RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541013.2

GOLGA3-206, Transcript of golgin A3, humanhuman

TSL 3

Gene GOLGA3, Length 498 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3-206ENST00000541013 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3-206ENST00000541013 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3-206ENST00000541013 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3-206ENST00000541013 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.12■■□□□ 1.61
GOLGA3-206ENST00000541013 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.12■■□□□ 1.61
GOLGA3-206ENST00000541013 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.11■■□□□ 1.61
GOLGA3-206ENST00000541013 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.1■■□□□ 1.61
GOLGA3-206ENST00000541013 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.08■■□□□ 1.61
GOLGA3-206ENST00000541013 TIAM1Q13009 1591 aa25.07■■□□□ 1.6
GOLGA3-206ENST00000541013 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.06■■□□□ 1.6
GOLGA3-206ENST00000541013 PTPRMP28827 1452 aa25.06■■□□□ 1.6
GOLGA3-206ENST00000541013 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.06■■□□□ 1.6
GOLGA3-206ENST00000541013 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.06■■□□□ 1.6
GOLGA3-206ENST00000541013 PREX2Q70Z35 1606 aa25.05■■□□□ 1.6
GOLGA3-206ENST00000541013 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.05■■□□□ 1.6
GOLGA3-206ENST00000541013 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.04■■□□□ 1.6
GOLGA3-206ENST00000541013 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.04■■□□□ 1.6
GOLGA3-206ENST00000541013 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.03■■□□□ 1.6
GOLGA3-206ENST00000541013 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3-206ENST00000541013 MADDQ8WXG6 1647 aa25■■□□□ 1.59
GOLGA3-206ENST00000541013 KDM5CP41229 1560 aa24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3-206ENST00000541013 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3-206ENST00000541013 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.98■■□□□ 1.59
GOLGA3-206ENST00000541013 AFAP1Q8N556 730 aa24.98■■□□□ 1.59
GOLGA3-206ENST00000541013 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.97■■□□□ 1.59
GOLGA3-206ENST00000541013 ATP10AO60312 1499 aa24.97■■□□□ 1.59
GOLGA3-206ENST00000541013 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
GOLGA3-206ENST00000541013 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.96■■□□□ 1.59
GOLGA3-206ENST00000541013 ABCC1P33527 1531 aa24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3-206ENST00000541013 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3-206ENST00000541013 MAP3K1Q13233 1512 aa24.92■■□□□ 1.58
GOLGA3-206ENST00000541013 NCOA2Q15596 1464 aa24.92■■□□□ 1.58
GOLGA3-206ENST00000541013 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.92■■□□□ 1.58
GOLGA3-206ENST00000541013 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.92■■□□□ 1.58
GOLGA3-206ENST00000541013 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.91■■□□□ 1.58
GOLGA3-206ENST00000541013 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.91■■□□□ 1.58
GOLGA3-206ENST00000541013 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
GOLGA3-206ENST00000541013 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3-206ENST00000541013 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3-206ENST00000541013 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3-206ENST00000541013 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.86■■□□□ 1.57
GOLGA3-206ENST00000541013 REREQ9P2R6 1566 aa24.85■■□□□ 1.57
GOLGA3-206ENST00000541013 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
GOLGA3-206ENST00000541013 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
GOLGA3-206ENST00000541013 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.83■■□□□ 1.57
GOLGA3-206ENST00000541013 MLECQ14165 292 aa24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3-206ENST00000541013 ABCA6Q8N139 1617 aa24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3-206ENST00000541013 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3-206ENST00000541013 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.8■■□□□ 1.56
GOLGA3-206ENST00000541013 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.8■■□□□ 1.56
GOLGA3-206ENST00000541013 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.79■■□□□ 1.562e-7■■■■□ 26
GOLGA3-206ENST00000541013 AGLP35573 1532 aa24.78■■□□□ 1.56
GOLGA3-206ENST00000541013 APLP2Q06481 763 aa24.78■■□□□ 1.56
GOLGA3-206ENST00000541013 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.77■■□□□ 1.56
GOLGA3-206ENST00000541013 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.73■■□□□ 1.55
GOLGA3-206ENST00000541013 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.72■■□□□ 1.55
GOLGA3-206ENST00000541013 MBD5Q9P267 1494 aa24.71■■□□□ 1.55
GOLGA3-206ENST00000541013 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.71■■□□□ 1.55
GOLGA3-206ENST00000541013 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.69■■□□□ 1.54
GOLGA3-206ENST00000541013 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3-206ENST00000541013 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3-206ENST00000541013 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
GOLGA3-206ENST00000541013 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.64■■□□□ 1.54
GOLGA3-206ENST00000541013 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
GOLGA3-206ENST00000541013 ATP7AQ04656 1500 aa24.64■■□□□ 1.53
GOLGA3-206ENST00000541013 HSPA2P54652 639 aa24.63■■□□□ 1.53
GOLGA3-206ENST00000541013 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
GOLGA3-206ENST00000541013 PLXNC1O60486 1568 aa24.61■■□□□ 1.53
GOLGA3-206ENST00000541013 MIA2Q96PC5 1412 aa24.61■■□□□ 1.53
GOLGA3-206ENST00000541013 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
GOLGA3-206ENST00000541013 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.58■■□□□ 1.53
GOLGA3-206ENST00000541013 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.58■■□□□ 1.53
GOLGA3-206ENST00000541013 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.58■■□□□ 1.52
GOLGA3-206ENST00000541013 A2MP01023 1474 aa24.58■■□□□ 1.52
GOLGA3-206ENST00000541013 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.57■■□□□ 1.52
GOLGA3-206ENST00000541013 C3P01024 1663 aa24.56■■□□□ 1.52
GOLGA3-206ENST00000541013 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.56■■□□□ 1.52
GOLGA3-206ENST00000541013 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.55■■□□□ 1.52
GOLGA3-206ENST00000541013 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.55■■□□□ 1.52
GOLGA3-206ENST00000541013 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.52■■□□□ 1.52
GOLGA3-206ENST00000541013 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.5■■□□□ 1.51
GOLGA3-206ENST00000541013 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
GOLGA3-206ENST00000541013 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
GOLGA3-206ENST00000541013 MROH2AA6NES4 1674 aa24.49■■□□□ 1.51
GOLGA3-206ENST00000541013 ZMYM3Q14202 1370 aa24.48■■□□□ 1.51
GOLGA3-206ENST00000541013 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.47■■□□□ 1.51
GOLGA3-206ENST00000541013 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
GOLGA3-206ENST00000541013 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.47■■□□□ 1.51
GOLGA3-206ENST00000541013 ABCC5O15440 1437 aa24.45■■□□□ 1.51
GOLGA3-206ENST00000541013 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.45■■□□□ 1.5
GOLGA3-206ENST00000541013 NPATQ14207 1427 aa24.44■■□□□ 1.5
GOLGA3-206ENST00000541013 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.44■■□□□ 1.5
GOLGA3-206ENST00000541013 STRCQ7RTU9 1775 aa24.43■■□□□ 1.5
GOLGA3-206ENST00000541013 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
GOLGA3-206ENST00000541013 TSPY4P0CV99 314 aa24.42■■□□□ 1.5
GOLGA3-206ENST00000541013 TSPY10P0CW01 314 aa24.42■■□□□ 1.5
GOLGA3-206ENST00000541013 GGT6Q6P531 493 aa24.42■■□□□ 1.5
GOLGA3-206ENST00000541013 DAPK1P53355 1430 aa24.41■■□□□ 1.5
GOLGA3-206ENST00000541013 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3-206ENST00000541013 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms