RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554738.5

NRXN3-208, Transcript of neurexin 3, human

TSL 5

Gene NRXN3, Length 6,446 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NRXN3-208	ENST00000554738	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NRXN3-208	ENST00000554738	PLCB2	Q00722	1185 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NRXN3-208	ENST00000554738	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NRXN3-208	ENST00000554738	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NRXN3-208	ENST00000554738	SOGA1	O94964	1423 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NRXN3-208	ENST00000554738	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NRXN3-208	ENST00000554738	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NRXN3-208	ENST00000554738	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NRXN3-208	ENST00000554738	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NRXN3-208	ENST00000554738	PKD2	Q13563	968 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NRXN3-208	ENST00000554738	FMN1	Q68DA7	1419 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NRXN3-208	ENST00000554738	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NRXN3-208	ENST00000554738	RALBP1	Q15311	655 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NRXN3-208	ENST00000554738	SMARCA2	P51531	1590 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NRXN3-208	ENST00000554738	PTMS	P20962	102 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NRXN3-208	ENST00000554738	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NRXN3-208	ENST00000554738	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NRXN3-208	ENST00000554738	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NRXN3-208	ENST00000554738	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NRXN3-208	ENST00000554738	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NRXN3-208	ENST00000554738	MLEC	Q14165	292 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NRXN3-208	ENST00000554738	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NRXN3-208	ENST00000554738	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NRXN3-208	ENST00000554738	GGT6	Q6P531	493 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN3-208	ENST00000554738	SOX12	O15370	315 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN3-208	ENST00000554738	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	13.51	□□□□□ -0.25
NRXN3-208	ENST00000554738	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
NRXN3-208	ENST00000554738	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN3-208	ENST00000554738	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN3-208	ENST00000554738	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN3-208	ENST00000554738	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NRXN3-208	ENST00000554738	STK26	Q9P289	416 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN3-208	ENST00000554738	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN3-208	ENST00000554738	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NRXN3-208	ENST00000554738	NUP155	O75694	1391 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN3-208	ENST00000554738	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NRXN3-208	ENST00000554738	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN3-208	ENST00000554738	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
NRXN3-208	ENST00000554738	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	13.47	□□□□□ -0.25
NRXN3-208	ENST00000554738	GBP4	Q96PP9	640 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN3-208	ENST00000554738	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN3-208	ENST00000554738	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN3-208	ENST00000554738	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NRXN3-208	ENST00000554738	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
NRXN3-208	ENST00000554738	DRC7	Q8IY82	874 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NRXN3-208	ENST00000554738	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NRXN3-208	ENST00000554738	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NRXN3-208	ENST00000554738	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NRXN3-208	ENST00000554738	ABCC8	Q09428	1581 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NRXN3-208	ENST00000554738	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NRXN3-208	ENST00000554738	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NRXN3-208	ENST00000554738	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NRXN3-208	ENST00000554738	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NRXN3-208	ENST00000554738	STK31	Q9BXU1	1019 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NRXN3-208	ENST00000554738	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NRXN3-208	ENST00000554738	GPATCH3	Q96I76	525 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NRXN3-208	ENST00000554738	FOXD1	Q16676	465 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NRXN3-208	ENST00000554738	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NRXN3-208	ENST00000554738	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NRXN3-208	ENST00000554738	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NRXN3-208	ENST00000554738	HMMR	O75330	724 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NRXN3-208	ENST00000554738	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NRXN3-208	ENST00000554738	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NRXN3-208	ENST00000554738	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NRXN3-208	ENST00000554738	APBB1	O00213	710 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NRXN3-208	ENST00000554738	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
NRXN3-208	ENST00000554738	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
NRXN3-208	ENST00000554738	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		13.4	□□□□□ -0.27
NRXN3-208	ENST00000554738	CLSTN1	O94985	981 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NRXN3-208	ENST00000554738	PDE3B	Q13370	1112 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NRXN3-208	ENST00000554738	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
NRXN3-208	ENST00000554738	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NRXN3-208	ENST00000554738	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
NRXN3-208	ENST00000554738	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
NRXN3-208	ENST00000554738	EID1	Q9Y6B2	187 aa		13.38	□□□□□ -0.27
NRXN3-208	ENST00000554738	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		13.38	□□□□□ -0.27
NRXN3-208	ENST00000554738	TPM4	P67936	248 aa		13.37	□□□□□ -0.27
NRXN3-208	ENST00000554738	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
NRXN3-208	ENST00000554738	KIF3B	O15066	747 aa		13.37	□□□□□ -0.27
NRXN3-208	ENST00000554738	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		13.36	□□□□□ -0.27
NRXN3-208	ENST00000554738	GORAB	Q5T7V8	394 aa		13.36	□□□□□ -0.27
NRXN3-208	ENST00000554738	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		13.36	□□□□□ -0.27
NRXN3-208	ENST00000554738	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
NRXN3-208	ENST00000554738	NLRP13	Q86W25	1043 aa		13.36	□□□□□ -0.27
NRXN3-208	ENST00000554738	UACA	Q9BZF9	1416 aa		13.34	□□□□□ -0.27
NRXN3-208	ENST00000554738	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
NRXN3-208	ENST00000554738	KIF15	Q9NS87	1388 aa		13.34	□□□□□ -0.27
NRXN3-208	ENST00000554738	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
NRXN3-208	ENST00000554738	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		13.33	□□□□□ -0.27
NRXN3-208	ENST00000554738	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	13.33	□□□□□ -0.28
NRXN3-208	ENST00000554738	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		13.33	□□□□□ -0.28
NRXN3-208	ENST00000554738	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NRXN3-208	ENST00000554738	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NRXN3-208	ENST00000554738	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
NRXN3-208	ENST00000554738	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
NRXN3-208	ENST00000554738	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NRXN3-208	ENST00000554738	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
NRXN3-208	ENST00000554738	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NRXN3-208	ENST00000554738	AMPH	P49418	695 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NRXN3-208	ENST00000554738	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28

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