RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533877.1

FAM220A-204, Transcript of family with sequence similarity 220 member A, human

TSL 4

Gene FAM220A, Length 579 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM220A-204	ENST00000533877	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		43.43	■■■■■ 4.54
FAM220A-204	ENST00000533877	RAPGEF3	O95398	923 aa		43.41	■■■■■ 4.54
FAM220A-204	ENST00000533877	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	43.39	■■■■■ 4.54
FAM220A-204	ENST00000533877	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	43.35	■■■■■ 4.53
FAM220A-204	ENST00000533877	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	43.33	■■■■■ 4.53
FAM220A-204	ENST00000533877	PREX2	Q70Z35	1606 aa		43.33	■■■■■ 4.53
FAM220A-204	ENST00000533877	ADGRL1	O94910	1474 aa		43.32	■■■■■ 4.53
FAM220A-204	ENST00000533877	NCOA2	Q15596	1464 aa		43.32	■■■■■ 4.53
FAM220A-204	ENST00000533877	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		43.32	■■■■■ 4.53
FAM220A-204	ENST00000533877	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		43.32	■■■■■ 4.53
FAM220A-204	ENST00000533877	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	43.32	■■■■■ 4.53
FAM220A-204	ENST00000533877	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		43.31	■■■■■ 4.52
FAM220A-204	ENST00000533877	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	43.3	■■■■■ 4.52
FAM220A-204	ENST00000533877	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		43.14	■■■■■ 4.5
FAM220A-204	ENST00000533877	AFAP1	Q8N556	730 aa		43.14	■■■■■ 4.5
FAM220A-204	ENST00000533877	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		43.14	■■■■■ 4.5
FAM220A-204	ENST00000533877	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	43.11	■■■■■ 4.49
FAM220A-204	ENST00000533877	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		43.11	■■■■■ 4.49
FAM220A-204	ENST00000533877	RICTOR	Q6R327	1708 aa		43.11	■■■■■ 4.49
FAM220A-204	ENST00000533877	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	43.1	■■■■■ 4.49
FAM220A-204	ENST00000533877	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		43.09	■■■■■ 4.49
FAM220A-204	ENST00000533877	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		43.08	■■■■■ 4.49
FAM220A-204	ENST00000533877	ABCC1	P33527	1531 aa		43.08	■■■■■ 4.49
FAM220A-204	ENST00000533877	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		43.06	■■■■■ 4.48
FAM220A-204	ENST00000533877	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		43.06	■■■■■ 4.48
FAM220A-204	ENST00000533877	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		43.05	■■■■■ 4.48
FAM220A-204	ENST00000533877	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		43.04	■■■■■ 4.48
FAM220A-204	ENST00000533877	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		43.01	■■■■■ 4.48
FAM220A-204	ENST00000533877	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		43	■■■■■ 4.47
FAM220A-204	ENST00000533877	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		43	■■■■■ 4.47
FAM220A-204	ENST00000533877	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.99	■■■■■ 4.47
FAM220A-204	ENST00000533877	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.97	■■■■■ 4.47
FAM220A-204	ENST00000533877	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	42.94	■■■■■ 4.46
FAM220A-204	ENST00000533877	MIA2	Q96PC5	1412 aa		42.94	■■■■■ 4.46
FAM220A-204	ENST00000533877	KDM5C	P41229	1560 aa		42.9	■■■■■ 4.46
FAM220A-204	ENST00000533877	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		42.9	■■■■■ 4.46
FAM220A-204	ENST00000533877	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.9	■■■■■ 4.46
FAM220A-204	ENST00000533877	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		42.9	■■■■■ 4.46
FAM220A-204	ENST00000533877	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.88	■■■■■ 4.45
FAM220A-204	ENST00000533877	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.87	■■■■■ 4.45
FAM220A-204	ENST00000533877	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.87	■■■■■ 4.45
FAM220A-204	ENST00000533877	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.87	■■■■■ 4.45
FAM220A-204	ENST00000533877	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		42.83	■■■■■ 4.45
FAM220A-204	ENST00000533877	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	42.79	■■■■■ 4.44
FAM220A-204	ENST00000533877	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		42.79	■■■■■ 4.44
FAM220A-204	ENST00000533877	ATP10A	O60312	1499 aa		42.78	■■■■■ 4.44
FAM220A-204	ENST00000533877	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		42.78	■■■■■ 4.44
FAM220A-204	ENST00000533877	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		42.73	■■■■■ 4.43
