RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576589.1

NOMO3-217, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 5

Gene NOMO3, Length 683 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-217ENST00000576589 SCAPERQ9BY12 1400 aa44.64■■■■■ 4.74
NOMO3-217ENST00000576589 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa44.62■■■■■ 4.73
NOMO3-217ENST00000576589 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP44.6■■■■■ 4.73
NOMO3-217ENST00000576589 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa44.57■■■■■ 4.73
NOMO3-217ENST00000576589 PREX2Q70Z35 1606 aa44.53■■■■■ 4.72
NOMO3-217ENST00000576589 ADAMTSL3P82987 1691 aa44.53■■■■■ 4.72
NOMO3-217ENST00000576589 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP44.52■■■■■ 4.72
NOMO3-217ENST00000576589 TIAM1Q13009 1591 aa44.52■■■■■ 4.72
NOMO3-217ENST00000576589 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP44.52■■■■■ 4.72
NOMO3-217ENST00000576589 CCNB3Q8WWL7 1395 aa44.52■■■■■ 4.72
NOMO3-217ENST00000576589 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa44.51■■■■■ 4.72
NOMO3-217ENST00000576589 POGZQ7Z3K3 1410 aa44.5■■■■■ 4.71
NOMO3-217ENST00000576589 RICTORQ6R327 1708 aa44.5■■■■■ 4.71
NOMO3-217ENST00000576589 PTPRMP28827 1452 aa44.49■■■■■ 4.71
NOMO3-217ENST00000576589 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa44.45■■■■■ 4.71
NOMO3-217ENST00000576589 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP44.45■■■■■ 4.71
NOMO3-217ENST00000576589 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP44.44■■■■■ 4.7
NOMO3-217ENST00000576589 BCORL1Q5H9F3 1711 aa44.41■■■■■ 4.7
NOMO3-217ENST00000576589 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa44.41■■■■■ 4.7
NOMO3-217ENST00000576589 MAP3K1Q13233 1512 aa44.4■■■■■ 4.7
NOMO3-217ENST00000576589 AFAP1Q8N556 730 aa44.4■■■■■ 4.7
NOMO3-217ENST00000576589 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa44.4■■■■■ 4.7
NOMO3-217ENST00000576589 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa44.39■■■■■ 4.7
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NOMO3-217ENST00000576589 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa44.36■■■■■ 4.69
NOMO3-217ENST00000576589 MAGI2Q86UL8 1455 aa44.36■■■■■ 4.69
NOMO3-217ENST00000576589 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP44.36■■■■■ 4.69
NOMO3-217ENST00000576589 ABCC1P33527 1531 aa44.34■■■■■ 4.69
NOMO3-217ENST00000576589 NCOA2Q15596 1464 aa44.34■■■■■ 4.69
NOMO3-217ENST00000576589 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa44.33■■■■■ 4.69
NOMO3-217ENST00000576589 YEATS2Q9ULM3 1422 aa44.33■■■■■ 4.69
NOMO3-217ENST00000576589 MADDQ8WXG6 1647 aa44.32■■■■■ 4.68
NOMO3-217ENST00000576589 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa44.31■■■■■ 4.68
NOMO3-217ENST00000576589 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa44.3■■■■■ 4.68
NOMO3-217ENST00000576589 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP44.29■■■■■ 4.68
NOMO3-217ENST00000576589 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa44.28■■■■■ 4.68
NOMO3-217ENST00000576589 MYT1LQ9UL68 1186 aa44.26■■■■■ 4.68
NOMO3-217ENST00000576589 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP44.24■■■■■ 4.67
NOMO3-217ENST00000576589 KDM5CP41229 1560 aa44.23■■■■■ 4.67
NOMO3-217ENST00000576589 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa44.22■■■■■ 4.67
NOMO3-217ENST00000576589 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa44.22■■■■■ 4.67
NOMO3-217ENST00000576589 ITSN2Q9NZM3 1697 aa44.2■■■■■ 4.67
NOMO3-217ENST00000576589 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP44.2■■■■■ 4.67
NOMO3-217ENST00000576589 SYCP2Q9BX26 1530 aa44.19■■■■■ 4.66
NOMO3-217ENST00000576589 ATP10AO60312 1499 aa44.15■■■■■ 4.66
NOMO3-217ENST00000576589 MLH3Q9UHC1 1453 aa44.15■■■■■ 4.66
NOMO3-217ENST00000576589 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP44.14■■■■■ 4.66
NOMO3-217ENST00000576589 C9orf84Q5VXU9 1444 aa44.08■■■■■ 4.65
NOMO3-217ENST00000576589 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa44.08■■■■■ 4.65
NOMO3-217ENST00000576589 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP44.06■■■■■ 4.64
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NOMO3-217ENST00000576589 LMTK3Q96Q04 1460 aa44.06■■■■■ 4.64
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NOMO3-217ENST00000576589 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa43.99■■■■■ 4.63
NOMO3-217ENST00000576589 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa43.99■■■■■ 4.63
NOMO3-217ENST00000576589 MYOM3Q5VTT5 1437 aa43.98■■■■■ 4.63
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NOMO3-217ENST00000576589 HSPA2P54652 639 aa43.88■■■■■ 4.62
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NOMO3-217ENST00000576589 MAST1Q9Y2H9 1570 aa43.51■■■■■ 4.56
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NOMO3-217ENST00000576589 SHANK2Q9UPX8 1470 aa43.42■■■■■ 4.54
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NOMO3-217ENST00000576589 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP43.4■■■■■ 4.54
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NOMO3-217ENST00000576589 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP43.36■■■■■ 4.53
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NOMO3-217ENST00000576589 CHIC2Q9UKJ5 165 aa43.34■■■■■ 4.53
NOMO3-217ENST00000576589 DMRT2Q9Y5R5 561 aa43.34■■■■■ 4.53
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