RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526193.5

RBBP4-217, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 4

Gene RBBP4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-217	ENST00000526193	KIF14	Q15058	1648 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBBP4-217	ENST00000526193	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBBP4-217	ENST00000526193	ATP10A	O60312	1499 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBBP4-217	ENST00000526193	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBBP4-217	ENST00000526193	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RBBP4-217	ENST00000526193	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
RBBP4-217	ENST00000526193	KDM5C	P41229	1560 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RBBP4-217	ENST00000526193	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
RBBP4-217	ENST00000526193	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RBBP4-217	ENST00000526193	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RBBP4-217	ENST00000526193	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RBBP4-217	ENST00000526193	RERE	Q9P2R6	1566 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBBP4-217	ENST00000526193	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBBP4-217	ENST00000526193	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBBP4-217	ENST00000526193	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-217	ENST00000526193	AFAP1	Q8N556	730 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-217	ENST00000526193	AGL	P35573	1532 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-217	ENST00000526193	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-217	ENST00000526193	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-217	ENST00000526193	MADD	Q8WXG6	1647 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBBP4-217	ENST00000526193	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBBP4-217	ENST00000526193	PREX2	Q70Z35	1606 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBBP4-217	ENST00000526193	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-217	ENST00000526193	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-217	ENST00000526193	ABCC1	P33527	1531 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-217	ENST00000526193	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-217	ENST00000526193	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBBP4-217	ENST00000526193	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBBP4-217	ENST00000526193	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBBP4-217	ENST00000526193	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBBP4-217	ENST00000526193	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RBBP4-217	ENST00000526193	CEP162	Q5TB80	1403 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBBP4-217	ENST00000526193	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBBP4-217	ENST00000526193	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBBP4-217	ENST00000526193	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBBP4-217	ENST00000526193	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBBP4-217	ENST00000526193	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RBBP4-217	ENST00000526193	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
RBBP4-217	ENST00000526193	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RBBP4-217	ENST00000526193	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RBBP4-217	ENST00000526193	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBBP4-217	ENST00000526193	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RBBP4-217	ENST00000526193	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBBP4-217	ENST00000526193	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBBP4-217	ENST00000526193	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBBP4-217	ENST00000526193	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBBP4-217	ENST00000526193	MAP3K1	Q13233	1512 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBBP4-217	ENST00000526193	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBBP4-217	ENST00000526193	MBD5	Q9P267	1494 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBBP4-217	ENST00000526193	ABCA6	Q8N139	1617 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBBP4-217	ENST00000526193	MLEC	Q14165	292 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBBP4-217	ENST00000526193	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBBP4-217	ENST00000526193	NPAT	Q14207	1427 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBBP4-217	ENST00000526193	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	13.61	□□□□□ -0.23
RBBP4-217	ENST00000526193	FBXO41	Q8TF61	875 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBBP4-217	ENST00000526193	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RBBP4-217	ENST00000526193	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBBP4-217	ENST00000526193	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBBP4-217	ENST00000526193	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBBP4-217	ENST00000526193	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBBP4-217	ENST00000526193	PLXNC1	O60486	1568 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RBBP4-217	ENST00000526193	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-217	ENST00000526193	A2M	P01023	1474 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-217	ENST00000526193	ATP7A	Q04656	1500 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-217	ENST00000526193	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-217	ENST00000526193	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-217	ENST00000526193	TIAM1	Q13009	1591 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-217	ENST00000526193	NCOA2	Q15596	1464 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-217	ENST00000526193	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-217	ENST00000526193	HSPA2	P54652	639 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-217	ENST00000526193	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-217	ENST00000526193	ZMYM3	Q14202	1370 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-217	ENST00000526193	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-217	ENST00000526193	PTPRT	O14522	1441 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-217	ENST00000526193	MIA2	Q96PC5	1412 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-217	ENST00000526193	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-217	ENST00000526193	MROH2A	A6NES4	1674 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-217	ENST00000526193	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-217	ENST00000526193	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-217	ENST00000526193	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-217	ENST00000526193	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-217	ENST00000526193	TSPY4	P0CV99	314 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-217	ENST00000526193	TSPY10	P0CW01	314 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-217	ENST00000526193	C3	P01024	1663 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-217	ENST00000526193	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-217	ENST00000526193	PTPRK	Q15262	1439 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBBP4-217	ENST00000526193	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBBP4-217	ENST00000526193	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBBP4-217	ENST00000526193	CERK	Q8TCT0	537 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBBP4-217	ENST00000526193	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBBP4-217	ENST00000526193	PLA2R1	Q13018	1463 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBBP4-217	ENST00000526193	NCOA1	Q15788	1441 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBBP4-217	ENST00000526193	PKD2	Q13563	968 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBBP4-217	ENST00000526193	GGT6	Q6P531	493 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBBP4-217	ENST00000526193	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBBP4-217	ENST00000526193	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBBP4-217	ENST00000526193	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBBP4-217	ENST00000526193	STRC	Q7RTU9	1775 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-217	ENST00000526193	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-217	ENST00000526193	KIF3B	O15066	747 aa		13.42	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms