RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524226.5

PCM1-222, Transcript of pericentriolar material 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCM1, Length 5,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCM1-222	ENST00000524226	TONSL	Q96HA7	1378 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226		A0A0G2JS52	829 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	CHD1	O14646	1710 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	SLC24A1	O60721	1099 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	TSPY4	P0CV99	314 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	TSPY10	P0CW01	314 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	HFM1	A2PYH4	1435 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	KCNH8	Q96L42	1107 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	NEFM	P07197	916 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	UACA	Q9BZF9	1416 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	DAPK1	P53355	1430 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	ARHGEF11	O15085	1522 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	ABCA8	O94911	1581 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	ROCK1	Q13464	1354 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	AKNA	Q7Z591	1439 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PCM1-222	ENST00000524226	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		3.53	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		3.53	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	NAIP	Q13075	1403 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	ABCC2	Q92887	1545 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	ATP10B	O94823	1461 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	MAPKBP1	O60336	1514 aa		3.51	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		3.51	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	3.51	□□□□□ -1.85	6e-8	■■□□□ 13.7
PCM1-222	ENST00000524226	ABCC5	O15440	1437 aa		3.51	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	SHROOM2	Q13796	1616 aa		3.51	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	3.51	□□□□□ -1.85	7e-7	■■■■□ 20.8
PCM1-222	ENST00000524226	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	PTPRK	Q15262	1439 aa		3.51	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		3.51	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		3.5	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		3.5	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	MLEC	Q14165	292 aa		3.5	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		3.5	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		3.5	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		3.5	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		3.5	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	ANP32C	O43423	234 aa		3.5	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	PREX2	Q70Z35	1606 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	NUP155	O75694	1391 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	KIF15	Q9NS87	1388 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	KANK1	Q14678	1352 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	ADGRL2	O95490	1459 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	3.48	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	PKD2	Q13563	968 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	MIER1	Q8N108	512 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	NCOA1	Q15788	1441 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	PLEKHG5	O94827	1062 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	3.47	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	PLCH2	O75038	1416 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
PCM1-222	ENST00000524226	NPHP1	O15259	732 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PCM1-222	ENST00000524226	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		3.46	□□□□□ -1.86

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