RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 WIZO95785 1651 aa13.6□□□□□ -0.23
EFTUD2-216ENST00000590105 RGL2O15211 777 aa13.6□□□□□ -0.23
EFTUD2-216ENST00000590105 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
EFTUD2-216ENST00000590105 OCEL1Q9H607 264 aa13.58□□□□□ -0.24
EFTUD2-216ENST00000590105 PSEN1P49768 467 aa13.56□□□□□ -0.24
EFTUD2-216ENST00000590105 PLSCR2Q9NRY7 297 aa13.56□□□□□ -0.24
EFTUD2-216ENST00000590105 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
EFTUD2-216ENST00000590105 SLAIN1Q8ND83 568 aa13.54□□□□□ -0.24
EFTUD2-216ENST00000590105 NESP48681 1621 aa13.53□□□□□ -0.24
EFTUD2-216ENST00000590105 CADPSQ9ULU8 1353 aa13.52□□□□□ -0.25
EFTUD2-216ENST00000590105 ERCC6Q03468 1493 aa13.51□□□□□ -0.25
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM132AQ24JP5 1023 aa13.5□□□□□ -0.25
EFTUD2-216ENST00000590105 CHGAP10645 457 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
EFTUD2-216ENST00000590105 PDS5BQ9NTI5 1447 aa13.47□□□□□ -0.25
EFTUD2-216ENST00000590105 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
EFTUD2-216ENST00000590105 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa13.45□□□□□ -0.26
EFTUD2-216ENST00000590105 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
EFTUD2-216ENST00000590105 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
EFTUD2-216ENST00000590105 GOLGA2Q08379 1002 aa13.43□□□□□ -0.26
EFTUD2-216ENST00000590105 DPY19L2Q6NUT2 758 aa13.43□□□□□ -0.26
EFTUD2-216ENST00000590105 CABP2Q9NPB3 220 aa13.42□□□□□ -0.26
EFTUD2-216ENST00000590105 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP13.42□□□□□ -0.26
EFTUD2-216ENST00000590105 ST18O60284 1047 aa13.41□□□□□ -0.26
EFTUD2-216ENST00000590105 HOMEZQ8IX15 550 aa13.41□□□□□ -0.26
EFTUD2-216ENST00000590105 TRIM41Q8WV44 630 aa13.41□□□□□ -0.26
EFTUD2-216ENST00000590105 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
EFTUD2-216ENST00000590105 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC88BA6NC98 1476 aa13.38□□□□□ -0.27
EFTUD2-216ENST00000590105 HS6ST3Q8IZP7 471 aa13.38□□□□□ -0.27
EFTUD2-216ENST00000590105 CUX2O14529 1486 aa13.37□□□□□ -0.27
EFTUD2-216ENST00000590105 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
EFTUD2-216ENST00000590105 CFTRP13569 1480 aa13.36□□□□□ -0.27
EFTUD2-216ENST00000590105 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
EFTUD2-216ENST00000590105 EFCAB3Q8N7B9 438 aa13.29□□□□□ -0.28
EFTUD2-216ENST00000590105 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
EFTUD2-216ENST00000590105 PCDH10Q9P2E7 1040 aa13.29□□□□□ -0.28
EFTUD2-216ENST00000590105 FANCD2Q9BXW9 1451 aa13.29□□□□□ -0.28
EFTUD2-216ENST00000590105 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa13.28□□□□□ -0.28
EFTUD2-216ENST00000590105 C3orf67Q6ZVT6 689 aa13.27□□□□□ -0.29
EFTUD2-216ENST00000590105 C14orf37Q86TY3 774 aa13.26□□□□□ -0.29
EFTUD2-216ENST00000590105 CEP164Q9UPV0 1460 aa13.26□□□□□ -0.29
EFTUD2-216ENST00000590105 MRC2Q9UBG0 1479 aa13.25□□□□□ -0.29
EFTUD2-216ENST00000590105 CDAN1Q8IWY9 1227 aa13.25□□□□□ -0.29
EFTUD2-216ENST00000590105 MARVELD3Q96A59 401 aa13.23□□□□□ -0.29
EFTUD2-216ENST00000590105 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
EFTUD2-216ENST00000590105 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
EFTUD2-216ENST00000590105 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
EFTUD2-216ENST00000590105 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
EFTUD2-216ENST00000590105 BOLA1Q9Y3E2 137 aa13.21□□□□□ -0.29
