RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547031.5

KRT8-208, Transcript of keratin 8, humanhuman

TSL 2

Gene KRT8, Length 883 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT8-208ENST00000547031 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.73■■□□□ 1.87
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KRT8-208ENST00000547031 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.72■■□□□ 1.87
KRT8-208ENST00000547031 MLECQ14165 292 aa26.68■■□□□ 1.86
KRT8-208ENST00000547031 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
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KRT8-208ENST00000547031 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.65■■□□□ 1.86
KRT8-208ENST00000547031 HSPA2P54652 639 aa26.65■■□□□ 1.86
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KRT8-208ENST00000547031 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.65■■□□□ 1.86
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KRT8-208ENST00000547031 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
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KRT8-208ENST00000547031 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.48■■□□□ 1.83
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KRT8-208ENST00000547031 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.45■■□□□ 1.82
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KRT8-208ENST00000547031 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.4■■□□□ 1.82
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KRT8-208ENST00000547031 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.37■■□□□ 1.81
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KRT8-208ENST00000547031 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.32■■□□□ 1.8
KRT8-208ENST00000547031 AGLP35573 1532 aa26.32■■□□□ 1.8
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KRT8-208ENST00000547031 C3P01024 1663 aa26.28■■□□□ 1.8
KRT8-208ENST00000547031 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.26■■□□□ 1.79
KRT8-208ENST00000547031 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.24■■□□□ 1.79
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KRT8-208ENST00000547031 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
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KRT8-208ENST00000547031 CEP162Q5TB80 1403 aa26.2■■□□□ 1.78
KRT8-208ENST00000547031 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.19■■□□□ 1.78
KRT8-208ENST00000547031 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.16■■□□□ 1.78
KRT8-208ENST00000547031 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.16■■□□□ 1.78
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KRT8-208ENST00000547031 ATP7AQ04656 1500 aa26.09■■□□□ 1.77
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KRT8-208ENST00000547031 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.05■■□□□ 1.76
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KRT8-208ENST00000547031 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
KRT8-208ENST00000547031 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.04■■□□□ 1.76
KRT8-208ENST00000547031 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.03■■□□□ 1.76
KRT8-208ENST00000547031 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.03■■□□□ 1.76
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KRT8-208ENST00000547031 TIAM1Q13009 1591 aa25.97■■□□□ 1.75
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KRT8-208ENST00000547031 PTPRKQ15262 1439 aa25.94■■□□□ 1.74
KRT8-208ENST00000547031 PLA2R1Q13018 1463 aa25.93■■□□□ 1.74
KRT8-208ENST00000547031 PKD2Q13563 968 aa25.93■■□□□ 1.74
KRT8-208ENST00000547031 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
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KRT8-208ENST00000547031 ILDR2Q71H61 639 aa25.9■■□□□ 1.74
KRT8-208ENST00000547031 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
KRT8-208ENST00000547031 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
KRT8-208ENST00000547031 NCOA2Q15596 1464 aa25.87■■□□□ 1.73
KRT8-208ENST00000547031 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.87■■□□□ 1.73
KRT8-208ENST00000547031 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
KRT8-208ENST00000547031 MBD5Q9P267 1494 aa25.86■■□□□ 1.73
KRT8-208ENST00000547031 SOCS7O14512 581 aa25.84■■□□□ 1.73
KRT8-208ENST00000547031 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.83■■□□□ 1.73
KRT8-208ENST00000547031 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
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