RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599491.5

LINC00854-211, Long intergenic non-protein coding RNA 854, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00854, Length 655 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00854-211ENST00000599491 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
LINC00854-211ENST00000599491 SPDYE2Q495Y8 402 aa7.53□□□□□ -1.2
LINC00854-211ENST00000599491 TNIKQ9UKE5 1360 aa7.53□□□□□ -1.2
LINC00854-211ENST00000599491 EFCAB5A4FU69 1503 aa7.52□□□□□ -1.2
LINC00854-211ENST00000599491 KIAA0556O60303 1618 aa7.52□□□□□ -1.2
LINC00854-211ENST00000599491 SAMD9Q5K651 1589 aa7.52□□□□□ -1.21
LINC00854-211ENST00000599491 ERCC6L2Q5T890 1561 aa7.52□□□□□ -1.21
LINC00854-211ENST00000599491 ARAP1Q96P48 1450 aa7.52□□□□□ -1.21
LINC00854-211ENST00000599491 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
LINC00854-211ENST00000599491 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa7.52□□□□□ -1.21
LINC00854-211ENST00000599491 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
LINC00854-211ENST00000599491 NEUROD1Q13562 356 aa7.5□□□□□ -1.21
LINC00854-211ENST00000599491 ANP32EQ9BTT0 268 aa7.5□□□□□ -1.21
LINC00854-211ENST00000599491 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.49□□□□□ -1.21
LINC00854-211ENST00000599491 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
LINC00854-211ENST00000599491 PTPRGP23470 1445 aa7.49□□□□□ -1.21
LINC00854-211ENST00000599491 CLSPNQ9HAW4 1339 aa7.49□□□□□ -1.21
LINC00854-211ENST00000599491 CYB5RLQ6IPT4 315 aa7.48□□□□□ -1.21
LINC00854-211ENST00000599491 EHMT2Q96KQ7 1210 aa7.48□□□□□ -1.21
LINC00854-211ENST00000599491 CLIP1P30622 1438 aa7.46□□□□□ -1.21
LINC00854-211ENST00000599491 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
LINC00854-211ENST00000599491 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00854-211ENST00000599491 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00854-211ENST00000599491 UACAQ9BZF9 1416 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00854-211ENST00000599491 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00854-211ENST00000599491 CEP162Q5TB80 1403 aa7.44□□□□□ -1.22
LINC00854-211ENST00000599491 FMN1Q68DA7 1419 aa7.44□□□□□ -1.22
LINC00854-211ENST00000599491 ABCC2Q92887 1545 aa7.44□□□□□ -1.22
LINC00854-211ENST00000599491 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
LINC00854-211ENST00000599491 MMRN1Q13201 1228 aa7.44□□□□□ -1.22
LINC00854-211ENST00000599491 FHOD3Q2V2M9 1422 aa7.44□□□□□ -1.22
LINC00854-211ENST00000599491 ABCA8O94911 1581 aa7.43□□□□□ -1.22
LINC00854-211ENST00000599491 ADCY10Q96PN6 1610 aa7.43□□□□□ -1.22
LINC00854-211ENST00000599491 P3H3Q8IVL6 736 aa7.43□□□□□ -1.22
LINC00854-211ENST00000599491 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP7.42□□□□□ -1.22
LINC00854-211ENST00000599491 SSUH2Q9Y2M2 353 aa7.42□□□□□ -1.22
LINC00854-211ENST00000599491 PLB1Q6P1J6 1458 aa7.42□□□□□ -1.22
LINC00854-211ENST00000599491 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00854-211ENST00000599491 KDM5BQ9UGL1 1544 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00854-211ENST00000599491 MAPKBP1O60336 1514 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00854-211ENST00000599491 HECW1Q76N89 1606 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00854-211ENST00000599491 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00854-211ENST00000599491 PRR29P0C7W0 189 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00854-211ENST00000599491 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC00854-211ENST00000599491 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC00854-211ENST00000599491 FYCO1Q9BQS8 1478 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00854-211ENST00000599491 SLC24A1O60721 1099 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00854-211ENST00000599491 FOXD4L1Q9NU39 408 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00854-211ENST00000599491 SPNS2Q8IVW8 549 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00854-211ENST00000599491 ZRANB1Q9UGI0 708 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00854-211ENST00000599491 ATP10BO94823 1461 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00854-211ENST00000599491 CCDC18Q5T9S5 1454 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00854-211ENST00000599491 VPS8Q8N3P4 1428 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00854-211ENST00000599491 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00854-211ENST00000599491 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00854-211ENST00000599491 METRNQ9UJH8 293 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00854-211ENST00000599491 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00854-211ENST00000599491 WDR7Q9Y4E6 1490 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00854-211ENST00000599491 ASXL2Q76L83 1435 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00854-211ENST00000599491 ZBTB22O15209 634 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00854-211ENST00000599491 ABCC10Q5T3U5 1492 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00854-211ENST00000599491 PLEKHD1A6NEE1 506 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00854-211ENST00000599491 MAMSTRQ6ZN01 415 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00854-211ENST00000599491 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
LINC00854-211ENST00000599491 GLI2P10070 1586 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00854-211ENST00000599491 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00854-211ENST00000599491 DIP2BQ9P265 1576 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00854-211ENST00000599491 MAP3K1Q13233 1512 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00854-211ENST00000599491 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00854-211ENST00000599491 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00854-211ENST00000599491 KIF13AQ9H1H9 1805 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00854-211ENST00000599491 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00854-211ENST00000599491 ARID3CA6NKF2 412 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00854-211ENST00000599491 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00854-211ENST00000599491 CFAP43Q8NDM7 1665 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00854-211ENST00000599491 FAM69CQ0P6D2 419 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00854-211ENST00000599491 TIAM1Q13009 1591 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00854-211ENST00000599491 KIF14Q15058 1648 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00854-211ENST00000599491 ABCA9Q8IUA7 1624 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00854-211ENST00000599491 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00854-211ENST00000599491 KCNH8Q96L42 1107 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00854-211ENST00000599491 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00854-211ENST00000599491 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LINC00854-211ENST00000599491 MTUS2Q5JR59 1369 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00854-211ENST00000599491 TEX14Q8IWB6 1497 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00854-211ENST00000599491 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
LINC00854-211ENST00000599491 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
LINC00854-211ENST00000599491 PHF12Q96QT6 1004 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00854-211ENST00000599491 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00854-211ENST00000599491 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
LINC00854-211ENST00000599491 CD109Q6YHK3 1445 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00854-211ENST00000599491 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00854-211ENST00000599491 PHLDB1Q86UU1 1377 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00854-211ENST00000599491 ATXN8OSP0DMR3 200 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00854-211ENST00000599491 C7P10643 843 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00854-211ENST00000599491 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00854-211ENST00000599491 ARAP3Q8WWN8 1544 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00854-211ENST00000599491 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LINC00854-211ENST00000599491 TSPOAP1O95153 1857 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00854-211ENST00000599491 SLC39A7Q92504 469 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms