RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569573.1

E2F4-213, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene E2F4, Length 849 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-213ENST00000569573 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.13■■■■■ 4.34
E2F4-213ENST00000569573 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.09■■■■■ 4.33
E2F4-213ENST00000569573 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
E2F4-213ENST00000569573 PLPPR3Q6T4P5 718 aa42.08■■■■■ 4.33
E2F4-213ENST00000569573 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.07■■■■■ 4.33
E2F4-213ENST00000569573 KIF14Q15058 1648 aa42.03■■■■■ 4.32
E2F4-213ENST00000569573 MLECQ14165 292 aa42.03■■■■■ 4.32
E2F4-213ENST00000569573 CLIP1P30622 1438 aa42.02■■■■■ 4.32
E2F4-213ENST00000569573 LMTK3Q96Q04 1460 aa42.01■■■■■ 4.32
E2F4-213ENST00000569573 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.99■■■■■ 4.31
E2F4-213ENST00000569573 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.96■■■■■ 4.31
E2F4-213ENST00000569573 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.95■■■■■ 4.31
E2F4-213ENST00000569573 ATP10AO60312 1499 aa41.92■■■■■ 4.3
E2F4-213ENST00000569573 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.9■■■■■ 4.3
E2F4-213ENST00000569573 FBXO41Q8TF61 875 aa41.9■■■■■ 4.3
E2F4-213ENST00000569573 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.89■■■■■ 4.3
E2F4-213ENST00000569573 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.88■■■■■ 4.3
E2F4-213ENST00000569573 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.88■■■■■ 4.29
E2F4-213ENST00000569573 HSPA2P54652 639 aa41.85■■■■■ 4.29
E2F4-213ENST00000569573 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.83■■■■■ 4.29
E2F4-213ENST00000569573 AFAP1Q8N556 730 aa41.8■■■■■ 4.28
E2F4-213ENST00000569573 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.79■■■■■ 4.28
E2F4-213ENST00000569573 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.78■■■■■ 4.28
E2F4-213ENST00000569573 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.76■■■■■ 4.28
E2F4-213ENST00000569573 KDM5CP41229 1560 aa41.75■■■■■ 4.27
E2F4-213ENST00000569573 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.7■■■■■ 4.27
E2F4-213ENST00000569573 PREX2Q70Z35 1606 aa41.67■■■■■ 4.26
E2F4-213ENST00000569573 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.63■■■■■ 4.25
E2F4-213ENST00000569573 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.63■■■■■ 4.25
E2F4-213ENST00000569573 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.6■■■■■ 4.25
E2F4-213ENST00000569573 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.6■■■■■ 4.25
E2F4-213ENST00000569573 ABCC1P33527 1531 aa41.59■■■■■ 4.25
E2F4-213ENST00000569573 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.57■■■■■ 4.25
E2F4-213ENST00000569573 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.57■■■■■ 4.25
E2F4-213ENST00000569573 ABCA6Q8N139 1617 aa41.55■■■■■ 4.24
E2F4-213ENST00000569573 REREQ9P2R6 1566 aa41.55■■■■■ 4.24
E2F4-213ENST00000569573 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
E2F4-213ENST00000569573 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.55■■■■■ 4.24
E2F4-213ENST00000569573 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.24
E2F4-213ENST00000569573 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.5■■■■■ 4.23
E2F4-213ENST00000569573 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.47■■■■■ 4.23
E2F4-213ENST00000569573 AGLP35573 1532 aa41.44■■■■■ 4.23
E2F4-213ENST00000569573 CERKQ8TCT0 537 aa41.41■■■■■ 4.22
E2F4-213ENST00000569573 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.4■■■■■ 4.22
E2F4-213ENST00000569573 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41.37■■■■■ 4.21
E2F4-213ENST00000569573 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
E2F4-213ENST00000569573 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
