RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576955.5

PHF23-212, Transcript of PHD finger protein 23, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PHF23, Length 1,944 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23-212ENST00000576955 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.86■■■■□ 3.33
PHF23-212ENST00000576955 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.86■■■■□ 3.33
PHF23-212ENST00000576955 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.86■■■■□ 3.33
PHF23-212ENST00000576955 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
PHF23-212ENST00000576955 DAPK1P53355 1430 aa35.85■■■■□ 3.33
PHF23-212ENST00000576955 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.85■■■■□ 3.33
PHF23-212ENST00000576955 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.84■■■■□ 3.33
PHF23-212ENST00000576955 HFM1A2PYH4 1435 aa35.83■■■■□ 3.33
PHF23-212ENST00000576955 ABCC5O15440 1437 aa35.8■■■■□ 3.32
PHF23-212ENST00000576955 ASXL2Q76L83 1435 aa35.79■■■■□ 3.32
PHF23-212ENST00000576955 AKNAQ7Z591 1439 aa35.78■■■■□ 3.32
PHF23-212ENST00000576955 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.75■■■■□ 3.31
PHF23-212ENST00000576955 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.75■■■■□ 3.31
PHF23-212ENST00000576955 NAIPQ13075 1403 aa35.74■■■■□ 3.31
PHF23-212ENST00000576955 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
PHF23-212ENST00000576955 ROCK1Q13464 1354 aa35.71■■■■□ 3.31
PHF23-212ENST00000576955 PLCH2O75038 1416 aa35.71■■■■□ 3.31
PHF23-212ENST00000576955 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.71■■■■□ 3.31
PHF23-212ENST00000576955 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.71■■■■□ 3.31
PHF23-212ENST00000576955 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.71■■■■□ 3.31
PHF23-212ENST00000576955 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.69■■■■□ 3.3
PHF23-212ENST00000576955 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.67■■■■□ 3.3
PHF23-212ENST00000576955 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.67■■■■□ 3.3
PHF23-212ENST00000576955 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.66■■■■□ 3.3
PHF23-212ENST00000576955 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.65■■■■□ 3.3
PHF23-212ENST00000576955 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.65■■■■□ 3.3
PHF23-212ENST00000576955 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.64■■■■□ 3.3
PHF23-212ENST00000576955 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.63■■■■□ 3.29
PHF23-212ENST00000576955 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.62■■■■□ 3.29
PHF23-212ENST00000576955 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.61■■■■□ 3.29
PHF23-212ENST00000576955 MBD5Q9P267 1494 aa35.61■■■■□ 3.29
PHF23-212ENST00000576955 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.6■■■■□ 3.29
PHF23-212ENST00000576955 ADGRL2O95490 1459 aa35.59■■■■□ 3.29
PHF23-212ENST00000576955 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.57■■■■□ 3.29
PHF23-212ENST00000576955 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.57■■■■□ 3.29
PHF23-212ENST00000576955 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.56■■■■□ 3.28
PHF23-212ENST00000576955 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.56■■■■□ 3.28
PHF23-212ENST00000576955 TSPY4P0CV99 314 aa35.55■■■■□ 3.28
PHF23-212ENST00000576955 TSPY10P0CW01 314 aa35.55■■■■□ 3.28
PHF23-212ENST00000576955 MAPKBP1O60336 1514 aa35.55■■■■□ 3.28
PHF23-212ENST00000576955 NCOA1Q15788 1441 aa35.53■■■■□ 3.28
PHF23-212ENST00000576955 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.53■■■■□ 3.28
PHF23-212ENST00000576955 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.52■■■■□ 3.28
PHF23-212ENST00000576955 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.49■■■■□ 3.27
PHF23-212ENST00000576955 ABCC1P33527 1531 aa35.48■■■■□ 3.27
PHF23-212ENST00000576955 KDM6BO15054 1643 aa35.46■■■■□ 3.27
PHF23-212ENST00000576955 FANCAO15360 1455 aa35.44■■■■□ 3.26
