RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578431.1

EPB41L3-210, Transcript of erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3, humanhuman

TSL 2

Gene EPB41L3, Length 570 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3-210ENST00000578431 AKNAQ7Z591 1439 aa45.19■■■■■ 4.83
EPB41L3-210ENST00000578431 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP45.17■■■■■ 4.82
EPB41L3-210ENST00000578431 APLP2Q06481 763 aa45.17■■■■■ 4.82
EPB41L3-210ENST00000578431 ITSN2Q9NZM3 1697 aa45.15■■■■■ 4.82
EPB41L3-210ENST00000578431 NCOA2Q15596 1464 aa45.15■■■■■ 4.82
EPB41L3-210ENST00000578431 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa45.13■■■■■ 4.82
EPB41L3-210ENST00000578431 CCNB3Q8WWL7 1395 aa45.11■■■■■ 4.81
EPB41L3-210ENST00000578431 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP45.1■■■■■ 4.81
EPB41L3-210ENST00000578431 ADGRL1O94910 1474 aa45.08■■■■■ 4.81
EPB41L3-210ENST00000578431 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa45.06■■■■■ 4.8
EPB41L3-210ENST00000578431 RICTORQ6R327 1708 aa45.05■■■■■ 4.8
EPB41L3-210ENST00000578431 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP45.04■■■■■ 4.8
EPB41L3-210ENST00000578431 ABCC1P33527 1531 aa45.01■■■■■ 4.8
EPB41L3-210ENST00000578431 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa44.98■■■■■ 4.79
EPB41L3-210ENST00000578431 SCAPERQ9BY12 1400 aa44.96■■■■■ 4.79
EPB41L3-210ENST00000578431 POGZQ7Z3K3 1410 aa44.94■■■■■ 4.79
EPB41L3-210ENST00000578431 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa44.92■■■■■ 4.78
EPB41L3-210ENST00000578431 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP44.92■■■■■ 4.78
EPB41L3-210ENST00000578431 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa44.89■■■■■ 4.78
EPB41L3-210ENST00000578431 RAPGEF3O95398 923 aa44.88■■■■■ 4.78
EPB41L3-210ENST00000578431 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa44.86■■■■■ 4.77
EPB41L3-210ENST00000578431 KDM5CP41229 1560 aa44.84■■■■■ 4.77
EPB41L3-210ENST00000578431 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa44.84■■■■■ 4.77
EPB41L3-210ENST00000578431 MYOM3Q5VTT5 1437 aa44.84■■■■■ 4.77
EPB41L3-210ENST00000578431 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa44.84■■■■■ 4.77
EPB41L3-210ENST00000578431 SYCP2Q9BX26 1530 aa44.81■■■■■ 4.76
EPB41L3-210ENST00000578431 MIA2Q96PC5 1412 aa44.78■■■■■ 4.76
EPB41L3-210ENST00000578431 MAGI2Q86UL8 1455 aa44.78■■■■■ 4.76
EPB41L3-210ENST00000578431 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP44.77■■■■■ 4.76
EPB41L3-210ENST00000578431 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa44.74■■■■■ 4.75
EPB41L3-210ENST00000578431 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa44.74■■■■■ 4.75
EPB41L3-210ENST00000578431 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa44.73■■■■■ 4.75
EPB41L3-210ENST00000578431 HECW2Q9P2P5 1572 aa44.69■■■■■ 4.75
EPB41L3-210ENST00000578431 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa44.68■■■■■ 4.74
EPB41L3-210ENST00000578431 MBD5Q9P267 1494 aa44.66■■■■■ 4.74
EPB41L3-210ENST00000578431 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP44.66■■■■■ 4.74
EPB41L3-210ENST00000578431 MLH3Q9UHC1 1453 aa44.65■■■■■ 4.74
EPB41L3-210ENST00000578431 AFAP1Q8N556 730 aa44.63■■■■■ 4.74
EPB41L3-210ENST00000578431 ARHGEF5Q12774 1597 aa44.6■■■■■ 4.73
EPB41L3-210ENST00000578431 FGD6Q6ZV73 1430 aa44.6■■■■■ 4.73
EPB41L3-210ENST00000578431 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP44.59■■■■■ 4.73
EPB41L3-210ENST00000578431 PTPN23Q9H3S7 1636 aa44.58■■■■■ 4.73
EPB41L3-210ENST00000578431 YEATS2Q9ULM3 1422 aa44.58■■■■■ 4.73
EPB41L3-210ENST00000578431 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP44.55■■■■■ 4.72
EPB41L3-210ENST00000578431 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP44.54■■■■■ 4.72
EPB41L3-210ENST00000578431 CCDC141Q6ZP82 1450 aa44.54■■■■■ 4.72
EPB41L3-210ENST00000578431 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa44.54■■■■■ 4.72