EFTUD2-216ENST00000590105 SNPHO15079 494 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-216ENST00000590105 WDR62O43379 1518 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-216ENST00000590105 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-216ENST00000590105 MS4A4AQ96JQ5 239 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-216ENST00000590105 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-216ENST00000590105 ABCC8Q09428 1581 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-216ENST00000590105 VGFO15240 615 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-216ENST00000590105 PHF8Q9UPP1 1060 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-216ENST00000590105 POTEB3A0JP26 581 aa13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-216ENST00000590105 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-216ENST00000590105 POTEBQ6S5H4 581 aa13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-216ENST00000590105 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM92Q6UXU6 159 aa13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-216ENST00000590105 PRDM2Q13029 1718 aa13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-216ENST00000590105 G3V3G9 751 aa13.07□□□□□ -0.32
EFTUD2-216ENST00000590105 P3H3Q8IVL6 736 aa13.07□□□□□ -0.32
EFTUD2-216ENST00000590105 MICALL2Q8IY33 904 aa13.07□□□□□ -0.32
EFTUD2-216ENST00000590105 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
EFTUD2-216ENST00000590105 TOPBP1Q92547 1522 aa13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-216ENST00000590105 SOX12O15370 315 aa13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-216ENST00000590105 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
EFTUD2-216ENST00000590105 EMP3P54852 163 aa13.03□□□□□ -0.32
EFTUD2-216ENST00000590105 IFT140Q96RY7 1462 aa13.02□□□□□ -0.33
EFTUD2-216ENST00000590105 DNMBPQ6XZF7 1577 aa13□□□□□ -0.33
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM205CA6NFA0 338 aa13□□□□□ -0.33
EFTUD2-216ENST00000590105 FBXO22Q8NEZ5 403 aa13□□□□□ -0.33
EFTUD2-216ENST00000590105 SOGA1O94964 1423 aa12.99□□□□□ -0.33
EFTUD2-216ENST00000590105 HS3ST6Q96QI5 342 aa12.99□□□□□ -0.33
EFTUD2-216ENST00000590105 STK24Q9Y6E0 443 aa12.99□□□□□ -0.33
EFTUD2-216ENST00000590105 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP12.97□□□□□ -0.33
EFTUD2-216ENST00000590105 MFRPQ9BY79 579 aa12.97□□□□□ -0.33
EFTUD2-216ENST00000590105 SPNS2Q8IVW8 549 aa12.95□□□□□ -0.34
EFTUD2-216ENST00000590105 STK25O00506 426 aa12.94□□□□□ -0.34
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa12.94□□□□□ -0.34
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa12.94□□□□□ -0.34
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
EFTUD2-216ENST00000590105 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
EFTUD2-216ENST00000590105 LMOD2Q6P5Q4 547 aa12.93□□□□□ -0.34
EFTUD2-216ENST00000590105 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-216ENST00000590105 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-216ENST00000590105 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-216ENST00000590105 NLRP6P59044 892 aa12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-216ENST00000590105 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-216ENST00000590105 CUX1P39880 1505 aa12.91□□□□□ -0.34
EFTUD2-216ENST00000590105 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
EFTUD2-216ENST00000590105 FGD5Q6ZNL6 1462 aa12.9□□□□□ -0.34
EFTUD2-216ENST00000590105 MMRN1Q13201 1228 aa12.89□□□□□ -0.35
EFTUD2-216ENST00000590105 DOK7Q18PE1 504 aa12.89□□□□□ -0.35
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF710Q8N1W2 664 aa12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms