RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563386.5

USP10-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 590 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-208ENST00000563386 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.02■■■□□ 2.4
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USP10-208ENST00000563386 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.98■■■□□ 2.39
USP10-208ENST00000563386 PREX2Q70Z35 1606 aa29.97■■■□□ 2.39
USP10-208ENST00000563386 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.94■■■□□ 2.38
USP10-208ENST00000563386 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
USP10-208ENST00000563386 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.92■■■□□ 2.38
USP10-208ENST00000563386 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.92■■■□□ 2.38
USP10-208ENST00000563386 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.91■■■□□ 2.38
USP10-208ENST00000563386 TIAM1Q13009 1591 aa29.89■■■□□ 2.38
USP10-208ENST00000563386 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
USP10-208ENST00000563386 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
USP10-208ENST00000563386 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.86■■■□□ 2.37
USP10-208ENST00000563386 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.86■■■□□ 2.37
USP10-208ENST00000563386 AFAP1Q8N556 730 aa29.85■■■□□ 2.37
USP10-208ENST00000563386 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
USP10-208ENST00000563386 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.85■■■□□ 2.37
USP10-208ENST00000563386 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.85■■■□□ 2.37
USP10-208ENST00000563386 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.84■■■□□ 2.37
USP10-208ENST00000563386 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.82■■■□□ 2.36
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USP10-208ENST00000563386 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.8■■■□□ 2.36
USP10-208ENST00000563386 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.8■■■□□ 2.36
USP10-208ENST00000563386 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.78■■■□□ 2.36
USP10-208ENST00000563386 APLP2Q06481 763 aa29.78■■■□□ 2.36
USP10-208ENST00000563386 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
USP10-208ENST00000563386 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.78■■■□□ 2.36
USP10-208ENST00000563386 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.78■■■□□ 2.36
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USP10-208ENST00000563386 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.77■■■□□ 2.36
USP10-208ENST00000563386 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.75■■■□□ 2.356e-7■■■■□ 23
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USP10-208ENST00000563386 KDM5CP41229 1560 aa29.73■■■□□ 2.35
USP10-208ENST00000563386 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.73■■■□□ 2.35
USP10-208ENST00000563386 MAP3K1Q13233 1512 aa29.71■■■□□ 2.35
USP10-208ENST00000563386 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
USP10-208ENST00000563386 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.7■■■□□ 2.35
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USP10-208ENST00000563386 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.68■■■□□ 2.34
USP10-208ENST00000563386 MLECQ14165 292 aa29.66■■■□□ 2.34
USP10-208ENST00000563386 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.65■■■□□ 2.34
USP10-208ENST00000563386 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.65■■■□□ 2.34
USP10-208ENST00000563386 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.64■■■□□ 2.34
USP10-208ENST00000563386 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.64■■■□□ 2.34
USP10-208ENST00000563386 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.64■■■□□ 2.34
USP10-208ENST00000563386 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
USP10-208ENST00000563386 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.63■■■□□ 2.33
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USP10-208ENST00000563386 ABCA6Q8N139 1617 aa29.6■■■□□ 2.33
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USP10-208ENST00000563386 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.58■■■□□ 2.33
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USP10-208ENST00000563386 MBD5Q9P267 1494 aa29.53■■■□□ 2.32
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USP10-208ENST00000563386 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.52■■■□□ 2.32
USP10-208ENST00000563386 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
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USP10-208ENST00000563386 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.44■■■□□ 2.3
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USP10-208ENST00000563386 MIA2Q96PC5 1412 aa29.42■■■□□ 2.3
USP10-208ENST00000563386 AGLP35573 1532 aa29.4■■■□□ 2.3
USP10-208ENST00000563386 TSPY4P0CV99 314 aa29.39■■■□□ 2.3
USP10-208ENST00000563386 TSPY10P0CW01 314 aa29.39■■■□□ 2.3
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USP10-208ENST00000563386 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.22■■■□□ 2.27
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USP10-208ENST00000563386 DAPK1P53355 1430 aa29.17■■■□□ 2.26
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USP10-208ENST00000563386 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.11■■■□□ 2.25
USP10-208ENST00000563386 HSPA2P54652 639 aa29.11■■■□□ 2.25
USP10-208ENST00000563386 ZMYM3Q14202 1370 aa29.11■■■□□ 2.25
USP10-208ENST00000563386 MROH2AA6NES4 1674 aa29.09■■■□□ 2.25
USP10-208ENST00000563386 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.09■■■□□ 2.25
USP10-208ENST00000563386 KIF15Q9NS87 1388 aa29.08■■■□□ 2.25
USP10-208ENST00000563386 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.06■■■□□ 2.24
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