RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532224.5

PTPN22-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 22, human

TSL 2

Gene PTPN22, Length 2,421 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN22-209	ENST00000532224	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPN22-209	ENST00000532224	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PTPN22-209	ENST00000532224	STK24	Q9Y6E0	443 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPN22-209	ENST00000532224	STK25	O00506	426 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPN22-209	ENST00000532224	MICALL2	Q8IY33	904 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPN22-209	ENST00000532224	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPN22-209	ENST00000532224	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPN22-209	ENST00000532224	PTGER2	P43116	358 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PTPN22-209	ENST00000532224	EMP3	P54852	163 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PTPN22-209	ENST00000532224	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PTPN22-209	ENST00000532224	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPN22-209	ENST00000532224	PKD2	Q13563	968 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPN22-209	ENST00000532224	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PTPN22-209	ENST00000532224	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPN22-209	ENST00000532224	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPN22-209	ENST00000532224	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PTPN22-209	ENST00000532224	RGL2	O15211	777 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPN22-209	ENST00000532224	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPN22-209	ENST00000532224	MARVELD3	Q96A59	401 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPN22-209	ENST00000532224	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPN22-209	ENST00000532224	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPN22-209	ENST00000532224	XP32	Q5T750	250 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPN22-209	ENST00000532224	MFRP	Q9BY79	579 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPN22-209	ENST00000532224	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPN22-209	ENST00000532224	FAM205C	A6NFA0	338 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPN22-209	ENST00000532224	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPN22-209	ENST00000532224	ERBB3	P21860	1342 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPN22-209	ENST00000532224	TMC2	Q8TDI7	906 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPN22-209	ENST00000532224	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPN22-209	ENST00000532224	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPN22-209	ENST00000532224	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN22-209	ENST00000532224	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN22-209	ENST00000532224	KIF3C	O14782	793 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPN22-209	ENST00000532224	SLC34A2	O95436	690 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPN22-209	ENST00000532224	GPR153	Q6NV75	609 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPN22-209	ENST00000532224	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPN22-209	ENST00000532224	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPN22-209	ENST00000532224	C2orf72	A6NCS6	295 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPN22-209	ENST00000532224	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPN22-209	ENST00000532224	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPN22-209	ENST00000532224	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPN22-209	ENST00000532224	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPN22-209	ENST00000532224	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPN22-209	ENST00000532224	PBX2	P40425	430 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN22-209	ENST00000532224	ARSI	Q5FYB1	569 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN22-209	ENST00000532224	SMARCA2	P51531	1590 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN22-209	ENST00000532224	POTEB3	A0JP26	581 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN22-209	ENST00000532224	TBC1D12	O60347	775 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN22-209	ENST00000532224	POTEB	Q6S5H4	581 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN22-209	ENST00000532224	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPN22-209	ENST00000532224	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPN22-209	ENST00000532224	FOXK1	P85037	733 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPN22-209	ENST00000532224	PPP1R37	O75864	691 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPN22-209	ENST00000532224	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPN22-209	ENST00000532224	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPN22-209	ENST00000532224	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPN22-209	ENST00000532224	PRDM2	Q13029	1718 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPN22-209	ENST00000532224	BTBD11	A6QL63	1104 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PTPN22-209	ENST00000532224	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPN22-209	ENST00000532224	STK17A	Q9UEE5	414 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPN22-209	ENST00000532224	NUDT7	P0C024	238 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPN22-209	ENST00000532224	PLPP6	Q8IY26	295 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPN22-209	ENST00000532224	KCNH8	Q96L42	1107 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPN22-209	ENST00000532224	PDE4A	P27815	886 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPN22-209	ENST00000532224	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPN22-209	ENST00000532224	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	4.06	□□□□□ -1.76
PTPN22-209	ENST00000532224	CUX2	O14529	1486 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPN22-209	ENST00000532224	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPN22-209	ENST00000532224	LHX6	Q9UPM6	363 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPN22-209	ENST00000532224	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPN22-209	ENST00000532224	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPN22-209	ENST00000532224	DSG2	Q14126	1118 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPN22-209	ENST00000532224	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPN22-209	ENST00000532224	ARHGAP33	O14559	1287 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PTPN22-209	ENST00000532224	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PTPN22-209	ENST00000532224	HMGXB3	Q12766	1538 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PTPN22-209	ENST00000532224	TK2	O00142	265 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PTPN22-209	ENST00000532224	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PTPN22-209	ENST00000532224	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PTPN22-209	ENST00000532224	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PTPN22-209	ENST00000532224	OXER1	Q8TDS5	423 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PTPN22-209	ENST00000532224	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PTPN22-209	ENST00000532224	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
PTPN22-209	ENST00000532224	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
PTPN22-209	ENST00000532224	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
PTPN22-209	ENST00000532224	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
PTPN22-209	ENST00000532224	STAC3	Q96MF2	364 aa		4.01	□□□□□ -1.77
PTPN22-209	ENST00000532224	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.01	□□□□□ -1.77
PTPN22-209	ENST00000532224	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.01	□□□□□ -1.77
PTPN22-209	ENST00000532224	MFSD10	Q14728	455 aa		4.01	□□□□□ -1.77
PTPN22-209	ENST00000532224	SCRIB	Q14160	1630 aa		4.01	□□□□□ -1.77
PTPN22-209	ENST00000532224	LAPTM4A	Q15012	233 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPN22-209	ENST00000532224	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPN22-209	ENST00000532224	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
PTPN22-209	ENST00000532224	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
PTPN22-209	ENST00000532224		Q6ZNB5	142 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPN22-209	ENST00000532224	SMARCA4	P51532	1647 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPN22-209	ENST00000532224	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPN22-209	ENST00000532224	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	3.99	□□□□□ -1.77
PTPN22-209	ENST00000532224	JPH4	Q96JJ6	628 aa		3.99	□□□□□ -1.77

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