RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546930.5

CS-206, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-206ENST00000546930 CROCC2H7BZ55 1655 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-206ENST00000546930 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-206ENST00000546930 ARHGAP5Q13017 1502 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-206ENST00000546930 PLCH2O75038 1416 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-206ENST00000546930 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CS-206ENST00000546930 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-206ENST00000546930 PTPN23Q9H3S7 1636 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-206ENST00000546930 KDM6BO15054 1643 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-206ENST00000546930 SYCP2Q9BX26 1530 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-206ENST00000546930 FANCAO15360 1455 aa13.1□□□□□ -0.31
CS-206ENST00000546930 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa13.1□□□□□ -0.31
CS-206ENST00000546930 TRHP20396 242 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CS-206ENST00000546930 MYOM3Q5VTT5 1437 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-206ENST00000546930 TEX14Q8IWB6 1497 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-206ENST00000546930 NEO1Q92859 1461 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-206ENST00000546930 KDM5CP41229 1560 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-206ENST00000546930 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CS-206ENST00000546930 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CS-206ENST00000546930 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CS-206ENST00000546930 FGD6Q6ZV73 1430 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-206ENST00000546930 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-206ENST00000546930 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CS-206ENST00000546930 CCNB3Q8WWL7 1395 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-206ENST00000546930 ADGBQ8N7X0 1667 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-206ENST00000546930 AKNAQ7Z591 1439 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-206ENST00000546930 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-206ENST00000546930 ABCA6Q8N139 1617 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-206ENST00000546930 ADGRL1O94910 1474 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-206ENST00000546930 MBD5Q9P267 1494 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-206ENST00000546930 ARHGEF5Q12774 1597 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-206ENST00000546930 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CS-206ENST00000546930 POGZQ7Z3K3 1410 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-206ENST00000546930 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-206ENST00000546930 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-206ENST00000546930 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-206ENST00000546930 HECW2Q9P2P5 1572 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-206ENST00000546930 MIA2Q96PC5 1412 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-206ENST00000546930 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa13□□□□□ -0.33
CS-206ENST00000546930 MAST1Q9Y2H9 1570 aa13□□□□□ -0.33
CS-206ENST00000546930 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CS-206ENST00000546930 SCAPERQ9BY12 1400 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-206ENST00000546930 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
CS-206ENST00000546930 APLP2Q06481 763 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-206ENST00000546930 PTPRKQ15262 1439 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-206ENST00000546930 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-206ENST00000546930 PLXNC1O60486 1568 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-206ENST00000546930 ATP7AQ04656 1500 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-206ENST00000546930 CCDC141Q6ZP82 1450 aa12.96□□□□□ -0.34
CS-206ENST00000546930 YEATS2Q9ULM3 1422 aa12.96□□□□□ -0.34
CS-206ENST00000546930 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-206ENST00000546930 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-206ENST00000546930 ABCC5O15440 1437 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-206ENST00000546930 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
CS-206ENST00000546930 DAPK1P53355 1430 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-206ENST00000546930 RAPGEF3O95398 923 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-206ENST00000546930 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-206ENST00000546930 GCC2Q8IWJ2 1684 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-206ENST00000546930 SHANK2Q9UPX8 1470 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-206ENST00000546930 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP12.92□□□□□ -0.34
CS-206ENST00000546930 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
CS-206ENST00000546930 MLH3Q9UHC1 1453 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-206ENST00000546930 BCORL1Q5H9F3 1711 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-206ENST00000546930 REREQ9P2R6 1566 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-206ENST00000546930 ADGRL2O95490 1459 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-206ENST00000546930 MROH1Q8NDA8 1641 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-206ENST00000546930 AFAP1Q8N556 730 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-206ENST00000546930 C9orf84Q5VXU9 1444 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-206ENST00000546930 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP12.87□□□□□ -0.35
CS-206ENST00000546930 MAGI2Q86UL8 1455 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-206ENST00000546930 DEPDC5O75140 1603 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-206ENST00000546930 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CS-206ENST00000546930 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
CS-206ENST00000546930 ADAMTSL3P82987 1691 aa12.83□□□□□ -0.35
CS-206ENST00000546930 CEP152O94986 1710 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-206ENST00000546930 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-206ENST00000546930 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
CS-206ENST00000546930 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-206ENST00000546930 ATP10AO60312 1499 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-206ENST00000546930 AGLP35573 1532 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-206ENST00000546930 MADDQ8WXG6 1647 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-206ENST00000546930 A2MP01023 1474 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-206ENST00000546930 UNC13BO14795 1591 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-206ENST00000546930 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
CS-206ENST00000546930 NCOA1Q15788 1441 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-206ENST00000546930 DUOX2Q9NRD8 1548 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-206ENST00000546930 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
CS-206ENST00000546930 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
CS-206ENST00000546930 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
CS-206ENST00000546930 KIF15Q9NS87 1388 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-206ENST00000546930 VWDEQ8N2E2 1590 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-206ENST00000546930 CHIC2Q9UKJ5 165 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-206ENST00000546930 ROCK1Q13464 1354 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-206ENST00000546930 NAIPQ13075 1403 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-206ENST00000546930 C3P01024 1663 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-206ENST00000546930 ITGAEP38570 1179 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-206ENST00000546930 MROH2AA6NES4 1674 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-206ENST00000546930 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CS-206ENST00000546930 HFM1A2PYH4 1435 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-206ENST00000546930 ERBINQ96RT1 1412 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-206ENST00000546930 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms