RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551127.5

TPCN1-218, Transcript of two pore segment channel 1, humanhuman

TSL 2

Gene TPCN1, Length 2,975 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1-218ENST00000551127 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
TPCN1-218ENST00000551127 UACAQ9BZF9 1416 aa18.71■□□□□ 0.59
TPCN1-218ENST00000551127 NCOA2Q15596 1464 aa18.7■□□□□ 0.58
TPCN1-218ENST00000551127 OSCARQ8IYS5 282 aa18.69■□□□□ 0.58
TPCN1-218ENST00000551127 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.68■□□□□ 0.58
TPCN1-218ENST00000551127 HFM1A2PYH4 1435 aa18.68■□□□□ 0.58
TPCN1-218ENST00000551127 HECW1Q76N89 1606 aa18.67■□□□□ 0.58
TPCN1-218ENST00000551127 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa18.67■□□□□ 0.58
TPCN1-218ENST00000551127 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.66■□□□□ 0.58
TPCN1-218ENST00000551127 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
TPCN1-218ENST00000551127 FGD6Q6ZV73 1430 aa18.62■□□□□ 0.57
TPCN1-218ENST00000551127 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.61■□□□□ 0.57
TPCN1-218ENST00000551127 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
TPCN1-218ENST00000551127 CNTLNQ9NXG0 1405 aa18.6■□□□□ 0.57
TPCN1-218ENST00000551127 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.6■□□□□ 0.57
TPCN1-218ENST00000551127 ZBED9Q6R2W3 1325 aa18.59■□□□□ 0.57
TPCN1-218ENST00000551127 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
TPCN1-218ENST00000551127 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
TPCN1-218ENST00000551127 SHROOM2Q13796 1616 aa18.57■□□□□ 0.56
TPCN1-218ENST00000551127 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.57■□□□□ 0.56
TPCN1-218ENST00000551127 ATP10BO94823 1461 aa18.56■□□□□ 0.56
TPCN1-218ENST00000551127 PLEKHD1A6NEE1 506 aa18.56■□□□□ 0.56
TPCN1-218ENST00000551127 NAIPQ13075 1403 aa18.56■□□□□ 0.56
TPCN1-218ENST00000551127 PTPRKQ15262 1439 aa18.56■□□□□ 0.56
TPCN1-218ENST00000551127 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.54■□□□□ 0.56
TPCN1-218ENST00000551127 ABCA8O94911 1581 aa18.54■□□□□ 0.56
TPCN1-218ENST00000551127 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
TPCN1-218ENST00000551127 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.55
TPCN1-218ENST00000551127 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa18.51■□□□□ 0.55
TPCN1-218ENST00000551127 NCOA1Q15788 1441 aa18.51■□□□□ 0.55
TPCN1-218ENST00000551127 MYOM3Q5VTT5 1437 aa18.51■□□□□ 0.55
TPCN1-218ENST00000551127 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TPCN1-218ENST00000551127 KIF14Q15058 1648 aa18.49■□□□□ 0.55
TPCN1-218ENST00000551127 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
TPCN1-218ENST00000551127 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
TPCN1-218ENST00000551127 GCC2Q8IWJ2 1684 aa18.48■□□□□ 0.55
TPCN1-218ENST00000551127 CCDC184Q52MB2 194 aa18.48■□□□□ 0.55
TPCN1-218ENST00000551127 RNF123Q5XPI4 1314 aa18.48■□□□□ 0.55
TPCN1-218ENST00000551127 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
TPCN1-218ENST00000551127 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TPCN1-218ENST00000551127 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa18.47■□□□□ 0.55
TPCN1-218ENST00000551127 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
TPCN1-218ENST00000551127 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
TPCN1-218ENST00000551127 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.45■□□□□ 0.54
TPCN1-218ENST00000551127 CYB5RLQ6IPT4 315 aa18.45■□□□□ 0.54
TPCN1-218ENST00000551127 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
TPCN1-218ENST00000551127 CCDC7Q96M83 1385 aa18.44■□□□□ 0.54
TPCN1-218ENST00000551127 ARHGEF11O15085 1522 aa18.43■□□□□ 0.54
TPCN1-218ENST00000551127 AKNAQ7Z591 1439 aa18.43■□□□□ 0.54
