RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570085.5

ARIH1-210, Transcript of ariadne RBR E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 3

Gene ARIH1, Length 807 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARIH1-210ENST00000570085 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa46.73■■■■■ 5.07
ARIH1-210ENST00000570085 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa46.73■■■■■ 5.07
ARIH1-210ENST00000570085 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP46.73■■■■■ 5.07
ARIH1-210ENST00000570085 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP46.71■■■■■ 5.07
ARIH1-210ENST00000570085 RICTORQ6R327 1708 aa46.71■■■■■ 5.07
ARIH1-210ENST00000570085 ADGRL1O94910 1474 aa46.7■■■■■ 5.07
ARIH1-210ENST00000570085 RAPGEF3O95398 923 aa46.69■■■■■ 5.06
ARIH1-210ENST00000570085 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP46.68■■■■■ 5.06
ARIH1-210ENST00000570085 SCAPERQ9BY12 1400 aa46.64■■■■■ 5.06
ARIH1-210ENST00000570085 CCNB3Q8WWL7 1395 aa46.64■■■■■ 5.06
ARIH1-210ENST00000570085 NCOA2Q15596 1464 aa46.61■■■■■ 5.05
ARIH1-210ENST00000570085 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP46.6■■■■■ 5.05
ARIH1-210ENST00000570085 POGZQ7Z3K3 1410 aa46.56■■■■■ 5.04
ARIH1-210ENST00000570085 ITSN2Q9NZM3 1697 aa46.55■■■■■ 5.04
ARIH1-210ENST00000570085 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa46.54■■■■■ 5.04
ARIH1-210ENST00000570085 APLP2Q06481 763 aa46.54■■■■■ 5.04
ARIH1-210ENST00000570085 ABCC1P33527 1531 aa46.54■■■■■ 5.04
ARIH1-210ENST00000570085 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa46.51■■■■■ 5.04
ARIH1-210ENST00000570085 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP46.49■■■■■ 5.03
ARIH1-210ENST00000570085 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa46.47■■■■■ 5.03
ARIH1-210ENST00000570085 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa46.44■■■■■ 5.03
ARIH1-210ENST00000570085 MAGI2Q86UL8 1455 aa46.42■■■■■ 5.02
ARIH1-210ENST00000570085 KDM5CP41229 1560 aa46.42■■■■■ 5.02
ARIH1-210ENST00000570085 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP46.4■■■■■ 5.02
ARIH1-210ENST00000570085 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa46.38■■■■■ 5.02
ARIH1-210ENST00000570085 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa46.38■■■■■ 5.02
ARIH1-210ENST00000570085 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa46.37■■■■■ 5.01
ARIH1-210ENST00000570085 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa46.37■■■■■ 5.01
ARIH1-210ENST00000570085 AFAP1Q8N556 730 aa46.35■■■■■ 5.01
ARIH1-210ENST00000570085 SYCP2Q9BX26 1530 aa46.34■■■■■ 5.01
ARIH1-210ENST00000570085 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa46.32■■■■■ 5.01
ARIH1-210ENST00000570085 YEATS2Q9ULM3 1422 aa46.28■■■■■ 5
ARIH1-210ENST00000570085 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP46.28■■■■■ 5
ARIH1-210ENST00000570085 MLH3Q9UHC1 1453 aa46.25■■■■■ 5
ARIH1-210ENST00000570085 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP46.25■■■■■ 4.997e-7■■■■■ 27.9
ARIH1-210ENST00000570085 MYOM3Q5VTT5 1437 aa46.25■■■■■ 4.99
ARIH1-210ENST00000570085 HECW2Q9P2P5 1572 aa46.25■■■■■ 4.99
ARIH1-210ENST00000570085 MBD5Q9P267 1494 aa46.21■■■■■ 4.99
ARIH1-210ENST00000570085 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa46.2■■■■■ 4.99
ARIH1-210ENST00000570085 MIA2Q96PC5 1412 aa46.2■■■■■ 4.99
ARIH1-210ENST00000570085 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa46.17■■■■■ 4.98
ARIH1-210ENST00000570085 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa46.14■■■■■ 4.98
ARIH1-210ENST00000570085 ATP10AO60312 1499 aa46.13■■■■■ 4.98
ARIH1-210ENST00000570085 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa46.1■■■■■ 4.97
ARIH1-210ENST00000570085 ABCA6Q8N139 1617 aa46.09■■■■■ 4.97
ARIH1-210ENST00000570085 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa46.08■■■■■ 4.97
ARIH1-210ENST00000570085 ARHGEF5Q12774 1597 aa46.05■■■■■ 4.96
