RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572932.1

NOMO3-209, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 5

Gene NOMO3, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-209ENST00000572932 ARID3CA6NKF2 412 aa13.79□□□□□ -0.2
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NOMO3-209ENST00000572932 TTC37Q6PGP7 1564 aa13.78□□□□□ -0.2
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NOMO3-209ENST00000572932 TEX14Q8IWB6 1497 aa13.53□□□□□ -0.24
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NOMO3-209ENST00000572932 TSPY10P0CW01 314 aa13.42□□□□□ -0.26
NOMO3-209ENST00000572932 KIF15Q9NS87 1388 aa13.42□□□□□ -0.26
NOMO3-209ENST00000572932 KDM6BO15054 1643 aa13.42□□□□□ -0.26
NOMO3-209ENST00000572932 ERBINQ96RT1 1412 aa13.41□□□□□ -0.26
NOMO3-209ENST00000572932 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa13.41□□□□□ -0.26
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NOMO3-209ENST00000572932 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
NOMO3-209ENST00000572932 TSPOAP1O95153 1857 aa13.4□□□□□ -0.26
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