RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547409.1

ATG101-202, Transcript of autophagy related 101, humanhuman

TSL 3

Gene ATG101, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101-202ENST00000547409 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
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ATG101-202ENST00000547409 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.3■■□□□ 1.96
ATG101-202ENST00000547409 ITGAEP38570 1179 aa27.3■■□□□ 1.96
ATG101-202ENST00000547409 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
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ATG101-202ENST00000547409 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.17■■□□□ 1.94
ATG101-202ENST00000547409 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.16■■□□□ 1.94
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ATG101-202ENST00000547409 TSPY10P0CW01 314 aa27.14■■□□□ 1.94
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ATG101-202ENST00000547409 ERBINQ96RT1 1412 aa26.65■■□□□ 1.86
ATG101-202ENST00000547409 ATP10AO60312 1499 aa26.63■■□□□ 1.85
ATG101-202ENST00000547409 KIF3BO15066 747 aa26.63■■□□□ 1.85
ATG101-202ENST00000547409 ABCA6Q8N139 1617 aa26.63■■□□□ 1.85
ATG101-202ENST00000547409 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.62■■□□□ 1.85
ATG101-202ENST00000547409 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.62■■□□□ 1.85
ATG101-202ENST00000547409 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
ATG101-202ENST00000547409 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.56■■□□□ 1.84
ATG101-202ENST00000547409 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
ATG101-202ENST00000547409 NUP155O75694 1391 aa26.55■■□□□ 1.84
ATG101-202ENST00000547409 GGT6Q6P531 493 aa26.54■■□□□ 1.84
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