RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556785.1

EGLN3-210, Transcript of egl-9 family hypoxia inducible factor 3, humanhuman

TSL 2

Gene EGLN3, Length 864 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGLN3-210ENST00000556785 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.62
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EGLN3-210ENST00000556785 FOXD4L1Q9NU39 408 aa11.19□□□□□ -0.62
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EGLN3-210ENST00000556785 TEX14Q8IWB6 1497 aa11.18□□□□□ -0.62
EGLN3-210ENST00000556785 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
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EGLN3-210ENST00000556785 VPS8Q8N3P4 1428 aa11.17□□□□□ -0.62
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EGLN3-210ENST00000556785 CFAP74Q9C0B2 1584 aa11.11□□□□□ -0.63
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EGLN3-210ENST00000556785 ADGRL1O94910 1474 aa11.05□□□□□ -0.64
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EGLN3-210ENST00000556785 MAGI2Q86UL8 1455 aa10.93□□□□□ -0.66
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EGLN3-210ENST00000556785 MLH3Q9UHC1 1453 aa10.91□□□□□ -0.66
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EGLN3-210ENST00000556785 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP10.9□□□□□ -0.663e-9■■■□□ 16.3
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EGLN3-210ENST00000556785 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
EGLN3-210ENST00000556785 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
EGLN3-210ENST00000556785 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
EGLN3-210ENST00000556785 PLXNC1O60486 1568 aa10.85□□□□□ -0.67
EGLN3-210ENST00000556785 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
EGLN3-210ENST00000556785 MAST1Q9Y2H9 1570 aa10.84□□□□□ -0.67
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EGLN3-210ENST00000556785 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa10.82□□□□□ -0.68
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