RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557383.1

RPS6KL1-215, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

TSL 2

Gene RPS6KL1, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-215ENST00000557383 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.35■■□□□ 1.33
RPS6KL1-215ENST00000557383 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.33■■□□□ 1.33
RPS6KL1-215ENST00000557383 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.33■■□□□ 1.33
RPS6KL1-215ENST00000557383 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
RPS6KL1-215ENST00000557383 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
RPS6KL1-215ENST00000557383 KIF14Q15058 1648 aa23.29■■□□□ 1.32
RPS6KL1-215ENST00000557383 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.27■■□□□ 1.32
RPS6KL1-215ENST00000557383 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
RPS6KL1-215ENST00000557383 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.24■■□□□ 1.31
RPS6KL1-215ENST00000557383 FBXO41Q8TF61 875 aa23.24■■□□□ 1.31
RPS6KL1-215ENST00000557383 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.24■■□□□ 1.31
RPS6KL1-215ENST00000557383 ATP10AO60312 1499 aa23.24■■□□□ 1.31
RPS6KL1-215ENST00000557383 CLIP1P30622 1438 aa23.22■■□□□ 1.31
RPS6KL1-215ENST00000557383 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.22■■□□□ 1.31
RPS6KL1-215ENST00000557383 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.21■■□□□ 1.31
RPS6KL1-215ENST00000557383 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.21■■□□□ 1.31
RPS6KL1-215ENST00000557383 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.2■■□□□ 1.3
RPS6KL1-215ENST00000557383 MLECQ14165 292 aa23.2■■□□□ 1.3
RPS6KL1-215ENST00000557383 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.19■■□□□ 1.3
RPS6KL1-215ENST00000557383 KDM5CP41229 1560 aa23.18■■□□□ 1.3
RPS6KL1-215ENST00000557383 HSPA2P54652 639 aa23.17■■□□□ 1.3
RPS6KL1-215ENST00000557383 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.14■■□□□ 1.3
RPS6KL1-215ENST00000557383 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.14■■□□□ 1.29
RPS6KL1-215ENST00000557383 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.13■■□□□ 1.29
RPS6KL1-215ENST00000557383 AFAP1Q8N556 730 aa23.13■■□□□ 1.29
RPS6KL1-215ENST00000557383 PREX2Q70Z35 1606 aa23.12■■□□□ 1.29
RPS6KL1-215ENST00000557383 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.11■■□□□ 1.29
RPS6KL1-215ENST00000557383 REREQ9P2R6 1566 aa23.1■■□□□ 1.29
RPS6KL1-215ENST00000557383 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.09■■□□□ 1.29
RPS6KL1-215ENST00000557383 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.08■■□□□ 1.29
RPS6KL1-215ENST00000557383 ABCC1P33527 1531 aa23.08■■□□□ 1.28
RPS6KL1-215ENST00000557383 ABCA6Q8N139 1617 aa23.07■■□□□ 1.28
RPS6KL1-215ENST00000557383 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.05■■□□□ 1.28
RPS6KL1-215ENST00000557383 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.05■■□□□ 1.28
RPS6KL1-215ENST00000557383 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.05■■□□□ 1.28
RPS6KL1-215ENST00000557383 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
RPS6KL1-215ENST00000557383 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.04■■□□□ 1.28
RPS6KL1-215ENST00000557383 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.03■■□□□ 1.28
RPS6KL1-215ENST00000557383 AGLP35573 1532 aa23.01■■□□□ 1.27
RPS6KL1-215ENST00000557383 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
RPS6KL1-215ENST00000557383 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.98■■□□□ 1.27
RPS6KL1-215ENST00000557383 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.96■■□□□ 1.27
RPS6KL1-215ENST00000557383 C3P01024 1663 aa22.96■■□□□ 1.27
RPS6KL1-215ENST00000557383 CERKQ8TCT0 537 aa22.95■■□□□ 1.26
RPS6KL1-215ENST00000557383 STRCQ7RTU9 1775 aa22.94■■□□□ 1.26
RPS6KL1-215ENST00000557383 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.93■■□□□ 1.26
RPS6KL1-215ENST00000557383 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
RPS6KL1-215ENST00000557383 CEP162Q5TB80 1403 aa22.92■■□□□ 1.26
RPS6KL1-215ENST00000557383 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
