RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
HERC3-212ENST00000597259 ERBB3P21860 1342 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-212ENST00000597259 FBXO22Q8NEZ5 403 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-212ENST00000597259 RIMBP2O15034 1052 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-212ENST00000597259 STK24Q9Y6E0 443 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-212ENST00000597259 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HERC3-212ENST00000597259 NLRP6P59044 892 aa11.6□□□□□ -0.55
HERC3-212ENST00000597259 MFRPQ9BY79 579 aa11.59□□□□□ -0.55
HERC3-212ENST00000597259 GPR153Q6NV75 609 aa11.58□□□□□ -0.56
HERC3-212ENST00000597259 STK25O00506 426 aa11.57□□□□□ -0.56
HERC3-212ENST00000597259 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
HERC3-212ENST00000597259 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa11.56□□□□□ -0.56
HERC3-212ENST00000597259 TAOK2Q9UL54 1235 aa11.55□□□□□ -0.56
HERC3-212ENST00000597259 RGL2O15211 777 aa11.53□□□□□ -0.56
HERC3-212ENST00000597259 PKD2Q13563 968 aa11.53□□□□□ -0.56
HERC3-212ENST00000597259 ARSIQ5FYB1 569 aa11.53□□□□□ -0.56
HERC3-212ENST00000597259 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP11.53□□□□□ -0.56
HERC3-212ENST00000597259 ZNF687Q8N1G0 1237 aa11.48□□□□□ -0.57
HERC3-212ENST00000597259 C2orf72A6NCS6 295 aa11.47□□□□□ -0.57
HERC3-212ENST00000597259 KIF3CO14782 793 aa11.47□□□□□ -0.57
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HERC3-212ENST00000597259 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
HERC3-212ENST00000597259 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa11.41□□□□□ -0.58
HERC3-212ENST00000597259 PPP1R37O75864 691 aa11.4□□□□□ -0.58
HERC3-212ENST00000597259 NUDT7P0C024 238 aa11.39□□□□□ -0.59
HERC3-212ENST00000597259 MYT1LQ9UL68 1186 aa11.39□□□□□ -0.59
HERC3-212ENST00000597259 NACADO15069 1562 aa11.37□□□□□ -0.59
HERC3-212ENST00000597259 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa11.35□□□□□ -0.59
HERC3-212ENST00000597259 TMC2Q8TDI7 906 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-212ENST00000597259 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-212ENST00000597259 LHX6Q9UPM6 363 aa11.33□□□□□ -0.6
HERC3-212ENST00000597259 SLC34A2O95436 690 aa11.31□□□□□ -0.6
HERC3-212ENST00000597259 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP11.31□□□□□ -0.6
HERC3-212ENST00000597259 UNC13AQ9UPW8 1703 aa11.31□□□□□ -0.6
HERC3-212ENST00000597259 POTEEQ6S8J3 1075 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-212ENST00000597259 AXIN2Q9Y2T1 843 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-212ENST00000597259 MYO15BQ96JP2 1530 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-212ENST00000597259 PTGER2P43116 358 aa11.26□□□□□ -0.61
HERC3-212ENST00000597259 HS6ST3Q8IZP7 471 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-212ENST00000597259 PBX2P40425 430 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-212ENST00000597259 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
HERC3-212ENST00000597259 BICRAQ9NZM4 1560 aa11.21□□□□□ -0.61
HERC3-212ENST00000597259 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa11.2□□□□□ -0.62
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HERC3-212ENST00000597259 CHGAP10645 457 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
HERC3-212ENST00000597259 FOXK1P85037 733 aa11.19□□□□□ -0.62
HERC3-212ENST00000597259 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
HERC3-212ENST00000597259 DCAF8L2P0C7V8 631 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-212ENST00000597259 DSG2Q14126 1118 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-212ENST00000597259 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
HERC3-212ENST00000597259 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa11.16□□□□□ -0.62
HERC3-212ENST00000597259 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
HERC3-212ENST00000597259 ARHGAP33O14559 1287 aa11.13□□□□□ -0.63
HERC3-212ENST00000597259 ADGRD1Q6QNK2 874 aa11.13□□□□□ -0.63
HERC3-212ENST00000597259 PSEN2P49810 448 aa11.12□□□□□ -0.63
HERC3-212ENST00000597259 DMRTA1Q5VZB9 504 aa11.12□□□□□ -0.63
HERC3-212ENST00000597259 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
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HERC3-212ENST00000597259 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-212ENST00000597259 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-212ENST00000597259 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP11.06□□□□□ -0.64
HERC3-212ENST00000597259 TBC1D12O60347 775 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-212ENST00000597259 HRO43593 1189 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-212ENST00000597259 OXER1Q8TDS5 423 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-212ENST00000597259 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-212ENST00000597259 TK2O00142 265 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-212ENST00000597259 KCNK17Q96T54 332 aa11.02□□□□□ -0.65
HERC3-212ENST00000597259 HCSTQ9UBK5 93 aa11.01□□□□□ -0.65
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HERC3-212ENST00000597259 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa11□□□□□ -0.65
HERC3-212ENST00000597259 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa11□□□□□ -0.65
HERC3-212ENST00000597259 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
HERC3-212ENST00000597259 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa10.99□□□□□ -0.65
HERC3-212ENST00000597259 ZNF454Q8N9F8 522 aa10.97□□□□□ -0.65
HERC3-212ENST00000597259 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
HERC3-212ENST00000597259 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
HERC3-212ENST00000597259 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-212ENST00000597259 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
HERC3-212ENST00000597259 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-212ENST00000597259 FOSBP53539 338 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-212ENST00000597259 KCNH8Q96L42 1107 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-212ENST00000597259 BCL2L12Q9HB09 334 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-212ENST00000597259 PDE4AP27815 886 aa10.91□□□□□ -0.66
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HERC3-212ENST00000597259 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
HERC3-212ENST00000597259 EVI5O60447 810 aa10.88□□□□□ -0.67
HERC3-212ENST00000597259 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
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HERC3-212ENST00000597259 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
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HERC3-212ENST00000597259 PTPN5P54829 565 aa10.85□□□□□ -0.67
HERC3-212ENST00000597259 JPH4Q96JJ6 628 aa10.85□□□□□ -0.67
HERC3-212ENST00000597259 ADAM33Q9BZ11 813 aa10.85□□□□□ -0.67
HERC3-212ENST00000597259 ZBED2Q9BTP6 218 aa10.84□□□□□ -0.67
HERC3-212ENST00000597259 SLC4A5Q9BY07 1137 aa10.84□□□□□ -0.67
HERC3-212ENST00000597259 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
HERC3-212ENST00000597259 MFSD10Q14728 455 aa10.83□□□□□ -0.68
HERC3-212ENST00000597259 EMILIN3Q9NT22 766 aa10.83□□□□□ -0.68
HERC3-212ENST00000597259 CADPS2Q86UW7 1296 aa10.82□□□□□ -0.68
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