RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580749.1

OTOP3-202, Transcript of otopetrin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OTOP3, Length 2,516 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3-202ENST00000580749 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.2■□□□□ 0.98
OTOP3-202ENST00000580749 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.18■□□□□ 0.98
OTOP3-202ENST00000580749 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.17■□□□□ 0.98
OTOP3-202ENST00000580749 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.17■□□□□ 0.98
OTOP3-202ENST00000580749 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.16■□□□□ 0.98
OTOP3-202ENST00000580749 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.16■□□□□ 0.98
OTOP3-202ENST00000580749 GRIN2AQ12879 1464 aa21.16■□□□□ 0.98
OTOP3-202ENST00000580749 NCOA2Q15596 1464 aa21.16■□□□□ 0.98
OTOP3-202ENST00000580749 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
OTOP3-202ENST00000580749 PTPRKQ15262 1439 aa21.15■□□□□ 0.98
OTOP3-202ENST00000580749 DISP1Q96F81 1524 aa21.1■□□□□ 0.97
OTOP3-202ENST00000580749 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
OTOP3-202ENST00000580749 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
OTOP3-202ENST00000580749 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.09■□□□□ 0.97
OTOP3-202ENST00000580749 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
OTOP3-202ENST00000580749 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.09■□□□□ 0.97
OTOP3-202ENST00000580749 MAPKBP1O60336 1514 aa21.07■□□□□ 0.96
OTOP3-202ENST00000580749 CEP170Q5SW79 1584 aa21.06■□□□□ 0.96
OTOP3-202ENST00000580749 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.05■□□□□ 0.96
OTOP3-202ENST00000580749 JPH4Q96JJ6 628 aa21.05■□□□□ 0.96
OTOP3-202ENST00000580749 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.05■□□□□ 0.96
OTOP3-202ENST00000580749 FGD1P98174 961 aa21.04■□□□□ 0.96
OTOP3-202ENST00000580749 SYNJ2O15056 1496 aa21.03■□□□□ 0.96
OTOP3-202ENST00000580749 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
OTOP3-202ENST00000580749 KIAA0556O60303 1618 aa21.02■□□□□ 0.96
OTOP3-202ENST00000580749 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.02■□□□□ 0.96
OTOP3-202ENST00000580749 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
OTOP3-202ENST00000580749 HECW1Q76N89 1606 aa21.01■□□□□ 0.95
OTOP3-202ENST00000580749 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
OTOP3-202ENST00000580749 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21■□□□□ 0.95
OTOP3-202ENST00000580749 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
OTOP3-202ENST00000580749 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
OTOP3-202ENST00000580749 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
OTOP3-202ENST00000580749 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.97■□□□□ 0.95
OTOP3-202ENST00000580749 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
OTOP3-202ENST00000580749 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.95■□□□□ 0.94
OTOP3-202ENST00000580749 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
OTOP3-202ENST00000580749 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.94■□□□□ 0.94
OTOP3-202ENST00000580749 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
OTOP3-202ENST00000580749 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.91■□□□□ 0.94
OTOP3-202ENST00000580749 NAIPQ13075 1403 aa20.9■□□□□ 0.94
OTOP3-202ENST00000580749 ARHGEF11O15085 1522 aa20.9■□□□□ 0.94
OTOP3-202ENST00000580749 FOXD1Q16676 465 aa20.89■□□□□ 0.94
OTOP3-202ENST00000580749 TRIM52Q96A61 297 aa20.89■□□□□ 0.94
OTOP3-202ENST00000580749 NUP160Q12769 1436 aa20.88■□□□□ 0.93
OTOP3-202ENST00000580749 KCNH8Q96L42 1107 aa20.88■□□□□ 0.93
OTOP3-202ENST00000580749 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.88■□□□□ 0.93
OTOP3-202ENST00000580749 HFM1A2PYH4 1435 aa20.88■□□□□ 0.93
