RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587324.1

UBXN6-204, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN6, Length 712 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-204ENST00000587324 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.44■■■□□ 2.62
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UBXN6-204ENST00000587324 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.42■■■□□ 2.62
UBXN6-204ENST00000587324 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.41■■■□□ 2.62
UBXN6-204ENST00000587324 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31.4■■■□□ 2.62
UBXN6-204ENST00000587324 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.39■■■□□ 2.61
UBXN6-204ENST00000587324 MLECQ14165 292 aa31.36■■■□□ 2.61
UBXN6-204ENST00000587324 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.34■■■□□ 2.61
UBXN6-204ENST00000587324 FMN1Q68DA7 1419 aa31.33■■■□□ 2.61
UBXN6-204ENST00000587324 ATP10AO60312 1499 aa31.33■■■□□ 2.61
UBXN6-204ENST00000587324 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.32■■■□□ 2.6
UBXN6-204ENST00000587324 KDM5CP41229 1560 aa31.3■■■□□ 2.6
UBXN6-204ENST00000587324 PREX1Q8TCU6 1659 aa31.29■■■□□ 2.6
UBXN6-204ENST00000587324 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.6
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UBXN6-204ENST00000587324 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
UBXN6-204ENST00000587324 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.24■■■□□ 2.59
UBXN6-204ENST00000587324 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.24■■■□□ 2.59
UBXN6-204ENST00000587324 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.24■■■□□ 2.59
UBXN6-204ENST00000587324 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.23■■■□□ 2.59
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UBXN6-204ENST00000587324 STRCQ7RTU9 1775 aa31.2■■■□□ 2.58
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UBXN6-204ENST00000587324 AFAP1Q8N556 730 aa31.16■■■□□ 2.58
UBXN6-204ENST00000587324 REREQ9P2R6 1566 aa31.16■■■□□ 2.58
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UBXN6-204ENST00000587324 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.13■■■□□ 2.57
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UBXN6-204ENST00000587324 CLIP1P30622 1438 aa31.12■■■□□ 2.57
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UBXN6-204ENST00000587324 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.08■■■□□ 2.57
UBXN6-204ENST00000587324 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.07■■■□□ 2.57
UBXN6-204ENST00000587324 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.06■■■□□ 2.56
UBXN6-204ENST00000587324 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.06■■■□□ 2.56
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UBXN6-204ENST00000587324 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.88■■■□□ 2.53
UBXN6-204ENST00000587324 MROH2AA6NES4 1674 aa30.85■■■□□ 2.53
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UBXN6-204ENST00000587324 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.48
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UBXN6-204ENST00000587324 CEP162Q5TB80 1403 aa30.42■■■□□ 2.46
UBXN6-204ENST00000587324 SOCS7O14512 581 aa30.42■■■□□ 2.46
UBXN6-204ENST00000587324 A2ML1A8K2U0 1454 aa30.41■■■□□ 2.46
UBXN6-204ENST00000587324 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
UBXN6-204ENST00000587324 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.4■■■□□ 2.46
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UBXN6-204ENST00000587324 NEURL4Q96JN8 1562 aa30.39■■■□□ 2.46
UBXN6-204ENST00000587324 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.36■■■□□ 2.45
UBXN6-204ENST00000587324 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
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