RPS6KL1-215ENST00000557383 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.9■■□□□ 1.26
RPS6KL1-215ENST00000557383 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
RPS6KL1-215ENST00000557383 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.89■■□□□ 1.25
RPS6KL1-215ENST00000557383 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.89■■□□□ 1.25
RPS6KL1-215ENST00000557383 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.88■■□□□ 1.25
RPS6KL1-215ENST00000557383 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
RPS6KL1-215ENST00000557383 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.85■■□□□ 1.25
RPS6KL1-215ENST00000557383 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.85■■□□□ 1.25
RPS6KL1-215ENST00000557383 ATP7AQ04656 1500 aa22.83■■□□□ 1.25
RPS6KL1-215ENST00000557383 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
RPS6KL1-215ENST00000557383 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
RPS6KL1-215ENST00000557383 MROH2AA6NES4 1674 aa22.83■■□□□ 1.24
RPS6KL1-215ENST00000557383 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KL1-215ENST00000557383 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
RPS6KL1-215ENST00000557383 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
RPS6KL1-215ENST00000557383 PTPRTO14522 1441 aa22.81■■□□□ 1.24
RPS6KL1-215ENST00000557383 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.8■■□□□ 1.24
RPS6KL1-215ENST00000557383 PLXNC1O60486 1568 aa22.8■■□□□ 1.24
RPS6KL1-215ENST00000557383 NPATQ14207 1427 aa22.79■■□□□ 1.24
RPS6KL1-215ENST00000557383 A2MP01023 1474 aa22.77■■□□□ 1.24
RPS6KL1-215ENST00000557383 NCOA1Q15788 1441 aa22.76■■□□□ 1.23
RPS6KL1-215ENST00000557383 ZMYM3Q14202 1370 aa22.76■■□□□ 1.23
RPS6KL1-215ENST00000557383 TIAM1Q13009 1591 aa22.75■■□□□ 1.23
RPS6KL1-215ENST00000557383 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.74■■□□□ 1.23
RPS6KL1-215ENST00000557383 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
RPS6KL1-215ENST00000557383 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.72■■□□□ 1.23
RPS6KL1-215ENST00000557383 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.71■■□□□ 1.23
RPS6KL1-215ENST00000557383 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.7■■□□□ 1.22
RPS6KL1-215ENST00000557383 MBD5Q9P267 1494 aa22.69■■□□□ 1.22
RPS6KL1-215ENST00000557383 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
RPS6KL1-215ENST00000557383 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
RPS6KL1-215ENST00000557383 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.67■■□□□ 1.22
RPS6KL1-215ENST00000557383 PTPRKQ15262 1439 aa22.66■■□□□ 1.22
RPS6KL1-215ENST00000557383 GGT6Q6P531 493 aa22.66■■□□□ 1.22
RPS6KL1-215ENST00000557383 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.65■■□□□ 1.22
RPS6KL1-215ENST00000557383 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.65■■□□□ 1.22
RPS6KL1-215ENST00000557383 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.65■■□□□ 1.22
RPS6KL1-215ENST00000557383 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.64■■□□□ 1.21
RPS6KL1-215ENST00000557383 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
RPS6KL1-215ENST00000557383 PLA2R1Q13018 1463 aa22.61■■□□□ 1.21
RPS6KL1-215ENST00000557383 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
RPS6KL1-215ENST00000557383 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.59■■□□□ 1.21
RPS6KL1-215ENST00000557383 NCOA2Q15596 1464 aa22.59■■□□□ 1.21
RPS6KL1-215ENST00000557383 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
RPS6KL1-215ENST00000557383 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.58■■□□□ 1.2
RPS6KL1-215ENST00000557383 PKD2Q13563 968 aa22.57■■□□□ 1.2
RPS6KL1-215ENST00000557383 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.57■■□□□ 1.2
RPS6KL1-215ENST00000557383 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.54■■□□□ 1.2
RPS6KL1-215ENST00000557383 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.53■■□□□ 1.2
RPS6KL1-215ENST00000557383 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.53■■□□□ 1.2
RPS6KL1-215ENST00000557383 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms