RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550724.2

HECTD4-212, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 3

Gene HECTD4, Length 587 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-212ENST00000550724 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.13■■□□□ 1.29
HECTD4-212ENST00000550724 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.11■■□□□ 1.29
HECTD4-212ENST00000550724 RICTORQ6R327 1708 aa23.11■■□□□ 1.29
HECTD4-212ENST00000550724 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
HECTD4-212ENST00000550724 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.09■■□□□ 1.29
HECTD4-212ENST00000550724 AFAP1Q8N556 730 aa23.08■■□□□ 1.29
HECTD4-212ENST00000550724 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.08■■□□□ 1.29
HECTD4-212ENST00000550724 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.08■■□□□ 1.28
HECTD4-212ENST00000550724 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.08■■□□□ 1.28
HECTD4-212ENST00000550724 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.05■■□□□ 1.28
HECTD4-212ENST00000550724 MLECQ14165 292 aa23.05■■□□□ 1.28
HECTD4-212ENST00000550724 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.04■■□□□ 1.28
HECTD4-212ENST00000550724 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.01■■□□□ 1.27
HECTD4-212ENST00000550724 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.01■■□□□ 1.27
HECTD4-212ENST00000550724 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.01■■□□□ 1.27
HECTD4-212ENST00000550724 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
HECTD4-212ENST00000550724 PREX2Q70Z35 1606 aa23■■□□□ 1.27
HECTD4-212ENST00000550724 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.99■■□□□ 1.27
HECTD4-212ENST00000550724 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HECTD4-212ENST00000550724 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.97■■□□□ 1.27
HECTD4-212ENST00000550724 ATP10AO60312 1499 aa22.96■■□□□ 1.27
HECTD4-212ENST00000550724 PTPRMP28827 1452 aa22.96■■□□□ 1.27
HECTD4-212ENST00000550724 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.96■■□□□ 1.27
HECTD4-212ENST00000550724 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.96■■□□□ 1.27
HECTD4-212ENST00000550724 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.265e-6■■□□□ 11.7
HECTD4-212ENST00000550724 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.95■■□□□ 1.26
HECTD4-212ENST00000550724 ABCC1P33527 1531 aa22.94■■□□□ 1.26
HECTD4-212ENST00000550724 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.93■■□□□ 1.26
HECTD4-212ENST00000550724 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.93■■□□□ 1.26
HECTD4-212ENST00000550724 MADDQ8WXG6 1647 aa22.93■■□□□ 1.26
HECTD4-212ENST00000550724 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.92■■□□□ 1.26
HECTD4-212ENST00000550724 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.92■■□□□ 1.26
HECTD4-212ENST00000550724 KDM5CP41229 1560 aa22.9■■□□□ 1.26
HECTD4-212ENST00000550724 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.89■■□□□ 1.25
HECTD4-212ENST00000550724 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.89■■□□□ 1.25
HECTD4-212ENST00000550724 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.88■■□□□ 1.25
HECTD4-212ENST00000550724 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.87■■□□□ 1.25
HECTD4-212ENST00000550724 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
HECTD4-212ENST00000550724 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.87■■□□□ 1.25
HECTD4-212ENST00000550724 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.87■■□□□ 1.25
HECTD4-212ENST00000550724 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
HECTD4-212ENST00000550724 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HECTD4-212ENST00000550724 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.84■■□□□ 1.25
HECTD4-212ENST00000550724 TIAM1Q13009 1591 aa22.84■■□□□ 1.25
HECTD4-212ENST00000550724 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.84■■□□□ 1.25
HECTD4-212ENST00000550724 NCOA2Q15596 1464 aa22.82■■□□□ 1.24
HECTD4-212ENST00000550724 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.82■■□□□ 1.24