EPB41L3-210ENST00000578431 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa44.5■■■■■ 4.71
EPB41L3-210ENST00000578431 ABCA6Q8N139 1617 aa44.5■■■■■ 4.71
EPB41L3-210ENST00000578431 RSPH4AQ5TD94 716 aa44.49■■■■■ 4.71
EPB41L3-210ENST00000578431 ATP7AQ04656 1500 aa44.48■■■■■ 4.71
EPB41L3-210ENST00000578431 REREQ9P2R6 1566 aa44.45■■■■■ 4.71
EPB41L3-210ENST00000578431 ATP10AO60312 1499 aa44.45■■■■■ 4.71
EPB41L3-210ENST00000578431 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP44.44■■■■■ 4.7
EPB41L3-210ENST00000578431 C9orf84Q5VXU9 1444 aa44.41■■■■■ 4.7
EPB41L3-210ENST00000578431 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa44.41■■■■■ 4.7
EPB41L3-210ENST00000578431 MAST1Q9Y2H9 1570 aa44.38■■■■■ 4.69
EPB41L3-210ENST00000578431 CROCC2H7BZ55 1655 aa44.37■■■■■ 4.69
EPB41L3-210ENST00000578431 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa44.36■■■■■ 4.69
EPB41L3-210ENST00000578431 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP44.35■■■■■ 4.69
EPB41L3-210ENST00000578431 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP44.35■■■■■ 4.69
EPB41L3-210ENST00000578431 MYT1LQ9UL68 1186 aa44.33■■■■■ 4.69
EPB41L3-210ENST00000578431 SHANK2Q9UPX8 1470 aa44.31■■■■■ 4.68
EPB41L3-210ENST00000578431 ADGBQ8N7X0 1667 aa44.3■■■■■ 4.68
EPB41L3-210ENST00000578431 BCORL1Q5H9F3 1711 aa44.27■■■■■ 4.68
EPB41L3-210ENST00000578431 ABCC5O15440 1437 aa44.25■■■■■ 4.67
EPB41L3-210ENST00000578431 DAPK1P53355 1430 aa44.25■■■■■ 4.67
EPB41L3-210ENST00000578431 AGLP35573 1532 aa44.25■■■■■ 4.67
EPB41L3-210ENST00000578431 PLXNC1O60486 1568 aa44.25■■■■■ 4.67
EPB41L3-210ENST00000578431 TSPY4P0CV99 314 aa44.24■■■■■ 4.67
EPB41L3-210ENST00000578431 TSPY10P0CW01 314 aa44.24■■■■■ 4.67
EPB41L3-210ENST00000578431 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP44.2■■■■■ 4.67
EPB41L3-210ENST00000578431 A2MP01023 1474 aa44.19■■■■■ 4.66
EPB41L3-210ENST00000578431 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
EPB41L3-210ENST00000578431 ADAMTSL3P82987 1691 aa44.18■■■■■ 4.66
EPB41L3-210ENST00000578431 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP44.15■■■■■ 4.66
EPB41L3-210ENST00000578431 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa44.14■■■■■ 4.66
EPB41L3-210ENST00000578431 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP44.14■■■■■ 4.66
EPB41L3-210ENST00000578431 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
EPB41L3-210ENST00000578431 ADGRL2O95490 1459 aa44.03■■■■■ 4.64
EPB41L3-210ENST00000578431 MADDQ8WXG6 1647 aa44.02■■■■■ 4.64
EPB41L3-210ENST00000578431 DUOX2Q9NRD8 1548 aa43.99■■■■■ 4.63
EPB41L3-210ENST00000578431 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa43.98■■■■■ 4.63
EPB41L3-210ENST00000578431 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP43.96■■■■■ 4.63
EPB41L3-210ENST00000578431 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa43.94■■■■■ 4.63
EPB41L3-210ENST00000578431 KIF15Q9NS87 1388 aa43.93■■■■■ 4.62
EPB41L3-210ENST00000578431 NCOA1Q15788 1441 aa43.93■■■■■ 4.62
EPB41L3-210ENST00000578431 PTPRKQ15262 1439 aa43.92■■■■■ 4.62
EPB41L3-210ENST00000578431 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP43.9■■■■■ 4.62
EPB41L3-210ENST00000578431 MLECQ14165 292 aa43.88■■■■■ 4.62
EPB41L3-210ENST00000578431 ERBINQ96RT1 1412 aa43.87■■■■■ 4.61
EPB41L3-210ENST00000578431 ROCK1Q13464 1354 aa43.85■■■■■ 4.61
EPB41L3-210ENST00000578431 CHIC2Q9UKJ5 165 aa43.85■■■■■ 4.61
EPB41L3-210ENST00000578431 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP43.84■■■■■ 4.61
EPB41L3-210ENST00000578431 PTPRMP28827 1452 aa43.83■■■■■ 4.61
EPB41L3-210ENST00000578431 FAM135AQ9P2D6 1515 aa43.8■■■■■ 4.6
EPB41L3-210ENST00000578431 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa43.8■■■■■ 4.6
EPB41L3-210ENST00000578431 CNTLNQ9NXG0 1405 aa43.76■■■■■ 4.6
EPB41L3-210ENST00000578431 MROH2AA6NES4 1674 aa43.75■■■■■ 4.59
EPB41L3-210ENST00000578431 KIF3BO15066 747 aa43.75■■■■■ 4.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms