RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527295.5

SIGIRR-209, Transcript of single Ig and TIR domain containing, humanhuman

TSL 2

Gene SIGIRR, Length 1,867 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGIRR-209ENST00000527295 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.56■■■□□ 2.32
SIGIRR-209ENST00000527295 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.56■■■□□ 2.32
SIGIRR-209ENST00000527295 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.55■■■□□ 2.32
SIGIRR-209ENST00000527295 DIP2BQ9P265 1576 aa29.55■■■□□ 2.32
SIGIRR-209ENST00000527295 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.54■■■□□ 2.32
SIGIRR-209ENST00000527295 PREX2Q70Z35 1606 aa29.54■■■□□ 2.32
SIGIRR-209ENST00000527295 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.51■■■□□ 2.31
SIGIRR-209ENST00000527295 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.5■■■□□ 2.31
SIGIRR-209ENST00000527295 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
SIGIRR-209ENST00000527295 HRCP23327 699 aa29.49■■■□□ 2.31
SIGIRR-209ENST00000527295 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.48■■■□□ 2.31
SIGIRR-209ENST00000527295 GLI2P10070 1586 aa29.48■■■□□ 2.31
SIGIRR-209ENST00000527295 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
SIGIRR-209ENST00000527295 FANCAO15360 1455 aa29.45■■■□□ 2.3
SIGIRR-209ENST00000527295 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.45■■■□□ 2.3
SIGIRR-209ENST00000527295 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.43■■■□□ 2.3
SIGIRR-209ENST00000527295 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.42■■■□□ 2.3
SIGIRR-209ENST00000527295 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.41■■■□□ 2.3
SIGIRR-209ENST00000527295 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.4■■■□□ 2.3
SIGIRR-209ENST00000527295 PTPRKQ15262 1439 aa29.39■■■□□ 2.3
SIGIRR-209ENST00000527295 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.39■■■□□ 2.29
SIGIRR-209ENST00000527295 TSPOAP1O95153 1857 aa29.38■■■□□ 2.29
SIGIRR-209ENST00000527295 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.36■■■□□ 2.29
SIGIRR-209ENST00000527295 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.35■■■□□ 2.29
SIGIRR-209ENST00000527295 ABCC5O15440 1437 aa29.35■■■□□ 2.29
SIGIRR-209ENST00000527295 AKNAQ7Z591 1439 aa29.35■■■□□ 2.29
SIGIRR-209ENST00000527295 MBD5Q9P267 1494 aa29.34■■■□□ 2.29
SIGIRR-209ENST00000527295 DAPK1P53355 1430 aa29.33■■■□□ 2.29
SIGIRR-209ENST00000527295 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.31■■■□□ 2.28
SIGIRR-209ENST00000527295 ADGRL1O94910 1474 aa29.31■■■□□ 2.28
SIGIRR-209ENST00000527295 ABCC1P33527 1531 aa29.3■■■□□ 2.28
SIGIRR-209ENST00000527295 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.3■■■□□ 2.28
SIGIRR-209ENST00000527295 AFAP1Q8N556 730 aa29.29■■■□□ 2.28
SIGIRR-209ENST00000527295 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.29■■■□□ 2.28
SIGIRR-209ENST00000527295 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.29■■■□□ 2.28
SIGIRR-209ENST00000527295 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
SIGIRR-209ENST00000527295 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
SIGIRR-209ENST00000527295 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.25■■■□□ 2.27
SIGIRR-209ENST00000527295 NEO1Q92859 1461 aa29.25■■■□□ 2.27
SIGIRR-209ENST00000527295 TSPY4P0CV99 314 aa29.25■■■□□ 2.27
SIGIRR-209ENST00000527295 TSPY10P0CW01 314 aa29.25■■■□□ 2.27
SIGIRR-209ENST00000527295 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.23■■■□□ 2.27
SIGIRR-209ENST00000527295 RAPGEF3O95398 923 aa29.23■■■□□ 2.27
SIGIRR-209ENST00000527295 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.22■■■□□ 2.27
SIGIRR-209ENST00000527295 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.22■■■□□ 2.27
SIGIRR-209ENST00000527295 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.22■■■□□ 2.27
SIGIRR-209ENST00000527295 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.21■■■□□ 2.27
SIGIRR-209ENST00000527295 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.19■■■□□ 2.26
SIGIRR-209ENST00000527295 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.16■■■□□ 2.26
SIGIRR-209ENST00000527295 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.15■■■□□ 2.26
SIGIRR-209ENST00000527295 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
SIGIRR-209ENST00000527295 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
SIGIRR-209ENST00000527295 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
SIGIRR-209ENST00000527295 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.12■■■□□ 2.25
SIGIRR-209ENST00000527295 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.11■■■□□ 2.25
SIGIRR-209ENST00000527295 NCOA1Q15788 1441 aa29.1■■■□□ 2.25
SIGIRR-209ENST00000527295 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
SIGIRR-209ENST00000527295 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.09■■■□□ 2.25
SIGIRR-209ENST00000527295 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.09■■■□□ 2.25
SIGIRR-209ENST00000527295 NAIPQ13075 1403 aa29.08■■■□□ 2.25
SIGIRR-209ENST00000527295 ROCK1Q13464 1354 aa29.08■■■□□ 2.25
SIGIRR-209ENST00000527295 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.07■■■□□ 2.24
SIGIRR-209ENST00000527295 HFM1A2PYH4 1435 aa29.06■■■□□ 2.24
SIGIRR-209ENST00000527295 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
SIGIRR-209ENST00000527295 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.05■■■□□ 2.24
SIGIRR-209ENST00000527295 ADGRL2O95490 1459 aa29.05■■■□□ 2.24
SIGIRR-209ENST00000527295 KIF15Q9NS87 1388 aa29.03■■■□□ 2.24
SIGIRR-209ENST00000527295 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.02■■■□□ 2.24
SIGIRR-209ENST00000527295 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.02■■■□□ 2.24
SIGIRR-209ENST00000527295 RICTORQ6R327 1708 aa29■■■□□ 2.23
SIGIRR-209ENST00000527295 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29■■■□□ 2.23
SIGIRR-209ENST00000527295 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29■■■□□ 2.23
SIGIRR-209ENST00000527295 KDM5CP41229 1560 aa28.99■■■□□ 2.23
SIGIRR-209ENST00000527295 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.99■■■□□ 2.23
SIGIRR-209ENST00000527295 ATP7AQ04656 1500 aa28.99■■■□□ 2.23
SIGIRR-209ENST00000527295 KDM6BO15054 1643 aa28.98■■■□□ 2.23
SIGIRR-209ENST00000527295 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
SIGIRR-209ENST00000527295 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.94■■■□□ 2.22
SIGIRR-209ENST00000527295 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.94■■■□□ 2.22
SIGIRR-209ENST00000527295 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.92■■■□□ 2.22
SIGIRR-209ENST00000527295 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.92■■■□□ 2.22
SIGIRR-209ENST00000527295 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.92■■■□□ 2.22
SIGIRR-209ENST00000527295 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.92■■■□□ 2.22
SIGIRR-209ENST00000527295 PLXNC1O60486 1568 aa28.91■■■□□ 2.22
SIGIRR-209ENST00000527295 TRIM52Q96A61 297 aa28.87■■■□□ 2.21
SIGIRR-209ENST00000527295 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.85■■■□□ 2.21
SIGIRR-209ENST00000527295 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.85■■■□□ 2.21
SIGIRR-209ENST00000527295 ABCA6Q8N139 1617 aa28.84■■■□□ 2.21
SIGIRR-209ENST00000527295 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
SIGIRR-209ENST00000527295 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
SIGIRR-209ENST00000527295 A2MP01023 1474 aa28.81■■■□□ 2.2
SIGIRR-209ENST00000527295 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.81■■■□□ 2.2
SIGIRR-209ENST00000527295 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.8■■■□□ 2.29e-7■■■■□ 22.1
SIGIRR-209ENST00000527295 KIF3BO15066 747 aa28.79■■■□□ 2.2
SIGIRR-209ENST00000527295 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.78■■■□□ 2.2
SIGIRR-209ENST00000527295 ERBINQ96RT1 1412 aa28.78■■■□□ 2.2
SIGIRR-209ENST00000527295 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.77■■■□□ 2.2
SIGIRR-209ENST00000527295 ATP10AO60312 1499 aa28.73■■■□□ 2.19
SIGIRR-209ENST00000527295 NUP155O75694 1391 aa28.72■■■□□ 2.19
SIGIRR-209ENST00000527295 GGT6Q6P531 493 aa28.69■■■□□ 2.18
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