RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561868.1

SPNS1-205, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 441 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-205ENST00000561868 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.52■■□□□ 1.68
SPNS1-205ENST00000561868 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.5■■□□□ 1.67
SPNS1-205ENST00000561868 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.48■■□□□ 1.67
SPNS1-205ENST00000561868 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.47■■□□□ 1.67
SPNS1-205ENST00000561868 KIF14Q15058 1648 aa25.46■■□□□ 1.67
SPNS1-205ENST00000561868 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.46■■□□□ 1.67
SPNS1-205ENST00000561868 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.46■■□□□ 1.67
SPNS1-205ENST00000561868 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
SPNS1-205ENST00000561868 CLIP1P30622 1438 aa25.43■■□□□ 1.66
SPNS1-205ENST00000561868 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.43■■□□□ 1.66
SPNS1-205ENST00000561868 ATP10AO60312 1499 aa25.42■■□□□ 1.66
SPNS1-205ENST00000561868 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
SPNS1-205ENST00000561868 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.41■■□□□ 1.66
SPNS1-205ENST00000561868 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.4■■□□□ 1.66
SPNS1-205ENST00000561868 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.37■■□□□ 1.65
SPNS1-205ENST00000561868 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.36■■□□□ 1.65
SPNS1-205ENST00000561868 MLECQ14165 292 aa25.35■■□□□ 1.65
SPNS1-205ENST00000561868 KDM5CP41229 1560 aa25.34■■□□□ 1.65
SPNS1-205ENST00000561868 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.31■■□□□ 1.64
SPNS1-205ENST00000561868 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.3■■□□□ 1.64
SPNS1-205ENST00000561868 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.3■■□□□ 1.64
SPNS1-205ENST00000561868 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.3■■□□□ 1.64
SPNS1-205ENST00000561868 HSPA2P54652 639 aa25.29■■□□□ 1.64
SPNS1-205ENST00000561868 REREQ9P2R6 1566 aa25.29■■□□□ 1.64
SPNS1-205ENST00000561868 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
SPNS1-205ENST00000561868 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.28■■□□□ 1.64
SPNS1-205ENST00000561868 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.26■■□□□ 1.63
SPNS1-205ENST00000561868 PREX2Q70Z35 1606 aa25.26■■□□□ 1.63
SPNS1-205ENST00000561868 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.25■■□□□ 1.63
SPNS1-205ENST00000561868 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.24■■□□□ 1.63
SPNS1-205ENST00000561868 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.24■■□□□ 1.63
SPNS1-205ENST00000561868 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-205ENST00000561868 AFAP1Q8N556 730 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-205ENST00000561868 ABCC1P33527 1531 aa25.2■■□□□ 1.62
SPNS1-205ENST00000561868 AGLP35573 1532 aa25.19■■□□□ 1.62
SPNS1-205ENST00000561868 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.19■■□□□ 1.62
SPNS1-205ENST00000561868 ABCA6Q8N139 1617 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-205ENST00000561868 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.17■■□□□ 1.62
SPNS1-205ENST00000561868 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.17■■□□□ 1.62
SPNS1-205ENST00000561868 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-205ENST00000561868 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.15■■□□□ 1.62
SPNS1-205ENST00000561868 CERKQ8TCT0 537 aa25.15■■□□□ 1.62
SPNS1-205ENST00000561868 CEP162Q5TB80 1403 aa25.14■■□□□ 1.62
SPNS1-205ENST00000561868 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SPNS1-205ENST00000561868 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-205ENST00000561868 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-205ENST00000561868 C3P01024 1663 aa25.1■■□□□ 1.61
SPNS1-205ENST00000561868 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.1■■□□□ 1.61
SPNS1-205ENST00000561868 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.1■■□□□ 1.61
SPNS1-205ENST00000561868 STRCQ7RTU9 1775 aa25.08■■□□□ 1.61
SPNS1-205ENST00000561868 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.04■■□□□ 1.6
SPNS1-205ENST00000561868 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.02■■□□□ 1.6
SPNS1-205ENST00000561868 MROH2AA6NES4 1674 aa25.02■■□□□ 1.6
SPNS1-205ENST00000561868 PTPRTO14522 1441 aa25.01■■□□□ 1.59
SPNS1-205ENST00000561868 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
SPNS1-205ENST00000561868 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.99■■□□□ 1.59
SPNS1-205ENST00000561868 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.99■■□□□ 1.59
SPNS1-205ENST00000561868 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SPNS1-205ENST00000561868 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
SPNS1-205ENST00000561868 NPATQ14207 1427 aa24.97■■□□□ 1.59
SPNS1-205ENST00000561868 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SPNS1-205ENST00000561868 ATP7AQ04656 1500 aa24.94■■□□□ 1.58
SPNS1-205ENST00000561868 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.93■■□□□ 1.58
SPNS1-205ENST00000561868 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
SPNS1-205ENST00000561868 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
SPNS1-205ENST00000561868 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.92■■□□□ 1.58
SPNS1-205ENST00000561868 PLXNC1O60486 1568 aa24.9■■□□□ 1.58
SPNS1-205ENST00000561868 NCOA1Q15788 1441 aa24.9■■□□□ 1.58
SPNS1-205ENST00000561868 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
SPNS1-205ENST00000561868 A2MP01023 1474 aa24.89■■□□□ 1.57
SPNS1-205ENST00000561868 ZMYM3Q14202 1370 aa24.88■■□□□ 1.57
SPNS1-205ENST00000561868 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.87■■□□□ 1.57
SPNS1-205ENST00000561868 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.87■■□□□ 1.57
SPNS1-205ENST00000561868 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS1-205ENST00000561868 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS1-205ENST00000561868 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SPNS1-205ENST00000561868 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.84■■□□□ 1.57
SPNS1-205ENST00000561868 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.83■■□□□ 1.57
SPNS1-205ENST00000561868 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
SPNS1-205ENST00000561868 TIAM1Q13009 1591 aa24.8■■□□□ 1.56
SPNS1-205ENST00000561868 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.8■■□□□ 1.56
SPNS1-205ENST00000561868 PLA2R1Q13018 1463 aa24.79■■□□□ 1.56
SPNS1-205ENST00000561868 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.79■■□□□ 1.56
SPNS1-205ENST00000561868 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.78■■□□□ 1.56
SPNS1-205ENST00000561868 PTPRKQ15262 1439 aa24.77■■□□□ 1.56
SPNS1-205ENST00000561868 PKD2Q13563 968 aa24.76■■□□□ 1.55
SPNS1-205ENST00000561868 GGT6Q6P531 493 aa24.76■■□□□ 1.55
SPNS1-205ENST00000561868 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SPNS1-205ENST00000561868 MBD5Q9P267 1494 aa24.74■■□□□ 1.55
SPNS1-205ENST00000561868 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.72■■□□□ 1.55
SPNS1-205ENST00000561868 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.71■■□□□ 1.55
SPNS1-205ENST00000561868 MAP3K1Q13233 1512 aa24.7■■□□□ 1.54
SPNS1-205ENST00000561868 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SPNS1-205ENST00000561868 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.69■■□□□ 1.54
SPNS1-205ENST00000561868 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SPNS1-205ENST00000561868 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SPNS1-205ENST00000561868 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.67■■□□□ 1.54
SPNS1-205ENST00000561868 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.67■■□□□ 1.54
SPNS1-205ENST00000561868 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.66■■□□□ 1.54
SPNS1-205ENST00000561868 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.63■■□□□ 1.53
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