OTOP3-202ENST00000580749 IGSF3O75054 1194 aa20.87■□□□□ 0.93
OTOP3-202ENST00000580749 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.85■□□□□ 0.93
OTOP3-202ENST00000580749 KDM6BO15054 1643 aa20.83■□□□□ 0.92
OTOP3-202ENST00000580749 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.82■□□□□ 0.92
OTOP3-202ENST00000580749 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.82■□□□□ 0.92
OTOP3-202ENST00000580749 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
OTOP3-202ENST00000580749 KIF14Q15058 1648 aa20.77■□□□□ 0.92
OTOP3-202ENST00000580749 UACAQ9BZF9 1416 aa20.77■□□□□ 0.92
OTOP3-202ENST00000580749 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
OTOP3-202ENST00000580749 CCER2I3L3R5 266 aa20.75■□□□□ 0.91
OTOP3-202ENST00000580749 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
OTOP3-202ENST00000580749 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
OTOP3-202ENST00000580749 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
OTOP3-202ENST00000580749 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.73■□□□□ 0.91
OTOP3-202ENST00000580749 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.73■□□□□ 0.91
OTOP3-202ENST00000580749 ABCC5O15440 1437 aa20.73■□□□□ 0.91
OTOP3-202ENST00000580749 MIA2Q96PC5 1412 aa20.73■□□□□ 0.91
OTOP3-202ENST00000580749 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
OTOP3-202ENST00000580749 DAPK1P53355 1430 aa20.72■□□□□ 0.91
OTOP3-202ENST00000580749 TONSLQ96HA7 1378 aa20.72■□□□□ 0.91
OTOP3-202ENST00000580749 CHD1O14646 1710 aa20.72■□□□□ 0.91
OTOP3-202ENST00000580749 PTPRGP23470 1445 aa20.71■□□□□ 0.91
OTOP3-202ENST00000580749 ATP10BO94823 1461 aa20.71■□□□□ 0.91
OTOP3-202ENST00000580749 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.7■□□□□ 0.9
OTOP3-202ENST00000580749 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
OTOP3-202ENST00000580749 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
OTOP3-202ENST00000580749 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.7■□□□□ 0.9
OTOP3-202ENST00000580749 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
OTOP3-202ENST00000580749 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.65■□□□□ 0.9
OTOP3-202ENST00000580749 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.64■□□□□ 0.89
OTOP3-202ENST00000580749 ABCA8O94911 1581 aa20.63■□□□□ 0.89
OTOP3-202ENST00000580749 IL27Q8NEV9 243 aa20.63■□□□□ 0.89
OTOP3-202ENST00000580749 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.61■□□□□ 0.89
OTOP3-202ENST00000580749 NBR1Q14596 966 aa20.6■□□□□ 0.89
OTOP3-202ENST00000580749 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
OTOP3-202ENST00000580749 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.58■□□□□ 0.89
OTOP3-202ENST00000580749 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
OTOP3-202ENST00000580749 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.57■□□□□ 0.88
OTOP3-202ENST00000580749 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
OTOP3-202ENST00000580749 AKNAQ7Z591 1439 aa20.55■□□□□ 0.88
OTOP3-202ENST00000580749 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.55■□□□□ 0.88
OTOP3-202ENST00000580749 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
OTOP3-202ENST00000580749 CFAP44Q96MT7 982 aa20.54■□□□□ 0.88
OTOP3-202ENST00000580749 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
OTOP3-202ENST00000580749 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
OTOP3-202ENST00000580749 NCOA1Q15788 1441 aa20.53■□□□□ 0.88
OTOP3-202ENST00000580749 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.52■□□□□ 0.88
OTOP3-202ENST00000580749 AAMPQ13685 434 aa20.52■□□□□ 0.88
OTOP3-202ENST00000580749 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.51■□□□□ 0.87
OTOP3-202ENST00000580749 ROCK1Q13464 1354 aa20.51■□□□□ 0.87
OTOP3-202ENST00000580749 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
OTOP3-202ENST00000580749 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms