RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563367.1

NME3-203, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 3

Gene NME3, Length 891 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-203ENST00000563367 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa45.13■■■■■ 4.82
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NME3-203ENST00000563367 SCAPERQ9BY12 1400 aa45.1■■■■■ 4.81
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NME3-203ENST00000563367 POGZQ7Z3K3 1410 aa45.01■■■■■ 4.8
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NME3-203ENST00000563367 BCORL1Q5H9F3 1711 aa44.7■■■■■ 4.75
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NME3-203ENST00000563367 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP44.64■■■■■ 4.74
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NME3-203ENST00000563367 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP44.61■■■■■ 4.73
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NME3-203ENST00000563367 ZMYM3Q14202 1370 aa43.75■■■■■ 4.59
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NME3-203ENST00000563367 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP43.68■■■■■ 4.58
NME3-203ENST00000563367 HSPA2P54652 639 aa43.67■■■■■ 4.58
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