ARIH1-210ENST00000570085 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP46.05■■■■■ 4.96
ARIH1-210ENST00000570085 C9orf84Q5VXU9 1444 aa46.05■■■■■ 4.96
ARIH1-210ENST00000570085 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP46.04■■■■■ 4.96
ARIH1-210ENST00000570085 RSPH4AQ5TD94 716 aa46.04■■■■■ 4.96
ARIH1-210ENST00000570085 REREQ9P2R6 1566 aa46.03■■■■■ 4.96
ARIH1-210ENST00000570085 CCDC141Q6ZP82 1450 aa46.01■■■■■ 4.96
ARIH1-210ENST00000570085 MYT1LQ9UL68 1186 aa46.01■■■■■ 4.96
ARIH1-210ENST00000570085 ATP7AQ04656 1500 aa46.01■■■■■ 4.96
ARIH1-210ENST00000570085 BCORL1Q5H9F3 1711 aa46■■■■■ 4.95
ARIH1-210ENST00000570085 FGD6Q6ZV73 1430 aa45.99■■■■■ 4.95
ARIH1-210ENST00000570085 PTPN23Q9H3S7 1636 aa45.97■■■■■ 4.95
ARIH1-210ENST00000570085 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa45.95■■■■■ 4.95
ARIH1-210ENST00000570085 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP45.95■■■■■ 4.95
ARIH1-210ENST00000570085 ADAMTSL3P82987 1691 aa45.95■■■■■ 4.95
ARIH1-210ENST00000570085 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
ARIH1-210ENST00000570085 AGLP35573 1532 aa45.86■■■■■ 4.93
ARIH1-210ENST00000570085 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP45.85■■■■■ 4.93
ARIH1-210ENST00000570085 MAST1Q9Y2H9 1570 aa45.82■■■■■ 4.93
ARIH1-210ENST00000570085 ADGBQ8N7X0 1667 aa45.82■■■■■ 4.92
ARIH1-210ENST00000570085 TSPY4P0CV99 314 aa45.78■■■■■ 4.92
ARIH1-210ENST00000570085 TSPY10P0CW01 314 aa45.78■■■■■ 4.92
ARIH1-210ENST00000570085 PLXNC1O60486 1568 aa45.78■■■■■ 4.92
ARIH1-210ENST00000570085 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP45.77■■■■■ 4.92
ARIH1-210ENST00000570085 A2MP01023 1474 aa45.76■■■■■ 4.92
ARIH1-210ENST00000570085 MADDQ8WXG6 1647 aa45.76■■■■■ 4.92
ARIH1-210ENST00000570085 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP45.74■■■■■ 4.91
ARIH1-210ENST00000570085 CROCC2H7BZ55 1655 aa45.72■■■■■ 4.91
ARIH1-210ENST00000570085 ABCC5O15440 1437 aa45.72■■■■■ 4.91
ARIH1-210ENST00000570085 SHANK2Q9UPX8 1470 aa45.68■■■■■ 4.9
ARIH1-210ENST00000570085 DAPK1P53355 1430 aa45.68■■■■■ 4.9
ARIH1-210ENST00000570085 MLECQ14165 292 aa45.66■■■■■ 4.9
ARIH1-210ENST00000570085 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa45.64■■■■■ 4.9
ARIH1-210ENST00000570085 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP45.64■■■■■ 4.9
ARIH1-210ENST00000570085 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP45.62■■■■■ 4.89
ARIH1-210ENST00000570085 PTPRMP28827 1452 aa45.61■■■■■ 4.89
ARIH1-210ENST00000570085 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP45.57■■■■■ 4.89
ARIH1-210ENST00000570085 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP45.52■■■■■ 4.884e-6■□□□□ 8.2
ARIH1-210ENST00000570085 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP45.44■■■■■ 4.87
ARIH1-210ENST00000570085 DUOX2Q9NRD8 1548 aa45.44■■■■■ 4.86
ARIH1-210ENST00000570085 ADGRL2O95490 1459 aa45.42■■■■■ 4.86
ARIH1-210ENST00000570085 KIF15Q9NS87 1388 aa45.4■■■■■ 4.86
ARIH1-210ENST00000570085 NCOA1Q15788 1441 aa45.39■■■■■ 4.86
ARIH1-210ENST00000570085 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP45.39■■■■■ 4.86
ARIH1-210ENST00000570085 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa45.38■■■■■ 4.86
ARIH1-210ENST00000570085 CNTLNQ9NXG0 1405 aa45.37■■■■■ 4.85
ARIH1-210ENST00000570085 KIF3BO15066 747 aa45.37■■■■■ 4.85
ARIH1-210ENST00000570085 CHIC2Q9UKJ5 165 aa45.37■■■■■ 4.85
ARIH1-210ENST00000570085 PPP6R1Q9UPN7 881 aa45.37■■■■■ 4.85
ARIH1-210ENST00000570085 PTPRKQ15262 1439 aa45.36■■■■■ 4.85
ARIH1-210ENST00000570085 GGT6Q6P531 493 aa45.36■■■■■ 4.85
ARIH1-210ENST00000570085 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa45.34■■■■■ 4.85
ARIH1-210ENST00000570085 MROH2AA6NES4 1674 aa45.33■■■■■ 4.85
ARIH1-210ENST00000570085 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP45.31■■■■■ 4.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms