RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531006.1

TSTA3-213, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-213ENST00000531006 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32.82■■■□□ 2.84
TSTA3-213ENST00000531006 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.75■■■□□ 2.83
TSTA3-213ENST00000531006 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.74■■■□□ 2.83
TSTA3-213ENST00000531006 PREX2Q70Z35 1606 aa32.72■■■□□ 2.83
TSTA3-213ENST00000531006 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP32.7■■■□□ 2.83
TSTA3-213ENST00000531006 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.69■■■□□ 2.82
TSTA3-213ENST00000531006 AFAP1Q8N556 730 aa32.69■■■□□ 2.82
TSTA3-213ENST00000531006 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP32.69■■■□□ 2.82
TSTA3-213ENST00000531006 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.67■■■□□ 2.82
TSTA3-213ENST00000531006 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.67■■■□□ 2.82
TSTA3-213ENST00000531006 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP32.65■■■□□ 2.82
TSTA3-213ENST00000531006 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.64■■■□□ 2.82
TSTA3-213ENST00000531006 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.62■■■□□ 2.81
TSTA3-213ENST00000531006 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.61■■■□□ 2.81
TSTA3-213ENST00000531006 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.61■■■□□ 2.81
TSTA3-213ENST00000531006 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.61■■■□□ 2.81
TSTA3-213ENST00000531006 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.61■■■□□ 2.81
TSTA3-213ENST00000531006 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.58■■■□□ 2.81
TSTA3-213ENST00000531006 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.58■■■□□ 2.81
TSTA3-213ENST00000531006 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.57■■■□□ 2.8
TSTA3-213ENST00000531006 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.56■■■□□ 2.8
TSTA3-213ENST00000531006 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.56■■■□□ 2.8
TSTA3-213ENST00000531006 TIAM1Q13009 1591 aa32.56■■■□□ 2.8
TSTA3-213ENST00000531006 ABCC1P33527 1531 aa32.56■■■□□ 2.8
TSTA3-213ENST00000531006 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP32.55■■■□□ 2.8
TSTA3-213ENST00000531006 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.54■■■□□ 2.8
TSTA3-213ENST00000531006 ITSN2Q9NZM3 1697 aa32.54■■■□□ 2.8
TSTA3-213ENST00000531006 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa32.53■■■□□ 2.8
TSTA3-213ENST00000531006 BCORL1Q5H9F3 1711 aa32.51■■■□□ 2.8
TSTA3-213ENST00000531006 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP32.5■■■□□ 2.79
TSTA3-213ENST00000531006 ADAMTSL3P82987 1691 aa32.5■■■□□ 2.79
TSTA3-213ENST00000531006 KDM5CP41229 1560 aa32.49■■■□□ 2.79
TSTA3-213ENST00000531006 MLECQ14165 292 aa32.49■■■□□ 2.79
TSTA3-213ENST00000531006 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP32.49■■■□□ 2.79
TSTA3-213ENST00000531006 ATP10AO60312 1499 aa32.48■■■□□ 2.79
TSTA3-213ENST00000531006 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
TSTA3-213ENST00000531006 NCOA2Q15596 1464 aa32.46■■■□□ 2.79
TSTA3-213ENST00000531006 SYCP2Q9BX26 1530 aa32.46■■■□□ 2.79
TSTA3-213ENST00000531006 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.44■■■□□ 2.78
TSTA3-213ENST00000531006 HECW2Q9P2P5 1572 aa32.44■■■□□ 2.78
TSTA3-213ENST00000531006 MADDQ8WXG6 1647 aa32.41■■■□□ 2.78
TSTA3-213ENST00000531006 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.4■■■□□ 2.78
TSTA3-213ENST00000531006 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.4■■■□□ 2.78
TSTA3-213ENST00000531006 ABCA6Q8N139 1617 aa32.38■■■□□ 2.77
TSTA3-213ENST00000531006 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.38■■■□□ 2.77
TSTA3-213ENST00000531006 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa32.37■■■□□ 2.77
TSTA3-213ENST00000531006 APLP2Q06481 763 aa32.37■■■□□ 2.77
TSTA3-213ENST00000531006 PLPPR3Q6T4P5 718 aa32.37■■■□□ 2.77
TSTA3-213ENST00000531006 PTPRMP28827 1452 aa32.36■■■□□ 2.77
TSTA3-213ENST00000531006 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa32.36■■■□□ 2.77
TSTA3-213ENST00000531006 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
TSTA3-213ENST00000531006 MAP3K1Q13233 1512 aa32.36■■■□□ 2.77
TSTA3-213ENST00000531006 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa32.35■■■□□ 2.77
TSTA3-213ENST00000531006 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
TSTA3-213ENST00000531006 MBD5Q9P267 1494 aa32.26■■■□□ 2.75
TSTA3-213ENST00000531006 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa32.25■■■□□ 2.75
TSTA3-213ENST00000531006 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa32.24■■■□□ 2.75
TSTA3-213ENST00000531006 ATP7AQ04656 1500 aa32.22■■■□□ 2.75
TSTA3-213ENST00000531006 REREQ9P2R6 1566 aa32.21■■■□□ 2.75
TSTA3-213ENST00000531006 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
TSTA3-213ENST00000531006 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
TSTA3-213ENST00000531006 MYOM3Q5VTT5 1437 aa32.14■■■□□ 2.74
TSTA3-213ENST00000531006 AGLP35573 1532 aa32.14■■■□□ 2.74
TSTA3-213ENST00000531006 CCDC141Q6ZP82 1450 aa32.11■■■□□ 2.73
TSTA3-213ENST00000531006 A2MP01023 1474 aa32.1■■■□□ 2.73
TSTA3-213ENST00000531006 RSPH4AQ5TD94 716 aa32.1■■■□□ 2.73
TSTA3-213ENST00000531006 TSPY4P0CV99 314 aa32.07■■■□□ 2.72
TSTA3-213ENST00000531006 TSPY10P0CW01 314 aa32.07■■■□□ 2.72
TSTA3-213ENST00000531006 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.72
TSTA3-213ENST00000531006 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa32.07■■■□□ 2.72
TSTA3-213ENST00000531006 MIA2Q96PC5 1412 aa32.06■■■□□ 2.72
TSTA3-213ENST00000531006 ADGBQ8N7X0 1667 aa32.05■■■□□ 2.72
TSTA3-213ENST00000531006 ARHGEF5Q12774 1597 aa32.05■■■□□ 2.72
TSTA3-213ENST00000531006 GGT6Q6P531 493 aa32.04■■■□□ 2.72
TSTA3-213ENST00000531006 PLXNC1O60486 1568 aa32.02■■■□□ 2.72
TSTA3-213ENST00000531006 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
TSTA3-213ENST00000531006 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.98■■■□□ 2.71
TSTA3-213ENST00000531006 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
TSTA3-213ENST00000531006 HSPA2P54652 639 aa31.96■■■□□ 2.71
TSTA3-213ENST00000531006 LMTK3Q96Q04 1460 aa31.96■■■□□ 2.71
TSTA3-213ENST00000531006 C3P01024 1663 aa31.95■■■□□ 2.71
TSTA3-213ENST00000531006 KIF3BO15066 747 aa31.94■■■□□ 2.7
TSTA3-213ENST00000531006 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.93■■■□□ 2.7
TSTA3-213ENST00000531006 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
TSTA3-213ENST00000531006 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
TSTA3-213ENST00000531006 MAST1Q9Y2H9 1570 aa31.87■■■□□ 2.69
TSTA3-213ENST00000531006 ABCC5O15440 1437 aa31.87■■■□□ 2.69
TSTA3-213ENST00000531006 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.87■■■□□ 2.69
TSTA3-213ENST00000531006 ZMYM3Q14202 1370 aa31.87■■■□□ 2.69
TSTA3-213ENST00000531006 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
TSTA3-213ENST00000531006 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
TSTA3-213ENST00000531006 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.83■■■□□ 2.69
TSTA3-213ENST00000531006 PREX1Q8TCU6 1659 aa31.83■■■□□ 2.69
TSTA3-213ENST00000531006 MROH2AA6NES4 1674 aa31.81■■■□□ 2.68
TSTA3-213ENST00000531006 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.81■■■□□ 2.68
TSTA3-213ENST00000531006 DAPK1P53355 1430 aa31.81■■■□□ 2.68
TSTA3-213ENST00000531006 CROCC2H7BZ55 1655 aa31.8■■■□□ 2.68
TSTA3-213ENST00000531006 PPP6R1Q9UPN7 881 aa31.79■■■□□ 2.68
TSTA3-213ENST00000531006 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
TSTA3-213ENST00000531006 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.75■■■□□ 2.67
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