PHF23-212ENST00000576955 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.43■■■■□ 3.26
PHF23-212ENST00000576955 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.42■■■■□ 3.26
PHF23-212ENST00000576955 CD109Q6YHK3 1445 aa35.38■■■■□ 3.25
PHF23-212ENST00000576955 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.33■■■■□ 3.25
PHF23-212ENST00000576955 TRIM52Q96A61 297 aa35.33■■■■□ 3.25
PHF23-212ENST00000576955 KIF15Q9NS87 1388 aa35.31■■■■□ 3.24
PHF23-212ENST00000576955 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.31■■■■□ 3.24
PHF23-212ENST00000576955 ADGRL1O94910 1474 aa35.3■■■■□ 3.24
PHF23-212ENST00000576955 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.3■■■■□ 3.24
PHF23-212ENST00000576955 PLXNC1O60486 1568 aa35.29■■■■□ 3.24
PHF23-212ENST00000576955 GLI2P10070 1586 aa35.28■■■■□ 3.24
PHF23-212ENST00000576955 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.23■■■■□ 3.23
PHF23-212ENST00000576955 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.23■■■■□ 3.23
PHF23-212ENST00000576955 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.2■■■■□ 3.23
PHF23-212ENST00000576955 DIP2BQ9P265 1576 aa35.18■■■■□ 3.22
PHF23-212ENST00000576955 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
PHF23-212ENST00000576955 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.18■■■■□ 3.22
PHF23-212ENST00000576955 NEO1Q92859 1461 aa35.17■■■■□ 3.22
PHF23-212ENST00000576955 AFAP1Q8N556 730 aa35.17■■■■□ 3.22
PHF23-212ENST00000576955 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.15■■■■□ 3.22
PHF23-212ENST00000576955 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.14■■■■□ 3.22
PHF23-212ENST00000576955 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
PHF23-212ENST00000576955 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.11■■■■□ 3.21
PHF23-212ENST00000576955 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.11■■■■□ 3.21
PHF23-212ENST00000576955 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
PHF23-212ENST00000576955 ATP7AQ04656 1500 aa35.09■■■■□ 3.21
PHF23-212ENST00000576955 PZPP20742 1482 aa35.08■■■■□ 3.21
PHF23-212ENST00000576955 SIN3AQ96ST3 1273 aa35.08■■■■□ 3.21
PHF23-212ENST00000576955 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
PHF23-212ENST00000576955 ERBINQ96RT1 1412 aa35.07■■■■□ 3.2
PHF23-212ENST00000576955 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.06■■■■□ 3.2
PHF23-212ENST00000576955 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.04■■■■□ 3.2
PHF23-212ENST00000576955 NEUROD1Q13562 356 aa35.04■■■■□ 3.2
PHF23-212ENST00000576955 NUP155O75694 1391 aa35.03■■■■□ 3.2
PHF23-212ENST00000576955 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa35.02■■■■□ 3.2
PHF23-212ENST00000576955 KDM5CP41229 1560 aa35■■■■□ 3.19
PHF23-212ENST00000576955 UNC13BO14795 1591 aa34.99■■■■□ 3.19
PHF23-212ENST00000576955 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.98■■■■□ 3.19
PHF23-212ENST00000576955 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34.95■■■■□ 3.19
PHF23-212ENST00000576955 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.93■■■■□ 3.18
PHF23-212ENST00000576955 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.92■■■■□ 3.18
PHF23-212ENST00000576955 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.92■■■■□ 3.18
PHF23-212ENST00000576955 FOXD1Q16676 465 aa34.91■■■■□ 3.18
PHF23-212ENST00000576955 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.91■■■■□ 3.18
PHF23-212ENST00000576955 TSPOAP1O95153 1857 aa34.91■■■■□ 3.18
PHF23-212ENST00000576955 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa34.91■■■■□ 3.18
PHF23-212ENST00000576955 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
PHF23-212ENST00000576955 FAM135AQ9P2D6 1515 aa34.89■■■■□ 3.18
PHF23-212ENST00000576955 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.88■■■■□ 3.17
PHF23-212ENST00000576955 PKD2Q13563 968 aa34.88■■■■□ 3.17
PHF23-212ENST00000576955 TONSLQ96HA7 1378 aa34.87■■■■□ 3.17
PHF23-212ENST00000576955 RICTORQ6R327 1708 aa34.87■■■■□ 3.17
PHF23-212ENST00000576955 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms