RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567336.1

PPCDC-208, Transcript of phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PPCDC, Length 892 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCDC-208ENST00000567336 TIAM1Q13009 1591 aa22.51■■□□□ 1.19
PPCDC-208ENST00000567336 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.51■■□□□ 1.19
PPCDC-208ENST00000567336 PREX2Q70Z35 1606 aa22.5■■□□□ 1.19
PPCDC-208ENST00000567336 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.5■■□□□ 1.19
PPCDC-208ENST00000567336 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.49■■□□□ 1.19
PPCDC-208ENST00000567336 ADGRL1O94910 1474 aa22.48■■□□□ 1.19
PPCDC-208ENST00000567336 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.47■■□□□ 1.19
PPCDC-208ENST00000567336 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.46■■□□□ 1.19
PPCDC-208ENST00000567336 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.46■■□□□ 1.19
PPCDC-208ENST00000567336 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.46■■□□□ 1.19
PPCDC-208ENST00000567336 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.46■■□□□ 1.19
PPCDC-208ENST00000567336 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PPCDC-208ENST00000567336 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.45■■□□□ 1.18
PPCDC-208ENST00000567336 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.42■■□□□ 1.18
PPCDC-208ENST00000567336 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.4■■□□□ 1.18
PPCDC-208ENST00000567336 ABCC1P33527 1531 aa22.4■■□□□ 1.18
PPCDC-208ENST00000567336 NCOA2Q15596 1464 aa22.4■■□□□ 1.18
PPCDC-208ENST00000567336 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.4■■□□□ 1.18
PPCDC-208ENST00000567336 KDM5CP41229 1560 aa22.39■■□□□ 1.18
PPCDC-208ENST00000567336 AFAP1Q8N556 730 aa22.39■■□□□ 1.17
PPCDC-208ENST00000567336 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.38■■□□□ 1.17
PPCDC-208ENST00000567336 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PPCDC-208ENST00000567336 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.38■■□□□ 1.17
PPCDC-208ENST00000567336 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.37■■□□□ 1.17
PPCDC-208ENST00000567336 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.36■■□□□ 1.17
PPCDC-208ENST00000567336 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PPCDC-208ENST00000567336 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.34■■□□□ 1.17
PPCDC-208ENST00000567336 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.33■■□□□ 1.17
PPCDC-208ENST00000567336 MBD5Q9P267 1494 aa22.33■■□□□ 1.16
PPCDC-208ENST00000567336 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.33■■□□□ 1.16
PPCDC-208ENST00000567336 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PPCDC-208ENST00000567336 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.31■■□□□ 1.16
PPCDC-208ENST00000567336 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
PPCDC-208ENST00000567336 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.3■■□□□ 1.16
PPCDC-208ENST00000567336 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PPCDC-208ENST00000567336 ATP10AO60312 1499 aa22.28■■□□□ 1.16
PPCDC-208ENST00000567336 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.27■■□□□ 1.16
PPCDC-208ENST00000567336 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.26■■□□□ 1.15
PPCDC-208ENST00000567336 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.25■■□□□ 1.15
PPCDC-208ENST00000567336 MIA2Q96PC5 1412 aa22.24■■□□□ 1.15
PPCDC-208ENST00000567336 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.24■■□□□ 1.15
PPCDC-208ENST00000567336 APLP2Q06481 763 aa22.23■■□□□ 1.15
PPCDC-208ENST00000567336 REREQ9P2R6 1566 aa22.23■■□□□ 1.15
PPCDC-208ENST00000567336 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.23■■□□□ 1.15
PPCDC-208ENST00000567336 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.23■■□□□ 1.15
PPCDC-208ENST00000567336 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.22■■□□□ 1.15
PPCDC-208ENST00000567336 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.21■■□□□ 1.15
PPCDC-208ENST00000567336 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.2■■□□□ 1.14
PPCDC-208ENST00000567336 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.2■■□□□ 1.14
PPCDC-208ENST00000567336 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.19■■□□□ 1.14
PPCDC-208ENST00000567336 ABCA6Q8N139 1617 aa22.18■■□□□ 1.14
PPCDC-208ENST00000567336 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.18■■□□□ 1.14
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PPCDC-208ENST00000567336 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.16■■□□□ 1.14
PPCDC-208ENST00000567336 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PPCDC-208ENST00000567336 AGLP35573 1532 aa22.16■■□□□ 1.14
PPCDC-208ENST00000567336 ATP7AQ04656 1500 aa22.13■■□□□ 1.13
PPCDC-208ENST00000567336 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.11■■□□□ 1.13
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PPCDC-208ENST00000567336 PLXNC1O60486 1568 aa22.08■■□□□ 1.12
PPCDC-208ENST00000567336 PTPRMP28827 1452 aa22.07■■□□□ 1.12
PPCDC-208ENST00000567336 MADDQ8WXG6 1647 aa22.06■■□□□ 1.12
PPCDC-208ENST00000567336 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.05■■□□□ 1.12
PPCDC-208ENST00000567336 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.05■■□□□ 1.12
PPCDC-208ENST00000567336 A2MP01023 1474 aa22.04■■□□□ 1.12
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PPCDC-208ENST00000567336 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.04■■□□□ 1.12
PPCDC-208ENST00000567336 ABCC5O15440 1437 aa22.03■■□□□ 1.12
PPCDC-208ENST00000567336 TSPY4P0CV99 314 aa22.02■■□□□ 1.12
PPCDC-208ENST00000567336 TSPY10P0CW01 314 aa22.02■■□□□ 1.12
PPCDC-208ENST00000567336 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.01■■□□□ 1.11
PPCDC-208ENST00000567336 MLECQ14165 292 aa21.99■■□□□ 1.11
PPCDC-208ENST00000567336 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.96■■□□□ 1.11
PPCDC-208ENST00000567336 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.96■■□□□ 1.11
PPCDC-208ENST00000567336 DAPK1P53355 1430 aa21.96■■□□□ 1.11
PPCDC-208ENST00000567336 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PPCDC-208ENST00000567336 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PPCDC-208ENST00000567336 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.94■■□□□ 1.1
PPCDC-208ENST00000567336 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
PPCDC-208ENST00000567336 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.91■■□□□ 1.1
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PPCDC-208ENST00000567336 NCOA1Q15788 1441 aa21.89■■□□□ 1.09
PPCDC-208ENST00000567336 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.89■■□□□ 1.09
PPCDC-208ENST00000567336 PTPRKQ15262 1439 aa21.88■■□□□ 1.09
PPCDC-208ENST00000567336 ADGRL2O95490 1459 aa21.87■■□□□ 1.09
PPCDC-208ENST00000567336 KIF3BO15066 747 aa21.86■■□□□ 1.09
PPCDC-208ENST00000567336 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PPCDC-208ENST00000567336 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PPCDC-208ENST00000567336 GGT6Q6P531 493 aa21.85■■□□□ 1.09
PPCDC-208ENST00000567336 ZMYM3Q14202 1370 aa21.85■■□□□ 1.09
PPCDC-208ENST00000567336 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.85■■□□□ 1.09
PPCDC-208ENST00000567336 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PPCDC-208ENST00000567336 MROH2AA6NES4 1674 aa21.84■■□□□ 1.09
PPCDC-208ENST00000567336 C3P01024 1663 aa21.82■■□□□ 1.08
PPCDC-208ENST00000567336 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PPCDC-208ENST00000567336 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PPCDC-208ENST00000567336 KIF15Q9NS87 1388 aa21.82■■□□□ 1.08
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