E2F4-213ENST00000569573 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.35■■■■■ 4.21
E2F4-213ENST00000569573 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.34■■■■■ 4.21
E2F4-213ENST00000569573 C3P01024 1663 aa41.34■■■■■ 4.21
E2F4-213ENST00000569573 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
E2F4-213ENST00000569573 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
E2F4-213ENST00000569573 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.31■■■■■ 4.2
E2F4-213ENST00000569573 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.31■■■■■ 4.2
E2F4-213ENST00000569573 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.3■■■■■ 4.2
E2F4-213ENST00000569573 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.3■■■■■ 4.2
E2F4-213ENST00000569573 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.26■■■■■ 4.2
E2F4-213ENST00000569573 STRCQ7RTU9 1775 aa41.23■■■■■ 4.19
E2F4-213ENST00000569573 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.22■■■■■ 4.19
E2F4-213ENST00000569573 ATP7AQ04656 1500 aa41.19■■■■■ 4.18
E2F4-213ENST00000569573 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
E2F4-213ENST00000569573 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
E2F4-213ENST00000569573 MROH2AA6NES4 1674 aa41.1■■■■■ 4.17
E2F4-213ENST00000569573 A2MP01023 1474 aa41.1■■■■■ 4.17
E2F4-213ENST00000569573 ZMYM3Q14202 1370 aa41.09■■■■■ 4.17
E2F4-213ENST00000569573 PTPRTO14522 1441 aa41.09■■■■■ 4.17
E2F4-213ENST00000569573 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.08■■■■■ 4.17
E2F4-213ENST00000569573 NPATQ14207 1427 aa41.08■■■■■ 4.17
E2F4-213ENST00000569573 GGT6Q6P531 493 aa41.04■■■■■ 4.16
E2F4-213ENST00000569573 PLXNC1O60486 1568 aa41.03■■■■■ 4.16
E2F4-213ENST00000569573 TIAM1Q13009 1591 aa41.03■■■■■ 4.16
E2F4-213ENST00000569573 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.16
E2F4-213ENST00000569573 CEP162Q5TB80 1403 aa41.01■■■■■ 4.15
E2F4-213ENST00000569573 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
E2F4-213ENST00000569573 NCOA1Q15788 1441 aa41■■■■■ 4.15
E2F4-213ENST00000569573 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.97■■■■■ 4.15
E2F4-213ENST00000569573 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.94■■■■■ 4.14
E2F4-213ENST00000569573 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.91■■■■■ 4.14
E2F4-213ENST00000569573 MBD5Q9P267 1494 aa40.9■■■■■ 4.14
E2F4-213ENST00000569573 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.87■■■■■ 4.13
E2F4-213ENST00000569573 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40.85■■■■■ 4.13
E2F4-213ENST00000569573 PTPRKQ15262 1439 aa40.84■■■■■ 4.13
E2F4-213ENST00000569573 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.82■■■■■ 4.13
E2F4-213ENST00000569573 NCOA2Q15596 1464 aa40.82■■■■■ 4.12
E2F4-213ENST00000569573 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
E2F4-213ENST00000569573 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
E2F4-213ENST00000569573 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.8■■■■■ 4.12
E2F4-213ENST00000569573 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
E2F4-213ENST00000569573 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.79■■■■■ 4.12
E2F4-213ENST00000569573 PKD2Q13563 968 aa40.77■■■■■ 4.12
E2F4-213ENST00000569573 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.77■■■■■ 4.12
E2F4-213ENST00000569573 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.76■■■■■ 4.12
E2F4-213ENST00000569573 PLA2R1Q13018 1463 aa40.75■■■■■ 4.11
E2F4-213ENST00000569573 KIF3BO15066 747 aa40.74■■■■■ 4.11
E2F4-213ENST00000569573 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.72■■■■■ 4.11
E2F4-213ENST00000569573 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
E2F4-213ENST00000569573 DISP3Q9P2K9 1392 aa40.65■■■■■ 4.1
E2F4-213ENST00000569573 TSPY4P0CV99 314 aa40.65■■■■■ 4.1
E2F4-213ENST00000569573 TSPY10P0CW01 314 aa40.65■■■■■ 4.1
E2F4-213ENST00000569573 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.5 ms