RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554669.5

LINC01578-203, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1578, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC01578, Length 578 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01578-203ENST00000554669 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa45.86■■■■■ 4.93
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LINC01578-203ENST00000554669 POGZQ7Z3K3 1410 aa45.82■■■■■ 4.93
LINC01578-203ENST00000554669 VPS8Q8N3P4 1428 aa45.82■■■■■ 4.93
LINC01578-203ENST00000554669 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa45.8■■■■■ 4.92
LINC01578-203ENST00000554669 MTUS2Q5JR59 1369 aa45.79■■■■■ 4.92
LINC01578-203ENST00000554669 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa45.77■■■■■ 4.92
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LINC01578-203ENST00000554669 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP45.73■■■■■ 4.91
LINC01578-203ENST00000554669 YEATS2Q9ULM3 1422 aa45.69■■■■■ 4.91
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LINC01578-203ENST00000554669 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa45.64■■■■■ 4.9
LINC01578-203ENST00000554669 MAGI2Q86UL8 1455 aa45.64■■■■■ 4.9
LINC01578-203ENST00000554669 AFAP1Q8N556 730 aa45.63■■■■■ 4.9
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LINC01578-203ENST00000554669 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa45.57■■■■■ 4.89
LINC01578-203ENST00000554669 ITSN2Q9NZM3 1697 aa45.53■■■■■ 4.88
LINC01578-203ENST00000554669 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa45.53■■■■■ 4.88
LINC01578-203ENST00000554669 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP45.53■■■■■ 4.88
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LINC01578-203ENST00000554669 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa45.47■■■■■ 4.87
LINC01578-203ENST00000554669 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP45.47■■■■■ 4.87
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LINC01578-203ENST00000554669 MAP3K1Q13233 1512 aa45.46■■■■■ 4.87
LINC01578-203ENST00000554669 BCORL1Q5H9F3 1711 aa45.44■■■■■ 4.87
LINC01578-203ENST00000554669 SYCP2Q9BX26 1530 aa45.44■■■■■ 4.86
LINC01578-203ENST00000554669 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP45.43■■■■■ 4.86
LINC01578-203ENST00000554669 ATP10AO60312 1499 aa45.42■■■■■ 4.86
LINC01578-203ENST00000554669 HECW2Q9P2P5 1572 aa45.42■■■■■ 4.86
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LINC01578-203ENST00000554669 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP45.4■■■■■ 4.86
LINC01578-203ENST00000554669 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP45.39■■■■■ 4.86
LINC01578-203ENST00000554669 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa45.38■■■■■ 4.86
LINC01578-203ENST00000554669 C9orf84Q5VXU9 1444 aa45.36■■■■■ 4.85
LINC01578-203ENST00000554669 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa45.35■■■■■ 4.85
LINC01578-203ENST00000554669 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa45.34■■■■■ 4.85
LINC01578-203ENST00000554669 ABCA6Q8N139 1617 aa45.32■■■■■ 4.85
LINC01578-203ENST00000554669 APLP2Q06481 763 aa45.3■■■■■ 4.84
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LINC01578-203ENST00000554669 MYT1LQ9UL68 1186 aa45.29■■■■■ 4.84
LINC01578-203ENST00000554669 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa45.28■■■■■ 4.84
LINC01578-203ENST00000554669 MBD5Q9P267 1494 aa45.25■■■■■ 4.83
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LINC01578-203ENST00000554669 REREQ9P2R6 1566 aa45.21■■■■■ 4.83
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LINC01578-203ENST00000554669 MYOM3Q5VTT5 1437 aa45.04■■■■■ 4.8
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LINC01578-203ENST00000554669 CCDC141Q6ZP82 1450 aa44.99■■■■■ 4.79
LINC01578-203ENST00000554669 MIA2Q96PC5 1412 aa44.97■■■■■ 4.79
LINC01578-203ENST00000554669 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa44.95■■■■■ 4.79
LINC01578-203ENST00000554669 ARHGEF5Q12774 1597 aa44.94■■■■■ 4.79
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LINC01578-203ENST00000554669 A2MP01023 1474 aa44.92■■■■■ 4.78
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LINC01578-203ENST00000554669 PLPPR3Q6T4P5 718 aa44.87■■■■■ 4.77
LINC01578-203ENST00000554669 ADGBQ8N7X0 1667 aa44.83■■■■■ 4.77
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LINC01578-203ENST00000554669 C3P01024 1663 aa44.64■■■■■ 4.74
LINC01578-203ENST00000554669 GGT6Q6P531 493 aa44.63■■■■■ 4.74
LINC01578-203ENST00000554669 CNTLNQ9NXG0 1405 aa44.63■■■■■ 4.73
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LINC01578-203ENST00000554669 CROCC2H7BZ55 1655 aa44.55■■■■■ 4.72
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LINC01578-203ENST00000554669 SHANK2Q9UPX8 1470 aa44.53■■■■■ 4.72
LINC01578-203ENST00000554669 MROH2AA6NES4 1674 aa44.53■■■■■ 4.72
LINC01578-203ENST00000554669 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP44.53■■■■■ 4.72
LINC01578-203ENST00000554669 ZMYM3Q14202 1370 aa44.52■■■■■ 4.72
LINC01578-203ENST00000554669 HSPA2P54652 639 aa44.5■■■■■ 4.71
LINC01578-203ENST00000554669 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP44.49■■■■■ 4.71
LINC01578-203ENST00000554669 PPP6R1Q9UPN7 881 aa44.49■■■■■ 4.71
LINC01578-203ENST00000554669 PREX1Q8TCU6 1659 aa44.46■■■■■ 4.71
LINC01578-203ENST00000554669 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP44.39■■■■■ 4.7
LINC01578-203ENST00000554669 KIF15Q9NS87 1388 aa44.39■■■■■ 4.7
LINC01578-203ENST00000554669 DUOX2Q9NRD8 1548 aa44.39■■■■■ 4.7
LINC01578-203ENST00000554669 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa44.37■■■■■ 4.69
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