RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564160.1

ERVK13-1-202, Transcript of endogenous retrovirus group K13 member 1, humanhuman

TSL 3

Gene ERVK13-1, Length 983 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1-202ENST00000564160 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.28■■■■■ 4.52
ERVK13-1-202ENST00000564160 LMTK3Q96Q04 1460 aa43.27■■■■■ 4.52
ERVK13-1-202ENST00000564160 MYO5CQ9NQX4 1742 aa43.27■■■■■ 4.52
ERVK13-1-202ENST00000564160 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP43.26■■■■■ 4.52
ERVK13-1-202ENST00000564160 KIF14Q15058 1648 aa43.25■■■■■ 4.51
ERVK13-1-202ENST00000564160 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa43.22■■■■■ 4.51
ERVK13-1-202ENST00000564160 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP43.16■■■■■ 4.5
ERVK13-1-202ENST00000564160 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP43.16■■■■■ 4.5
ERVK13-1-202ENST00000564160 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa43.14■■■■■ 4.5
ERVK13-1-202ENST00000564160 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa43.09■■■■■ 4.49
ERVK13-1-202ENST00000564160 ATP10AO60312 1499 aa43.08■■■■■ 4.49
ERVK13-1-202ENST00000564160 MLECQ14165 292 aa43.04■■■■■ 4.48
ERVK13-1-202ENST00000564160 ARHGAP5Q13017 1502 aa43.03■■■■■ 4.48
ERVK13-1-202ENST00000564160 CLIP1P30622 1438 aa43.03■■■■■ 4.48
ERVK13-1-202ENST00000564160 C9orf84Q5VXU9 1444 aa43.03■■■■■ 4.48
ERVK13-1-202ENST00000564160 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa43.02■■■■■ 4.48
ERVK13-1-202ENST00000564160 KDM5CP41229 1560 aa43.01■■■■■ 4.48
ERVK13-1-202ENST00000564160 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa43■■■■■ 4.47
ERVK13-1-202ENST00000564160 FBXO41Q8TF61 875 aa43■■■■■ 4.47
ERVK13-1-202ENST00000564160 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa43■■■■■ 4.47
ERVK13-1-202ENST00000564160 PLPPR3Q6T4P5 718 aa42.99■■■■■ 4.47
ERVK13-1-202ENST00000564160 HSPA2P54652 639 aa42.96■■■■■ 4.47
ERVK13-1-202ENST00000564160 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.95■■■■■ 4.47
ERVK13-1-202ENST00000564160 AFAP1Q8N556 730 aa42.93■■■■■ 4.46
ERVK13-1-202ENST00000564160 PREX2Q70Z35 1606 aa42.89■■■■■ 4.46
ERVK13-1-202ENST00000564160 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.89■■■■■ 4.46
ERVK13-1-202ENST00000564160 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa42.87■■■■■ 4.45
ERVK13-1-202ENST00000564160 REREQ9P2R6 1566 aa42.82■■■■■ 4.45
ERVK13-1-202ENST00000564160 ABCC1P33527 1531 aa42.82■■■■■ 4.45
ERVK13-1-202ENST00000564160 ABCA6Q8N139 1617 aa42.81■■■■■ 4.44
ERVK13-1-202ENST00000564160 MLH3Q9UHC1 1453 aa42.8■■■■■ 4.44
ERVK13-1-202ENST00000564160 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.78■■■■■ 4.44
ERVK13-1-202ENST00000564160 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.78■■■■■ 4.44
ERVK13-1-202ENST00000564160 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa42.78■■■■■ 4.44
ERVK13-1-202ENST00000564160 PREX1Q8TCU6 1659 aa42.77■■■■■ 4.44
ERVK13-1-202ENST00000564160 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.75■■■■■ 4.43
ERVK13-1-202ENST00000564160 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP42.74■■■■■ 4.43
ERVK13-1-202ENST00000564160 MYT1LQ9UL68 1186 aa42.7■■■■■ 4.43
ERVK13-1-202ENST00000564160 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa42.67■■■■■ 4.42
ERVK13-1-202ENST00000564160 AGLP35573 1532 aa42.66■■■■■ 4.42
ERVK13-1-202ENST00000564160 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
ERVK13-1-202ENST00000564160 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa42.59■■■■■ 4.41
ERVK13-1-202ENST00000564160 C3P01024 1663 aa42.59■■■■■ 4.41
ERVK13-1-202ENST00000564160 STRCQ7RTU9 1775 aa42.56■■■■■ 4.4
ERVK13-1-202ENST00000564160 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
ERVK13-1-202ENST00000564160 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa42.53■■■■■ 4.4
ERVK13-1-202ENST00000564160 SYCP2Q9BX26 1530 aa42.51■■■■■ 4.39
ERVK13-1-202ENST00000564160 CERKQ8TCT0 537 aa42.5■■■■■ 4.39
ERVK13-1-202ENST00000564160 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP42.46■■■■■ 4.39