HECTD4-212ENST00000550724 ABCA6Q8N139 1617 aa22.81■■□□□ 1.24
HECTD4-212ENST00000550724 APLP2Q06481 763 aa22.79■■□□□ 1.24
HECTD4-212ENST00000550724 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
HECTD4-212ENST00000550724 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
HECTD4-212ENST00000550724 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.78■■□□□ 1.24
HECTD4-212ENST00000550724 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
HECTD4-212ENST00000550724 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.23
HECTD4-212ENST00000550724 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.75■■□□□ 1.23
HECTD4-212ENST00000550724 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.73■■□□□ 1.23
HECTD4-212ENST00000550724 REREQ9P2R6 1566 aa22.72■■□□□ 1.23
HECTD4-212ENST00000550724 ATP7AQ04656 1500 aa22.72■■□□□ 1.23
HECTD4-212ENST00000550724 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.7■■□□□ 1.22
HECTD4-212ENST00000550724 MBD5Q9P267 1494 aa22.7■■□□□ 1.22
HECTD4-212ENST00000550724 AGLP35573 1532 aa22.69■■□□□ 1.22
HECTD4-212ENST00000550724 HSPA2P54652 639 aa22.69■■□□□ 1.22
HECTD4-212ENST00000550724 MAP3K1Q13233 1512 aa22.68■■□□□ 1.22
HECTD4-212ENST00000550724 A2MP01023 1474 aa22.66■■□□□ 1.22
HECTD4-212ENST00000550724 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.66■■□□□ 1.22
HECTD4-212ENST00000550724 GGT6Q6P531 493 aa22.66■■□□□ 1.22
HECTD4-212ENST00000550724 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
HECTD4-212ENST00000550724 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.65■■□□□ 1.22
HECTD4-212ENST00000550724 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.64■■□□□ 1.21
HECTD4-212ENST00000550724 TSPY4P0CV99 314 aa22.63■■□□□ 1.21
HECTD4-212ENST00000550724 TSPY10P0CW01 314 aa22.63■■□□□ 1.21
HECTD4-212ENST00000550724 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.6■■□□□ 1.21
HECTD4-212ENST00000550724 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.6■■□□□ 1.21
HECTD4-212ENST00000550724 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.57■■□□□ 1.2
HECTD4-212ENST00000550724 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
HECTD4-212ENST00000550724 KIF3BO15066 747 aa22.56■■□□□ 1.2
HECTD4-212ENST00000550724 PLXNC1O60486 1568 aa22.55■■□□□ 1.2
HECTD4-212ENST00000550724 MIA2Q96PC5 1412 aa22.55■■□□□ 1.2
HECTD4-212ENST00000550724 ZMYM3Q14202 1370 aa22.54■■□□□ 1.2
HECTD4-212ENST00000550724 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.54■■□□□ 1.2
HECTD4-212ENST00000550724 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.53■■□□□ 1.2
HECTD4-212ENST00000550724 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.52■■□□□ 1.2
HECTD4-212ENST00000550724 C3P01024 1663 aa22.51■■□□□ 1.19
HECTD4-212ENST00000550724 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.48■■□□□ 1.19
HECTD4-212ENST00000550724 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.48■■□□□ 1.19
HECTD4-212ENST00000550724 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
HECTD4-212ENST00000550724 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
HECTD4-212ENST00000550724 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.44■■□□□ 1.18
HECTD4-212ENST00000550724 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.44■■□□□ 1.18
HECTD4-212ENST00000550724 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.42■■□□□ 1.18
HECTD4-212ENST00000550724 NPATQ14207 1427 aa22.41■■□□□ 1.18
HECTD4-212ENST00000550724 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
HECTD4-212ENST00000550724 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.41■■□□□ 1.18
HECTD4-212ENST00000550724 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.41■■□□□ 1.18
HECTD4-212ENST00000550724 MROH2AA6NES4 1674 aa22.41■■□□□ 1.18
HECTD4-212ENST00000550724 ABCC5O15440 1437 aa22.4■■□□□ 1.18
HECTD4-212ENST00000550724 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
HECTD4-212ENST00000550724 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.4■■□□□ 1.18
HECTD4-212ENST00000550724 PTPRKQ15262 1439 aa22.4■■□□□ 1.18
HECTD4-212ENST00000550724 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms