RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542277.5

PTPN6-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6, human

TSL 3

Gene PTPN6, Length 664 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN6-216	ENST00000542277	AFAP1	Q8N556	730 aa		29.45	■■■□□ 2.31
PTPN6-216	ENST00000542277	FBXO41	Q8TF61	875 aa		29.44	■■■□□ 2.3
PTPN6-216	ENST00000542277	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		29.44	■■■□□ 2.3
PTPN6-216	ENST00000542277	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		29.43	■■■□□ 2.3
PTPN6-216	ENST00000542277	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		29.42	■■■□□ 2.3
PTPN6-216	ENST00000542277	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		29.42	■■■□□ 2.3
PTPN6-216	ENST00000542277	HECW1	Q76N89	1606 aa		29.42	■■■□□ 2.3
PTPN6-216	ENST00000542277	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	29.39	■■■□□ 2.3
PTPN6-216	ENST00000542277	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	29.38	■■■□□ 2.29
PTPN6-216	ENST00000542277	ATP10A	O60312	1499 aa		29.37	■■■□□ 2.29
PTPN6-216	ENST00000542277	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	29.34	■■■□□ 2.29
PTPN6-216	ENST00000542277	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		29.34	■■■□□ 2.29
PTPN6-216	ENST00000542277	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	29.34	■■■□□ 2.29
PTPN6-216	ENST00000542277	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		29.34	■■■□□ 2.29
PTPN6-216	ENST00000542277	CLIP1	P30622	1438 aa		29.3	■■■□□ 2.28
PTPN6-216	ENST00000542277	KIF14	Q15058	1648 aa		29.3	■■■□□ 2.28
PTPN6-216	ENST00000542277	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PTPN6-216	ENST00000542277	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PTPN6-216	ENST00000542277	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PTPN6-216	ENST00000542277	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PTPN6-216	ENST00000542277	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PTPN6-216	ENST00000542277	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		29.2	■■■□□ 2.27
PTPN6-216	ENST00000542277	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PTPN6-216	ENST00000542277	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	29.16	■■■□□ 2.26
PTPN6-216	ENST00000542277	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PTPN6-216	ENST00000542277	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PTPN6-216	ENST00000542277	CERK	Q8TCT0	537 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PTPN6-216	ENST00000542277	KDM5C	P41229	1560 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PTPN6-216	ENST00000542277	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PTPN6-216	ENST00000542277	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	29.1	■■■□□ 2.25
PTPN6-216	ENST00000542277	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PTPN6-216	ENST00000542277	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PTPN6-216	ENST00000542277	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
PTPN6-216	ENST00000542277	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PTPN6-216	ENST00000542277	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PTPN6-216	ENST00000542277	ABCC1	P33527	1531 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PTPN6-216	ENST00000542277	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
PTPN6-216	ENST00000542277	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
PTPN6-216	ENST00000542277	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PTPN6-216	ENST00000542277	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
PTPN6-216	ENST00000542277	PREX2	Q70Z35	1606 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PTPN6-216	ENST00000542277	RERE	Q9P2R6	1566 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PTPN6-216	ENST00000542277	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PTPN6-216	ENST00000542277	AGL	P35573	1532 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PTPN6-216	ENST00000542277	ABCA6	Q8N139	1617 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PTPN6-216	ENST00000542277	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
PTPN6-216	ENST00000542277	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PTPN6-216	ENST00000542277	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
PTPN6-216	ENST00000542277	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PTPN6-216	ENST00000542277	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PTPN6-216	ENST00000542277	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		28.89	■■■□□ 2.21
PTPN6-216	ENST00000542277	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		28.89	■■■□□ 2.21
PTPN6-216	ENST00000542277	ZMYM3	Q14202	1370 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PTPN6-216	ENST00000542277	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PTPN6-216	ENST00000542277	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PTPN6-216	ENST00000542277	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PTPN6-216	ENST00000542277	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PTPN6-216	ENST00000542277	GGT6	Q6P531	493 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PTPN6-216	ENST00000542277	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PTPN6-216	ENST00000542277	STRC	Q7RTU9	1775 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PTPN6-216	ENST00000542277	C3	P01024	1663 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PTPN6-216	ENST00000542277	PTPRT	O14522	1441 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PTPN6-216	ENST00000542277	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PTPN6-216	ENST00000542277	A2M	P01023	1474 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PTPN6-216	ENST00000542277	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PTPN6-216	ENST00000542277	NPAT	Q14207	1427 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PTPN6-216	ENST00000542277	ATP7A	Q04656	1500 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PTPN6-216	ENST00000542277	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PTPN6-216	ENST00000542277	MBD5	Q9P267	1494 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PTPN6-216	ENST00000542277	NCOA1	Q15788	1441 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PTPN6-216	ENST00000542277	CEP162	Q5TB80	1403 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PTPN6-216	ENST00000542277	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
PTPN6-216	ENST00000542277	PTPRK	Q15262	1439 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PTPN6-216	ENST00000542277	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
PTPN6-216	ENST00000542277	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PTPN6-216	ENST00000542277	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
PTPN6-216	ENST00000542277	KIF3B	O15066	747 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PTPN6-216	ENST00000542277	PLXNC1	O60486	1568 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PTPN6-216	ENST00000542277	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PTPN6-216	ENST00000542277	TIAM1	Q13009	1591 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PTPN6-216	ENST00000542277	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PTPN6-216	ENST00000542277	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
PTPN6-216	ENST00000542277	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PTPN6-216	ENST00000542277	PKD2	Q13563	968 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PTPN6-216	ENST00000542277	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PTPN6-216	ENST00000542277	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PTPN6-216	ENST00000542277	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
PTPN6-216	ENST00000542277	MROH2A	A6NES4	1674 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PTPN6-216	ENST00000542277	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
PTPN6-216	ENST00000542277	NCOA2	Q15596	1464 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PTPN6-216	ENST00000542277	TSPY4	P0CV99	314 aa		28.53	■■■□□ 2.16
PTPN6-216	ENST00000542277	TSPY10	P0CW01	314 aa		28.53	■■■□□ 2.16
PTPN6-216	ENST00000542277	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		28.51	■■■□□ 2.15
PTPN6-216	ENST00000542277	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PTPN6-216	ENST00000542277	ILDR2	Q71H61	639 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PTPN6-216	ENST00000542277	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		28.48	■■■□□ 2.15
PTPN6-216	ENST00000542277	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	28.48	■■■□□ 2.15
PTPN6-216	ENST00000542277	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PTPN6-216	ENST00000542277	PLA2R1	Q13018	1463 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PTPN6-216	ENST00000542277	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	28.46	■■■□□ 2.15

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