RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587769.1

CTIF-204, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 547 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-204ENST00000587769 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
CTIF-204ENST00000587769 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-204ENST00000587769 CFAP74Q9C0B2 1584 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-204ENST00000587769 FANCAO15360 1455 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-204ENST00000587769 NCOA2Q15596 1464 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-204ENST00000587769 PLCH2O75038 1416 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-204ENST00000587769 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CTIF-204ENST00000587769 PREX2Q70Z35 1606 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-204ENST00000587769 ITSN2Q9NZM3 1697 aa16.86■□□□□ 0.29
CTIF-204ENST00000587769 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa16.85■□□□□ 0.29
CTIF-204ENST00000587769 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa16.85■□□□□ 0.29
CTIF-204ENST00000587769 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa16.85■□□□□ 0.29
CTIF-204ENST00000587769 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.85■□□□□ 0.29
CTIF-204ENST00000587769 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
CTIF-204ENST00000587769 SCAPERQ9BY12 1400 aa16.82■□□□□ 0.28
CTIF-204ENST00000587769 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.81■□□□□ 0.28
CTIF-204ENST00000587769 MYOM3Q5VTT5 1437 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-204ENST00000587769 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
CTIF-204ENST00000587769 ADAMTSL3P82987 1691 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-204ENST00000587769 BCORL1Q5H9F3 1711 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-204ENST00000587769 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-204ENST00000587769 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-204ENST00000587769 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
CTIF-204ENST00000587769 POGZQ7Z3K3 1410 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-204ENST00000587769 YEATS2Q9ULM3 1422 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-204ENST00000587769 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-204ENST00000587769 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-204ENST00000587769 MAGI2Q86UL8 1455 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-204ENST00000587769 MIA2Q96PC5 1412 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-204ENST00000587769 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-204ENST00000587769 FGD6Q6ZV73 1430 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-204ENST00000587769 AFAP1Q8N556 730 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-204ENST00000587769 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CTIF-204ENST00000587769 ABCC1P33527 1531 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-204ENST00000587769 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-204ENST00000587769 MADDQ8WXG6 1647 aa16.71■□□□□ 0.27
CTIF-204ENST00000587769 PTPN23Q9H3S7 1636 aa16.71■□□□□ 0.27
CTIF-204ENST00000587769 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa16.71■□□□□ 0.27
CTIF-204ENST00000587769 SYCP2Q9BX26 1530 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-204ENST00000587769 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-204ENST00000587769 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
CTIF-204ENST00000587769 PTPRMP28827 1452 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-204ENST00000587769 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
CTIF-204ENST00000587769 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-204ENST00000587769 KDM5CP41229 1560 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-204ENST00000587769 ATP10AO60312 1499 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-204ENST00000587769 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
CTIF-204ENST00000587769 HECW2Q9P2P5 1572 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-204ENST00000587769 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-204ENST00000587769 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-204ENST00000587769 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
CTIF-204ENST00000587769 MYT1LQ9UL68 1186 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-204ENST00000587769 MLECQ14165 292 aa16.65■□□□□ 0.26
CTIF-204ENST00000587769 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
CTIF-204ENST00000587769 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa16.64■□□□□ 0.25
CTIF-204ENST00000587769 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16.64■□□□□ 0.25
CTIF-204ENST00000587769 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa16.64■□□□□ 0.25
CTIF-204ENST00000587769 ARHGEF5Q12774 1597 aa16.64■□□□□ 0.25
CTIF-204ENST00000587769 MLH3Q9UHC1 1453 aa16.63■□□□□ 0.25
CTIF-204ENST00000587769 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP16.63■□□□□ 0.251e-6■■■□□ 19.1
CTIF-204ENST00000587769 CCDC141Q6ZP82 1450 aa16.62■□□□□ 0.25
CTIF-204ENST00000587769 MBD5Q9P267 1494 aa16.62■□□□□ 0.25
CTIF-204ENST00000587769 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa16.62■□□□□ 0.25
CTIF-204ENST00000587769 ABCA6Q8N139 1617 aa16.62■□□□□ 0.25
CTIF-204ENST00000587769 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
CTIF-204ENST00000587769 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP16.6■□□□□ 0.25
CTIF-204ENST00000587769 CROCC2H7BZ55 1655 aa16.59■□□□□ 0.25
CTIF-204ENST00000587769 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
CTIF-204ENST00000587769 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
CTIF-204ENST00000587769 PLPPR3Q6T4P5 718 aa16.58■□□□□ 0.24
CTIF-204ENST00000587769 REREQ9P2R6 1566 aa16.57■□□□□ 0.24
CTIF-204ENST00000587769 SHANK2Q9UPX8 1470 aa16.57■□□□□ 0.24
CTIF-204ENST00000587769 DAPK1P53355 1430 aa16.57■□□□□ 0.24
CTIF-204ENST00000587769 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CTIF-204ENST00000587769 ABCC5O15440 1437 aa16.55■□□□□ 0.24
CTIF-204ENST00000587769 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
CTIF-204ENST00000587769 MAST1Q9Y2H9 1570 aa16.55■□□□□ 0.24
CTIF-204ENST00000587769 RSPH4AQ5TD94 716 aa16.54■□□□□ 0.24
CTIF-204ENST00000587769 AGLP35573 1532 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-204ENST00000587769 ATP7AQ04656 1500 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-204ENST00000587769 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
CTIF-204ENST00000587769 ADGBQ8N7X0 1667 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-204ENST00000587769 LMTK3Q96Q04 1460 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-204ENST00000587769 PLXNC1O60486 1568 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-204ENST00000587769 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa16.49■□□□□ 0.23
CTIF-204ENST00000587769 TSPY4P0CV99 314 aa16.48■□□□□ 0.23
CTIF-204ENST00000587769 TSPY10P0CW01 314 aa16.48■□□□□ 0.23
CTIF-204ENST00000587769 C3P01024 1663 aa16.48■□□□□ 0.23
CTIF-204ENST00000587769 ADGRL2O95490 1459 aa16.48■□□□□ 0.23
CTIF-204ENST00000587769 PTPRKQ15262 1439 aa16.47■□□□□ 0.23
CTIF-204ENST00000587769 ITGAEP38570 1179 aa16.45■□□□□ 0.22
CTIF-204ENST00000587769 HSPA2P54652 639 aa16.45■□□□□ 0.22
CTIF-204ENST00000587769 PREX1Q8TCU6 1659 aa16.44■□□□□ 0.22
CTIF-204ENST00000587769 A2MP01023 1474 aa16.44■□□□□ 0.22
CTIF-204ENST00000587769 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
CTIF-204ENST00000587769 ROCK1Q13464 1354 aa16.43■□□□□ 0.22
CTIF-204ENST00000587769 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa16.43■□□□□ 0.22
CTIF-204ENST00000587769 KIF15Q9NS87 1388 aa16.42■□□□□ 0.22
CTIF-204ENST00000587769 CHIC2Q9UKJ5 165 aa16.42■□□□□ 0.22
CTIF-204ENST00000587769 NCOA1Q15788 1441 aa16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms