RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593438.1

HOXA-AS2-211, HOXA cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXA-AS2, Length 629 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXA-AS2-211ENST00000593438 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RAPGEF3O95398 923 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PREX2Q70Z35 1606 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NCOA2Q15596 1464 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ADGRL1O94910 1474 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA-AS2-211ENST00000593438 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
HOXA-AS2-211ENST00000593438 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXA-AS2-211ENST00000593438 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
HOXA-AS2-211ENST00000593438 AFAP1Q8N556 730 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXA-AS2-211ENST00000593438 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RICTORQ6R327 1708 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ABCC1P33527 1531 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23■■□□□ 1.27
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SYCP2Q9BX26 1530 aa23■■□□□ 1.27
HOXA-AS2-211ENST00000593438 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MIA2Q96PC5 1412 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXA-AS2-211ENST00000593438 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXA-AS2-211ENST00000593438 KDM5CP41229 1560 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MBD5Q9P267 1494 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA-AS2-211ENST00000593438 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA-AS2-211ENST00000593438 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA-AS2-211ENST00000593438 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TSPY4P0CV99 314 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TSPY10P0CW01 314 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ATP10AO60312 1499 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA-AS2-211ENST00000593438 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ATP7AQ04656 1500 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
HOXA-AS2-211ENST00000593438 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXA-AS2-211ENST00000593438 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ABCA6Q8N139 1617 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXA-AS2-211ENST00000593438 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXA-AS2-211ENST00000593438 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MLECQ14165 292 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ABCC5O15440 1437 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXA-AS2-211ENST00000593438 DAPK1P53355 1430 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXA-AS2-211ENST00000593438 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ITGAEP38570 1179 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXA-AS2-211ENST00000593438 A2MP01023 1474 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXA-AS2-211ENST00000593438 REREQ9P2R6 1566 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXA-AS2-211ENST00000593438 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXA-AS2-211ENST00000593438 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXA-AS2-211ENST00000593438 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
HOXA-AS2-211ENST00000593438 AGLP35573 1532 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXA-AS2-211ENST00000593438 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXA-AS2-211ENST00000593438 KIF3BO15066 747 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PLXNC1O60486 1568 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXA-AS2-211ENST00000593438 GGT6Q6P531 493 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
HOXA-AS2-211ENST00000593438 KIF15Q9NS87 1388 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MADDQ8WXG6 1647 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PTPRKQ15262 1439 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NCOA1Q15788 1441 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXA-AS2-211ENST00000593438 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXA-AS2-211ENST00000593438 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ADGRL2O95490 1459 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PTPRMP28827 1452 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ROCK1Q13464 1354 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ERBINQ96RT1 1412 aa22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms