-201ENST00000612143 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.23
AL139384.1-201ENST00000612143 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.69■■□□□ 1.22
AL139384.1-201ENST00000612143 PKD2Q13563 968 aa22.69■■□□□ 1.22
AL139384.1-201ENST00000612143 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.68■■□□□ 1.22
AL139384.1-201ENST00000612143 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.67■■□□□ 1.22
AL139384.1-201ENST00000612143 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
AL139384.1-201ENST00000612143 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms