RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557413.5

RPS6KL1-216, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RPS6KL1, Length 2,425 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-216ENST00000557413 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
RPS6KL1-216ENST00000557413 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
RPS6KL1-216ENST00000557413 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
RPS6KL1-216ENST00000557413 ADAMTS12P58397 1594 aa28.45■■■□□ 2.14
RPS6KL1-216ENST00000557413 ERICH6BQ5W0A0 696 aa28.44■■■□□ 2.14
RPS6KL1-216ENST00000557413 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.44■■■□□ 2.14
RPS6KL1-216ENST00000557413 ROCK1Q13464 1354 aa28.43■■■□□ 2.14
RPS6KL1-216ENST00000557413 DAPK1P53355 1430 aa28.43■■■□□ 2.14
RPS6KL1-216ENST00000557413 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.41■■■□□ 2.14
RPS6KL1-216ENST00000557413 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.4■■■□□ 2.14
RPS6KL1-216ENST00000557413 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.4■■■□□ 2.14
RPS6KL1-216ENST00000557413 MRS2Q9HD23 443 aa28.39■■■□□ 2.14
RPS6KL1-216ENST00000557413 MSH5O43196 834 aa28.39■■■□□ 2.13
RPS6KL1-216ENST00000557413 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.13
RPS6KL1-216ENST00000557413 PPP4R2Q9NY27 417 aa28.37■■■□□ 2.13
RPS6KL1-216ENST00000557413 FANCIQ9NVI1 1328 aa28.37■■■□□ 2.13
RPS6KL1-216ENST00000557413 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
RPS6KL1-216ENST00000557413 ABCC5O15440 1437 aa28.36■■■□□ 2.13
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZBED9Q6R2W3 1325 aa28.35■■■□□ 2.13
RPS6KL1-216ENST00000557413 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.34■■■□□ 2.13
RPS6KL1-216ENST00000557413 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
RPS6KL1-216ENST00000557413 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.33■■■□□ 2.13
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
RPS6KL1-216ENST00000557413 KIAA0556O60303 1618 aa28.25■■■□□ 2.11
RPS6KL1-216ENST00000557413 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
RPS6KL1-216ENST00000557413 DISP1Q96F81 1524 aa28.23■■■□□ 2.11
RPS6KL1-216ENST00000557413 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.21■■■□□ 2.11
RPS6KL1-216ENST00000557413 PZPP20742 1482 aa28.2■■■□□ 2.1
RPS6KL1-216ENST00000557413 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.19■■■□□ 2.1
RPS6KL1-216ENST00000557413 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa28.19■■■□□ 2.1
RPS6KL1-216ENST00000557413 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.18■■■□□ 2.1
RPS6KL1-216ENST00000557413 ERICH6Q7L0X2 663 aa28.16■■■□□ 2.1
RPS6KL1-216ENST00000557413 BCL11AQ9H165 835 aa28.14■■■□□ 2.1
RPS6KL1-216ENST00000557413 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.14■■■□□ 2.1
RPS6KL1-216ENST00000557413 MBD5Q9P267 1494 aa28.14■■■□□ 2.1
RPS6KL1-216ENST00000557413 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.14■■■□□ 2.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.1■■■□□ 2.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 USP47Q96K76 1375 aa28.1■■■□□ 2.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.1■■■□□ 2.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.09■■■□□ 2.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 IFT140Q96RY7 1462 aa28.08■■■□□ 2.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.08
RPS6KL1-216ENST00000557413 KIF14Q15058 1648 aa28.07■■■□□ 2.08
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
RPS6KL1-216ENST00000557413 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.06■■■□□ 2.08
RPS6KL1-216ENST00000557413 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
RPS6KL1-216ENST00000557413 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.04■■■□□ 2.08
RPS6KL1-216ENST00000557413 ADGRL2O95490 1459 aa28.04■■■□□ 2.08
RPS6KL1-216ENST00000557413 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
RPS6KL1-216ENST00000557413 GRIN2AQ12879 1464 aa28.04■■■□□ 2.08
RPS6KL1-216ENST00000557413 PKD2Q13563 968 aa28.03■■■□□ 2.08
RPS6KL1-216ENST00000557413 KDM5CP41229 1560 aa28.03■■■□□ 2.08
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RPS6KL1-216ENST00000557413 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.98■■■□□ 2.07
RPS6KL1-216ENST00000557413 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.96■■■□□ 2.07
RPS6KL1-216ENST00000557413 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.94■■■□□ 2.06
RPS6KL1-216ENST00000557413 RNF123Q5XPI4 1314 aa27.94■■■□□ 2.06
RPS6KL1-216ENST00000557413 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
RPS6KL1-216ENST00000557413 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
RPS6KL1-216ENST00000557413 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.92■■■□□ 2.06
RPS6KL1-216ENST00000557413 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.92■■■□□ 2.06
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RPS6KL1-216ENST00000557413 CCDC136Q96JN2 1154 aa27.88■■■□□ 2.05
RPS6KL1-216ENST00000557413 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.88■■■□□ 2.05
RPS6KL1-216ENST00000557413 NUP155O75694 1391 aa27.86■■■□□ 2.05
RPS6KL1-216ENST00000557413 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.86■■■□□ 2.05
RPS6KL1-216ENST00000557413 CEP170Q5SW79 1584 aa27.84■■■□□ 2.05
RPS6KL1-216ENST00000557413 KIF15Q9NS87 1388 aa27.84■■■□□ 2.05
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RPS6KL1-216ENST00000557413 ERCC6Q03468 1493 aa27.81■■■□□ 2.04
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RPS6KL1-216ENST00000557413 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
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RPS6KL1-216ENST00000557413 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
RPS6KL1-216ENST00000557413 SYNJ2O15056 1496 aa27.76■■■□□ 2.03
RPS6KL1-216ENST00000557413 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.76■■■□□ 2.03
RPS6KL1-216ENST00000557413 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
RPS6KL1-216ENST00000557413 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
RPS6KL1-216ENST00000557413 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.74■■■□□ 2.03
RPS6KL1-216ENST00000557413 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.73■■■□□ 2.03
RPS6KL1-216ENST00000557413 TSPY4P0CV99 314 aa27.73■■■□□ 2.03
RPS6KL1-216ENST00000557413 TSPY10P0CW01 314 aa27.73■■■□□ 2.03
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