RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560243.5

RABGGTA-216, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-216ENST00000560243 SCAPERQ9BY12 1400 aa18.67■□□□□ 0.58
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RABGGTA-216ENST00000560243 POGZQ7Z3K3 1410 aa18.64■□□□□ 0.57
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RABGGTA-216ENST00000560243 CCNB3Q8WWL7 1395 aa18.54■□□□□ 0.56
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RABGGTA-216ENST00000560243 ADAMTSL3P82987 1691 aa18.53■□□□□ 0.56
RABGGTA-216ENST00000560243 BCORL1Q5H9F3 1711 aa18.52■□□□□ 0.56
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RABGGTA-216ENST00000560243 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
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RABGGTA-216ENST00000560243 MLH3Q9UHC1 1453 aa18.46■□□□□ 0.54
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RABGGTA-216ENST00000560243 CCDC141Q6ZP82 1450 aa18.28■□□□□ 0.52
RABGGTA-216ENST00000560243 A2MP01023 1474 aa18.27■□□□□ 0.52
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RABGGTA-216ENST00000560243 TSPY10P0CW01 314 aa18.18■□□□□ 0.5
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RABGGTA-216ENST00000560243 MROH2AA6NES4 1674 aa18.13■□□□□ 0.49
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RABGGTA-216ENST00000560243 ZMYM3Q14202 1370 aa18.12■□□□□ 0.49
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RABGGTA-216ENST00000560243 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 DAPK1P53355 1430 aa18.09■□□□□ 0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 SHANK2Q9UPX8 1470 aa18.07■□□□□ 0.48
RABGGTA-216ENST00000560243 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa18.06■□□□□ 0.48
RABGGTA-216ENST00000560243 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.06■□□□□ 0.48
RABGGTA-216ENST00000560243 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
RABGGTA-216ENST00000560243 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa18.05■□□□□ 0.48
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