RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa49.07■■■■■ 5.45
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CMTM4-204ENST00000563952 POGZQ7Z3K3 1410 aa49.01■■■■■ 5.44
CMTM4-204ENST00000563952 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa48.99■■■■■ 5.43
CMTM4-204ENST00000563952 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa48.99■■■■■ 5.43
CMTM4-204ENST00000563952 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa48.97■■■■■ 5.43
CMTM4-204ENST00000563952 VPS8Q8N3P4 1428 aa48.93■■■■■ 5.42
CMTM4-204ENST00000563952 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa48.9■■■■■ 5.42
CMTM4-204ENST00000563952 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa48.88■■■■■ 5.41
CMTM4-204ENST00000563952 MAGI2Q86UL8 1455 aa48.86■■■■■ 5.41
CMTM4-204ENST00000563952 YEATS2Q9ULM3 1422 aa48.85■■■■■ 5.41
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CMTM4-204ENST00000563952 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa48.83■■■■■ 5.41
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CMTM4-204ENST00000563952 ABCC1P33527 1531 aa48.81■■■■■ 5.4
CMTM4-204ENST00000563952 AFAP1Q8N556 730 aa48.79■■■■■ 5.4
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP48.79■■■■■ 5.4
CMTM4-204ENST00000563952 TIAM1Q13009 1591 aa48.77■■■■■ 5.4
CMTM4-204ENST00000563952 ITSN2Q9NZM3 1697 aa48.75■■■■■ 5.4
CMTM4-204ENST00000563952 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa48.75■■■■■ 5.39
CMTM4-204ENST00000563952 KDM5CP41229 1560 aa48.73■■■■■ 5.39
CMTM4-204ENST00000563952 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa48.72■■■■■ 5.39
CMTM4-204ENST00000563952 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP48.71■■■■■ 5.39
CMTM4-204ENST00000563952 BCORL1Q5H9F3 1711 aa48.69■■■■■ 5.39
CMTM4-204ENST00000563952 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa48.69■■■■■ 5.39
CMTM4-204ENST00000563952 MYT1LQ9UL68 1186 aa48.69■■■■■ 5.38
CMTM4-204ENST00000563952 ADAMTSL3P82987 1691 aa48.67■■■■■ 5.38
CMTM4-204ENST00000563952 HECW2Q9P2P5 1572 aa48.65■■■■■ 5.38
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CMTM4-204ENST00000563952 ATP10AO60312 1499 aa48.62■■■■■ 5.37
CMTM4-204ENST00000563952 SYCP2Q9BX26 1530 aa48.62■■■■■ 5.37
CMTM4-204ENST00000563952 NCOA2Q15596 1464 aa48.59■■■■■ 5.37
CMTM4-204ENST00000563952 C9orf84Q5VXU9 1444 aa48.58■■■■■ 5.37
CMTM4-204ENST00000563952 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP48.56■■■■■ 5.36
CMTM4-204ENST00000563952 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa48.55■■■■■ 5.36
CMTM4-204ENST00000563952 MLH3Q9UHC1 1453 aa48.55■■■■■ 5.36
CMTM4-204ENST00000563952 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa48.55■■■■■ 5.36
CMTM4-204ENST00000563952 MADDQ8WXG6 1647 aa48.54■■■■■ 5.36
CMTM4-204ENST00000563952 MAP3K1Q13233 1512 aa48.52■■■■■ 5.36
CMTM4-204ENST00000563952 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa48.51■■■■■ 5.36
CMTM4-204ENST00000563952 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa48.49■■■■■ 5.35
CMTM4-204ENST00000563952 ABCA6Q8N139 1617 aa48.49■■■■■ 5.35
CMTM4-204ENST00000563952 MLECQ14165 292 aa48.47■■■■■ 5.35
CMTM4-204ENST00000563952 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP48.46■■■■■ 5.35
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP48.46■■■■■ 5.35
CMTM4-204ENST00000563952 PTPRMP28827 1452 aa48.46■■■■■ 5.35
CMTM4-204ENST00000563952 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa48.44■■■■■ 5.35
CMTM4-204ENST00000563952 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP48.41■■■■■ 5.34
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CMTM4-204ENST00000563952 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa48.31■■■■■ 5.32
CMTM4-204ENST00000563952 ATP7AQ04656 1500 aa48.3■■■■■ 5.32
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CMTM4-204ENST00000563952 MBD5Q9P267 1494 aa48.28■■■■■ 5.32
CMTM4-204ENST00000563952 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP48.27■■■■■ 5.32
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CMTM4-204ENST00000563952 MYOM3Q5VTT5 1437 aa48.14■■■■■ 5.3
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CMTM4-204ENST00000563952 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa48.06■■■■■ 5.28
CMTM4-204ENST00000563952 MIA2Q96PC5 1412 aa48.05■■■■■ 5.28
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CMTM4-204ENST00000563952 ZMYM3Q14202 1370 aa47.64■■■■■ 5.22
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CMTM4-204ENST00000563952 SHANK2Q9UPX8 1470 aa47.6■■■■■ 5.21
CMTM4-204ENST00000563952 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa47.58■■■■■ 5.21
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CMTM4-204ENST00000563952 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP47.53■■■■■ 5.2
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