FAM220A-204	ENST00000533877	TSPY4	P0CV99	314 aa		42.73	■■■■■ 4.43
FAM220A-204	ENST00000533877	TSPY10	P0CW01	314 aa		42.73	■■■■■ 4.43
FAM220A-204	ENST00000533877	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.72	■■■■■ 4.43
FAM220A-204	ENST00000533877	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		42.68	■■■■■ 4.42
FAM220A-204	ENST00000533877	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		42.68	■■■■■ 4.42
FAM220A-204	ENST00000533877	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		42.68	■■■■■ 4.42
FAM220A-204	ENST00000533877	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.67	■■■■■ 4.42
FAM220A-204	ENST00000533877	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.64	■■■■■ 4.42
FAM220A-204	ENST00000533877	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	42.64	■■■■■ 4.42
FAM220A-204	ENST00000533877	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.64	■■■■■ 4.42
FAM220A-204	ENST00000533877	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.64	■■■■■ 4.42
FAM220A-204	ENST00000533877	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	42.62	■■■■■ 4.41
FAM220A-204	ENST00000533877	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.61	■■■■■ 4.41
FAM220A-204	ENST00000533877	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.59	■■■■■ 4.41
FAM220A-204	ENST00000533877	MLEC	Q14165	292 aa		42.54	■■■■■ 4.4
FAM220A-204	ENST00000533877	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	42.54	■■■■■ 4.4
FAM220A-204	ENST00000533877	ABCC5	O15440	1437 aa		42.52	■■■■■ 4.4
FAM220A-204	ENST00000533877	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.52	■■■■■ 4.4
FAM220A-204	ENST00000533877	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		42.5	■■■■■ 4.39
FAM220A-204	ENST00000533877	DAPK1	P53355	1430 aa		42.47	■■■■■ 4.39
FAM220A-204	ENST00000533877	A2M	P01023	1474 aa		42.47	■■■■■ 4.39
FAM220A-204	ENST00000533877	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		42.44	■■■■■ 4.38
FAM220A-204	ENST00000533877	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		42.43	■■■■■ 4.38
FAM220A-204	ENST00000533877	AGL	P35573	1532 aa		42.42	■■■■■ 4.38
FAM220A-204	ENST00000533877	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42.41	■■■■■ 4.38
FAM220A-204	ENST00000533877	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	42.41	■■■■■ 4.38
FAM220A-204	ENST00000533877	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		42.39	■■■■■ 4.38
FAM220A-204	ENST00000533877	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		42.38	■■■■■ 4.38
FAM220A-204	ENST00000533877	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		42.38	■■■■■ 4.37
FAM220A-204	ENST00000533877	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.38	■■■■■ 4.37
FAM220A-204	ENST00000533877	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	42.35	■■■■■ 4.37
FAM220A-204	ENST00000533877	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.32	■■■■■ 4.37
FAM220A-204	ENST00000533877	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		42.32	■■■■■ 4.37
FAM220A-204	ENST00000533877	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	42.29	■■■■■ 4.36
FAM220A-204	ENST00000533877	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		42.29	■■■■■ 4.36
FAM220A-204	ENST00000533877	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		42.27	■■■■■ 4.36
FAM220A-204	ENST00000533877	KIF3B	O15066	747 aa		42.27	■■■■■ 4.36
FAM220A-204	ENST00000533877	ITGAE	P38570	1179 aa		42.27	■■■■■ 4.36
FAM220A-204	ENST00000533877	GGT6	Q6P531	493 aa		42.27	■■■■■ 4.36
FAM220A-204	ENST00000533877	MADD	Q8WXG6	1647 aa		42.26	■■■■■ 4.36
FAM220A-204	ENST00000533877	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	42.25	■■■■■ 4.35
FAM220A-204	ENST00000533877	KIF15	Q9NS87	1388 aa		42.24	■■■■■ 4.35
FAM220A-204	ENST00000533877	NCOA1	Q15788	1441 aa		42.2	■■■■■ 4.35
FAM220A-204	ENST00000533877	PTPRM	P28827	1452 aa		42.2	■■■■■ 4.35
FAM220A-204	ENST00000533877	PTPRK	Q15262	1439 aa		42.2	■■■■■ 4.35
FAM220A-204	ENST00000533877	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		42.17	■■■■■ 4.34
FAM220A-204	ENST00000533877	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		42.16	■■■■■ 4.34
FAM220A-204	ENST00000533877	ADGRL2	O95490	1459 aa		42.15	■■■■■ 4.34
FAM220A-204	ENST00000533877	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	42.13	■■■■■ 4.34
FAM220A-204	ENST00000533877	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		42.13	■■■■■ 4.33
FAM220A-204	ENST00000533877	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		42.12	■■■■■ 4.33
FAM220A-204	ENST00000533877	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		42.06	■■■■■ 4.32

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