TPCN1-218ENST00000551127 ABCC2Q92887 1545 aa18.41■□□□□ 0.54
TPCN1-218ENST00000551127 NBR1Q14596 966 aa18.4■□□□□ 0.54
TPCN1-218ENST00000551127 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
TPCN1-218ENST00000551127 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
TPCN1-218ENST00000551127 MRS2Q9HD23 443 aa18.39■□□□□ 0.53
TPCN1-218ENST00000551127 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
TPCN1-218ENST00000551127 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa18.36■□□□□ 0.53
TPCN1-218ENST00000551127 FAM9BQ8IZU0 186 aa18.36■□□□□ 0.53
TPCN1-218ENST00000551127 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
TPCN1-218ENST00000551127 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
TPCN1-218ENST00000551127 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP18.35■□□□□ 0.53
TPCN1-218ENST00000551127 ADCY10Q96PN6 1610 aa18.34■□□□□ 0.53
TPCN1-218ENST00000551127 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
TPCN1-218ENST00000551127 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
TPCN1-218ENST00000551127 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
TPCN1-218ENST00000551127 NUDCQ9Y266 331 aa18.33■□□□□ 0.52
TPCN1-218ENST00000551127 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP18.3■□□□□ 0.52
TPCN1-218ENST00000551127 TEX14Q8IWB6 1497 aa18.29■□□□□ 0.52
TPCN1-218ENST00000551127 ABCC10Q5T3U5 1492 aa18.29■□□□□ 0.52
TPCN1-218ENST00000551127 CCDC136Q96JN2 1154 aa18.28■□□□□ 0.52
TPCN1-218ENST00000551127 USP35Q9P2H5 1018 aa18.28■□□□□ 0.52
TPCN1-218ENST00000551127 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
TPCN1-218ENST00000551127 MIA2Q96PC5 1412 aa18.28■□□□□ 0.52
TPCN1-218ENST00000551127 KDM6BO15054 1643 aa18.28■□□□□ 0.52
TPCN1-218ENST00000551127 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.27■□□□□ 0.52
TPCN1-218ENST00000551127 TTC37Q6PGP7 1564 aa18.27■□□□□ 0.52
TPCN1-218ENST00000551127 KIF7Q2M1P5 1343 aa18.27■□□□□ 0.52
TPCN1-218ENST00000551127 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa18.27■□□□□ 0.51
TPCN1-218ENST00000551127 L3MBTL2Q969R5 705 aa18.26■□□□□ 0.51
TPCN1-218ENST00000551127 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
TPCN1-218ENST00000551127 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP18.25■□□□□ 0.518e-6■□□□□ 10.5
TPCN1-218ENST00000551127 ABCC5O15440 1437 aa18.25■□□□□ 0.51
TPCN1-218ENST00000551127 DAPK1P53355 1430 aa18.24■□□□□ 0.51
TPCN1-218ENST00000551127 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa18.23■□□□□ 0.51
TPCN1-218ENST00000551127 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
TPCN1-218ENST00000551127 ASXL2Q76L83 1435 aa18.23■□□□□ 0.51
TPCN1-218ENST00000551127 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa18.22■□□□□ 0.51
TPCN1-218ENST00000551127 ARHGAP5Q13017 1502 aa18.22■□□□□ 0.51
TPCN1-218ENST00000551127 MPHOSPH9Q99550 1183 aa18.21■□□□□ 0.51
TPCN1-218ENST00000551127 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa18.21■□□□□ 0.51
TPCN1-218ENST00000551127 FOXD1Q16676 465 aa18.21■□□□□ 0.5
TPCN1-218ENST00000551127 IL27Q8NEV9 243 aa18.19■□□□□ 0.5
TPCN1-218ENST00000551127 NBPF8Q3BBV2 869 aa18.19■□□□□ 0.5
TPCN1-218ENST00000551127 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa18.19■□□□□ 0.5
TPCN1-218ENST00000551127 ITSN2Q9NZM3 1697 aa18.18■□□□□ 0.5
TPCN1-218ENST00000551127 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa18.18■□□□□ 0.5
TPCN1-218ENST00000551127 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa18.18■□□□□ 0.5
TPCN1-218ENST00000551127 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa18.18■□□□□ 0.5
TPCN1-218ENST00000551127 WDR7Q9Y4E6 1490 aa18.17■□□□□ 0.5
TPCN1-218ENST00000551127 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
TPCN1-218ENST00000551127 TSPY4P0CV99 314 aa18.17■□□□□ 0.5
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