RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-208ENST00000579743 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.2■■□□□ 1.14
GGA3-208ENST00000579743 PTPRMP28827 1452 aa22.2■■□□□ 1.14
GGA3-208ENST00000579743 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.2■■□□□ 1.14
GGA3-208ENST00000579743 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.18■■□□□ 1.14
GGA3-208ENST00000579743 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.16■■□□□ 1.14
GGA3-208ENST00000579743 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.16■■□□□ 1.14
GGA3-208ENST00000579743 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.12■■□□□ 1.13
GGA3-208ENST00000579743 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.12■■□□□ 1.13
GGA3-208ENST00000579743 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.12■■□□□ 1.13
GGA3-208ENST00000579743 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
GGA3-208ENST00000579743 MADDQ8WXG6 1647 aa22.11■■□□□ 1.13
GGA3-208ENST00000579743 ATP10AO60312 1499 aa22.09■■□□□ 1.13
GGA3-208ENST00000579743 MLECQ14165 292 aa22.08■■□□□ 1.13
GGA3-208ENST00000579743 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.08■■□□□ 1.12
GGA3-208ENST00000579743 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.06■■□□□ 1.12
GGA3-208ENST00000579743 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
GGA3-208ENST00000579743 AFAP1Q8N556 730 aa22.05■■□□□ 1.12
GGA3-208ENST00000579743 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.03■■□□□ 1.12
GGA3-208ENST00000579743 PREX2Q70Z35 1606 aa22.02■■□□□ 1.11
GGA3-208ENST00000579743 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22■■□□□ 1.11
GGA3-208ENST00000579743 KDM5CP41229 1560 aa21.99■■□□□ 1.11
GGA3-208ENST00000579743 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
GGA3-208ENST00000579743 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
GGA3-208ENST00000579743 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.98■■□□□ 1.11
GGA3-208ENST00000579743 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
GGA3-208ENST00000579743 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.97■■□□□ 1.11
GGA3-208ENST00000579743 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.96■■□□□ 1.11
GGA3-208ENST00000579743 ABCC1P33527 1531 aa21.95■■□□□ 1.1
GGA3-208ENST00000579743 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
GGA3-208ENST00000579743 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.94■■□□□ 1.1
GGA3-208ENST00000579743 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.93■■□□□ 1.1
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GGA3-208ENST00000579743 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.92■■□□□ 1.1
GGA3-208ENST00000579743 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.92■■□□□ 1.1
GGA3-208ENST00000579743 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.92■■□□□ 1.1
GGA3-208ENST00000579743 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.91■■□□□ 1.1
GGA3-208ENST00000579743 REREQ9P2R6 1566 aa21.91■■□□□ 1.1
GGA3-208ENST00000579743 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.9■■□□□ 1.1
GGA3-208ENST00000579743 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.9■■□□□ 1.1
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GGA3-208ENST00000579743 CEP162Q5TB80 1403 aa21.89■■□□□ 1.09
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GGA3-208ENST00000579743 ABCA6Q8N139 1617 aa21.84■■□□□ 1.09
GGA3-208ENST00000579743 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
GGA3-208ENST00000579743 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.82■■□□□ 1.08
GGA3-208ENST00000579743 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.82■■□□□ 1.08
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GGA3-208ENST00000579743 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.8■■□□□ 1.08
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GGA3-208ENST00000579743 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.79■■□□□ 1.08
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GGA3-208ENST00000579743 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
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GGA3-208ENST00000579743 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.67■■□□□ 1.06
GGA3-208ENST00000579743 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.67■■□□□ 1.06
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GGA3-208ENST00000579743 MROH2AA6NES4 1674 aa21.64■■□□□ 1.05
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GGA3-208ENST00000579743 TSPY10P0CW01 314 aa21.63■■□□□ 1.05
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GGA3-208ENST00000579743 PTPRKQ15262 1439 aa21.49■■□□□ 1.03
GGA3-208ENST00000579743 NCOA1Q15788 1441 aa21.49■■□□□ 1.03
GGA3-208ENST00000579743 MIA2Q96PC5 1412 aa21.49■■□□□ 1.03
GGA3-208ENST00000579743 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.49■■□□□ 1.03
GGA3-208ENST00000579743 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.47■■□□□ 1.03
GGA3-208ENST00000579743 PKD2Q13563 968 aa21.47■■□□□ 1.03
GGA3-208ENST00000579743 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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