ERVK13-1-202ENST00000564160 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP42.4■■■■■ 4.38
ERVK13-1-202ENST00000564160 CNTLNQ9NXG0 1405 aa42.38■■■■■ 4.38
ERVK13-1-202ENST00000564160 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa42.38■■■■■ 4.38
ERVK13-1-202ENST00000564160 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP42.37■■■■■ 4.37
ERVK13-1-202ENST00000564160 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
ERVK13-1-202ENST00000564160 ATP7AQ04656 1500 aa42.35■■■■■ 4.37
ERVK13-1-202ENST00000564160 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP42.35■■■■■ 4.37
ERVK13-1-202ENST00000564160 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa42.34■■■■■ 4.37
ERVK13-1-202ENST00000564160 MROH2AA6NES4 1674 aa42.33■■■■■ 4.37
ERVK13-1-202ENST00000564160 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP42.33■■■■■ 4.37
ERVK13-1-202ENST00000564160 DMRT2Q9Y5R5 561 aa42.33■■■■■ 4.37
ERVK13-1-202ENST00000564160 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.32■■■■■ 4.37
ERVK13-1-202ENST00000564160 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP42.32■■■■■ 4.37
ERVK13-1-202ENST00000564160 PLXNC1O60486 1568 aa42.31■■■■■ 4.36
ERVK13-1-202ENST00000564160 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.29■■■■■ 4.36
ERVK13-1-202ENST00000564160 PTPRTO14522 1441 aa42.25■■■■■ 4.35
ERVK13-1-202ENST00000564160 TIAM1Q13009 1591 aa42.25■■■■■ 4.35
ERVK13-1-202ENST00000564160 NPATQ14207 1427 aa42.22■■■■■ 4.35
ERVK13-1-202ENST00000564160 A2MP01023 1474 aa42.22■■■■■ 4.35
ERVK13-1-202ENST00000564160 ZMYM3Q14202 1370 aa42.2■■■■■ 4.35
ERVK13-1-202ENST00000564160 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.2■■■■■ 4.35
ERVK13-1-202ENST00000564160 NCOA1Q15788 1441 aa42.18■■■■■ 4.34
ERVK13-1-202ENST00000564160 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP42.18■■■■■ 4.34
ERVK13-1-202ENST00000564160 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP42.16■■■■■ 4.34
ERVK13-1-202ENST00000564160 MBD5Q9P267 1494 aa42.14■■■■■ 4.34
ERVK13-1-202ENST00000564160 ADGBQ8N7X0 1667 aa42.14■■■■■ 4.34
ERVK13-1-202ENST00000564160 CEP162Q5TB80 1403 aa42.12■■■■■ 4.33
ERVK13-1-202ENST00000564160 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa42.09■■■■■ 4.33
ERVK13-1-202ENST00000564160 LTBP4Q8N2S1 1624 aa42.08■■■■■ 4.33
ERVK13-1-202ENST00000564160 PTPRKQ15262 1439 aa42.03■■■■■ 4.32
ERVK13-1-202ENST00000564160 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP42.03■■■■■ 4.32
ERVK13-1-202ENST00000564160 MYO3AQ8NEV4 1616 aa42.03■■■■■ 4.32
ERVK13-1-202ENST00000564160 GGT6Q6P531 493 aa42.02■■■■■ 4.32
ERVK13-1-202ENST00000564160 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa42.01■■■■■ 4.32
ERVK13-1-202ENST00000564160 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.96■■■■■ 4.31
ERVK13-1-202ENST00000564160 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
ERVK13-1-202ENST00000564160 NCOA2Q15596 1464 aa41.94■■■■■ 4.3
ERVK13-1-202ENST00000564160 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
ERVK13-1-202ENST00000564160 PLA2R1Q13018 1463 aa41.91■■■■■ 4.3
ERVK13-1-202ENST00000564160 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.9■■■■■ 4.3
ERVK13-1-202ENST00000564160 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.89■■■■■ 4.3
ERVK13-1-202ENST00000564160 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.89■■■■■ 4.3
ERVK13-1-202ENST00000564160 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.89■■■■■ 4.3
ERVK13-1-202ENST00000564160 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
ERVK13-1-202ENST00000564160 PKD2Q13563 968 aa41.79■■■■■ 4.28
ERVK13-1-202ENST00000564160 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.77■■■■■ 4.28
ERVK13-1-202ENST00000564160 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
ERVK13-1-202ENST00000564160 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.76■■■■■ 4.28
ERVK13-1-202ENST00000564160 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.76■■■■■ 4.28
ERVK13-1-202ENST00000564160 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
ERVK13-1-202ENST00000564160 KIF3BO15066 747 aa41.75■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.4 ms