RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590198.1

ROGDI-212, Transcript of rogdi homolog, humanhuman

TSL 3

Gene ROGDI, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROGDI-212ENST00000590198 CCNB3Q8WWL7 1395 aa48.16■■■■■ 5.3
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ROGDI-212ENST00000590198 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa48.13■■■■■ 5.3
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ROGDI-212ENST00000590198 ADGRL1O94910 1474 aa48.1■■■■■ 5.29
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ROGDI-212ENST00000590198 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa47.82■■■■■ 5.25
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ROGDI-212ENST00000590198 ARHGEF5Q12774 1597 aa47.36■■■■■ 5.17
ROGDI-212ENST00000590198 ATP7AQ04656 1500 aa47.35■■■■■ 5.17
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ROGDI-212ENST00000590198 BCORL1Q5H9F3 1711 aa47.18■■■■■ 5.14
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ROGDI-212ENST00000590198 A2MP01023 1474 aa47.13■■■■■ 5.13
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ROGDI-212ENST00000590198 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP46.83■■■■■ 5.09
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ROGDI-212ENST00000590198 CNTLNQ9NXG0 1405 aa46.65■■■■■ 5.06
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