RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 GLI2P10070 1586 aa26.01■■□□□ 1.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.01■■□□□ 1.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 DIP2BQ9P265 1576 aa26■■□□□ 1.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26■■□□□ 1.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.99■■□□□ 1.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.99■■□□□ 1.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 CD109Q6YHK3 1445 aa25.98■■□□□ 1.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.96■■□□□ 1.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.95■■□□□ 1.74
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.94■■□□□ 1.74
USP3-AS1-201ENST00000558831 FANCAO15360 1455 aa25.9■■□□□ 1.74
USP3-AS1-201ENST00000558831 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.9■■□□□ 1.74
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.89■■□□□ 1.74
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.89■■□□□ 1.73
USP3-AS1-201ENST00000558831 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.86■■□□□ 1.73
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.83■■□□□ 1.73
USP3-AS1-201ENST00000558831 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
USP3-AS1-201ENST00000558831 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.81■■□□□ 1.72
USP3-AS1-201ENST00000558831 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.81■■□□□ 1.72
USP3-AS1-201ENST00000558831 ABCC1P33527 1531 aa25.81■■□□□ 1.72
USP3-AS1-201ENST00000558831 NEO1Q92859 1461 aa25.81■■□□□ 1.72
USP3-AS1-201ENST00000558831 TSPOAP1O95153 1857 aa25.8■■□□□ 1.72
USP3-AS1-201ENST00000558831 DAPK1P53355 1430 aa25.8■■□□□ 1.72
USP3-AS1-201ENST00000558831 AKNAQ7Z591 1439 aa25.8■■□□□ 1.72
USP3-AS1-201ENST00000558831 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.8■■□□□ 1.72
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.79■■□□□ 1.72
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADGRL1O94910 1474 aa25.79■■□□□ 1.72
USP3-AS1-201ENST00000558831 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.79■■□□□ 1.72
USP3-AS1-201ENST00000558831 MBD5Q9P267 1494 aa25.78■■□□□ 1.72
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
USP3-AS1-201ENST00000558831 ABCC5O15440 1437 aa25.78■■□□□ 1.72
USP3-AS1-201ENST00000558831 PTPRKQ15262 1439 aa25.76■■□□□ 1.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.76■■□□□ 1.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.75■■□□□ 1.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.75■■□□□ 1.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.74■■□□□ 1.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.73■■□□□ 1.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 TSPY4P0CV99 314 aa25.73■■□□□ 1.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 TSPY10P0CW01 314 aa25.73■■□□□ 1.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.71■■□□□ 1.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.69■■□□□ 1.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.68■■□□□ 1.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.68■■□□□ 1.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.65■■□□□ 1.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 ROCK1Q13464 1354 aa25.65■■□□□ 1.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.65■■□□□ 1.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 AFAP1Q8N556 730 aa25.64■■□□□ 1.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.64■■□□□ 1.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.64■■□□□ 1.69
USP3-AS1-201ENST00000558831 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.63■■□□□ 1.69
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.63■■□□□ 1.69
USP3-AS1-201ENST00000558831 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.62■■□□□ 1.69
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADGRL2O95490 1459 aa25.62■■□□□ 1.69
USP3-AS1-201ENST00000558831 HFM1A2PYH4 1435 aa25.61■■□□□ 1.69
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
USP3-AS1-201ENST00000558831 NCOA1Q15788 1441 aa25.6■■□□□ 1.69
USP3-AS1-201ENST00000558831 NAIPQ13075 1403 aa25.58■■□□□ 1.69
USP3-AS1-201ENST00000558831 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.57■■□□□ 1.68
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAPGEF3O95398 923 aa25.56■■□□□ 1.68
USP3-AS1-201ENST00000558831 KDM5CP41229 1560 aa25.56■■□□□ 1.68
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.56■■□□□ 1.68
USP3-AS1-201ENST00000558831 RICTORQ6R327 1708 aa25.55■■□□□ 1.68
USP3-AS1-201ENST00000558831 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.55■■□□□ 1.68
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.54■■□□□ 1.68
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATP7AQ04656 1500 aa25.54■■□□□ 1.68
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLXNC1O60486 1568 aa25.53■■□□□ 1.68
USP3-AS1-201ENST00000558831 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIF15Q9NS87 1388 aa25.52■■□□□ 1.68
USP3-AS1-201ENST00000558831 HRCP23327 699 aa25.51■■□□□ 1.67
USP3-AS1-201ENST00000558831 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.51■■□□□ 1.67
USP3-AS1-201ENST00000558831 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.5■■□□□ 1.67
USP3-AS1-201ENST00000558831 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.49■■□□□ 1.67
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.47■■□□□ 1.67
USP3-AS1-201ENST00000558831 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.46■■□□□ 1.67
USP3-AS1-201ENST00000558831 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.45■■□□□ 1.66
USP3-AS1-201ENST00000558831 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.45■■□□□ 1.66
USP3-AS1-201ENST00000558831 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.43■■□□□ 1.66
USP3-AS1-201ENST00000558831 KDM6BO15054 1643 aa25.42■■□□□ 1.66
USP3-AS1-201ENST00000558831 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRIM52Q96A61 297 aa25.4■■□□□ 1.66
USP3-AS1-201ENST00000558831 ERBINQ96RT1 1412 aa25.39■■□□□ 1.65
USP3-AS1-201ENST00000558831 ABCA6Q8N139 1617 aa25.37■■□□□ 1.65
USP3-AS1-201ENST00000558831 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
USP3-AS1-201ENST00000558831 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.35■■□□□ 1.65
USP3-AS1-201ENST00000558831 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.35■■□□□ 1.65
USP3-AS1-201ENST00000558831 A2MP01023 1474 aa25.35■■□□□ 1.65
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATP10AO60312 1499 aa25.3■■□□□ 1.64
USP3-AS1-201ENST00000558831 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
USP3-AS1-201ENST00000558831 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.28■■□□□ 1.64
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.28■■□□□ 1.64
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIF3BO15066 747 aa25.26■■□□□ 1.63
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