RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541586.5

CCM2-218, Transcript of CCM2 scaffold protein, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCM2, Length 1,719 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2-218ENST00000541586 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.31■■■■■ 4.36
CCM2-218ENST00000541586 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.29■■■■■ 4.36
CCM2-218ENST00000541586 FANCAO15360 1455 aa42.28■■■■■ 4.36
CCM2-218ENST00000541586 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.28■■■■■ 4.36
CCM2-218ENST00000541586 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.26■■■■■ 4.36
CCM2-218ENST00000541586 PREX2Q70Z35 1606 aa42.24■■■■■ 4.35
CCM2-218ENST00000541586 MYOM3Q5VTT5 1437 aa42.23■■■■■ 4.35
CCM2-218ENST00000541586 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
CCM2-218ENST00000541586 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP42.19■■■■■ 4.34
CCM2-218ENST00000541586 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.19■■■■■ 4.34
CCM2-218ENST00000541586 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.19■■■■■ 4.34
CCM2-218ENST00000541586 AKNAQ7Z591 1439 aa42.18■■■■■ 4.34
CCM2-218ENST00000541586 NEO1Q92859 1461 aa42.15■■■■■ 4.34
CCM2-218ENST00000541586 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.09■■■■■ 4.33
CCM2-218ENST00000541586 MIA2Q96PC5 1412 aa42.09■■■■■ 4.33
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CCM2-218ENST00000541586 AFAP1Q8N556 730 aa41.95■■■■■ 4.31
CCM2-218ENST00000541586 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.95■■■■■ 4.31
CCM2-218ENST00000541586 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.94■■■■■ 4.31
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CCM2-218ENST00000541586 KDM6BO15054 1643 aa41.92■■■■■ 4.3
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CCM2-218ENST00000541586 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.89■■■■■ 4.3
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CCM2-218ENST00000541586 MBD5Q9P267 1494 aa41.84■■■■■ 4.29
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CCM2-218ENST00000541586 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.82■■■■■ 4.294e-9■■■□□ 16.7
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CCM2-218ENST00000541586 TSPY4P0CV99 314 aa41.77■■■■■ 4.28
CCM2-218ENST00000541586 TSPY10P0CW01 314 aa41.77■■■■■ 4.28
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CCM2-218ENST00000541586 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.72■■■■■ 4.27
CCM2-218ENST00000541586 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.69■■■■■ 4.27
CCM2-218ENST00000541586 ABCC5O15440 1437 aa41.69■■■■■ 4.26
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CCM2-218ENST00000541586 DAPK1P53355 1430 aa41.68■■■■■ 4.26
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CCM2-218ENST00000541586 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.47■■■■■ 4.23
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CCM2-218ENST00000541586 NCOA1Q15788 1441 aa41.37■■■■■ 4.21
CCM2-218ENST00000541586 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.37■■■■■ 4.21
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CCM2-218ENST00000541586 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.33■■■■■ 4.21
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CCM2-218ENST00000541586 ROCK1Q13464 1354 aa41.29■■■■■ 4.2
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CCM2-218ENST00000541586 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.28■■■■■ 4.2
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CCM2-218ENST00000541586 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
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CCM2-218ENST00000541586 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.19■■■■■ 4.18
CCM2-218ENST00000541586 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
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CCM2-218ENST00000541586 GGT6Q6P531 493 aa41.13■■■■■ 4.18
CCM2-218ENST00000541586 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.13■■■■■ 4.18
CCM2-218ENST00000541586 REREQ9P2R6 1566 aa41.11■■■■■ 4.17
CCM2-218ENST00000541586 ERBINQ96RT1 1412 aa41.08■■■■■ 4.17
CCM2-218ENST00000541586 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
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