RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524152.5

MSC-AS1-210, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene MSC-AS1, Length 571 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-210ENST00000524152 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.54■□□□□ 0.08
MSC-AS1-210ENST00000524152 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
MSC-AS1-210ENST00000524152 CLIP1P30622 1438 aa15.51■□□□□ 0.07
MSC-AS1-210ENST00000524152 KIF14Q15058 1648 aa15.5■□□□□ 0.07
MSC-AS1-210ENST00000524152 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
MSC-AS1-210ENST00000524152 LMTK3Q96Q04 1460 aa15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-210ENST00000524152 MLECQ14165 292 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-210ENST00000524152 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-210ENST00000524152 ARHGAP5Q13017 1502 aa15.47■□□□□ 0.07
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MSC-AS1-210ENST00000524152 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa15.46■□□□□ 0.06
MSC-AS1-210ENST00000524152 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.45■□□□□ 0.06
MSC-AS1-210ENST00000524152 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.45■□□□□ 0.06
MSC-AS1-210ENST00000524152 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa15.45■□□□□ 0.06
MSC-AS1-210ENST00000524152 CCDC18Q5T9S5 1454 aa15.45■□□□□ 0.06
MSC-AS1-210ENST00000524152 AFAP1Q8N556 730 aa15.44■□□□□ 0.06
MSC-AS1-210ENST00000524152 KDM5CP41229 1560 aa15.41■□□□□ 0.06
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MSC-AS1-210ENST00000524152 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa15.4■□□□□ 0.06
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MSC-AS1-210ENST00000524152 FYCO1Q9BQS8 1478 aa15.4■□□□□ 0.06
MSC-AS1-210ENST00000524152 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.39■□□□□ 0.05
MSC-AS1-210ENST00000524152 MLH3Q9UHC1 1453 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-210ENST00000524152 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa15.37■□□□□ 0.05
MSC-AS1-210ENST00000524152 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-210ENST00000524152 ABCC1P33527 1531 aa15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-210ENST00000524152 PREX2Q70Z35 1606 aa15.35■□□□□ 0.05
MSC-AS1-210ENST00000524152 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa15.35■□□□□ 0.05
MSC-AS1-210ENST00000524152 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa15.35■□□□□ 0.05
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MSC-AS1-210ENST00000524152 ABCA6Q8N139 1617 aa15.32■□□□□ 0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 AGLP35573 1532 aa15.3■□□□□ 0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 ITSN2Q9NZM3 1697 aa15.28■□□□□ 0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa15.28■□□□□ 0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa15.27■□□□□ 0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 PREX1Q8TCU6 1659 aa15.26■□□□□ 0.03
MSC-AS1-210ENST00000524152 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
MSC-AS1-210ENST00000524152 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa15.26■□□□□ 0.03
MSC-AS1-210ENST00000524152 SYCP2Q9BX26 1530 aa15.26■□□□□ 0.03
MSC-AS1-210ENST00000524152 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa15.26■□□□□ 0.03
MSC-AS1-210ENST00000524152 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.25■□□□□ 0.03
MSC-AS1-210ENST00000524152 CCNB3Q8WWL7 1395 aa15.25■□□□□ 0.03
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MSC-AS1-210ENST00000524152 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa15.24■□□□□ 0.03
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MSC-AS1-210ENST00000524152 DMRT2Q9Y5R5 561 aa15.23■□□□□ 0.03
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MSC-AS1-210ENST00000524152 CEP162Q5TB80 1403 aa15.19■□□□□ 0.02
MSC-AS1-210ENST00000524152 ATP7AQ04656 1500 aa15.19■□□□□ 0.02
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MSC-AS1-210ENST00000524152 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa15.17■□□□□ 0.02
MSC-AS1-210ENST00000524152 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
MSC-AS1-210ENST00000524152 A2MP01023 1474 aa15.17■□□□□ 0.02
MSC-AS1-210ENST00000524152 NPATQ14207 1427 aa15.17■□□□□ 0.02
MSC-AS1-210ENST00000524152 PLXNC1O60486 1568 aa15.16■□□□□ 0.02
MSC-AS1-210ENST00000524152 ZMYM3Q14202 1370 aa15.16■□□□□ 0.02
MSC-AS1-210ENST00000524152 TIAM1Q13009 1591 aa15.15■□□□□ 0.02
MSC-AS1-210ENST00000524152 STRCQ7RTU9 1775 aa15.15■□□□□ 0.02
MSC-AS1-210ENST00000524152 MBD5Q9P267 1494 aa15.14■□□□□ 0.01
MSC-AS1-210ENST00000524152 PTPRTO14522 1441 aa15.14■□□□□ 0.01
MSC-AS1-210ENST00000524152 GGT6Q6P531 493 aa15.13■□□□□ 0.01
MSC-AS1-210ENST00000524152 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
MSC-AS1-210ENST00000524152 NCOA1Q15788 1441 aa15.12■□□□□ 0.01
MSC-AS1-210ENST00000524152 MROH2AA6NES4 1674 aa15.12■□□□□ 0.01
MSC-AS1-210ENST00000524152 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa15.11■□□□□ 0.01
MSC-AS1-210ENST00000524152 PPP6R1Q9UPN7 881 aa15.11■□□□□ 0.01
MSC-AS1-210ENST00000524152 NCOA2Q15596 1464 aa15.09■□□□□ 0.01
MSC-AS1-210ENST00000524152 PTPRKQ15262 1439 aa15.09■□□□□ 0.01
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MSC-AS1-210ENST00000524152 CCDC141Q6ZP82 1450 aa15.08■□□□□ 0
MSC-AS1-210ENST00000524152 RSPH4AQ5TD94 716 aa15.07■□□□□ 0
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MSC-AS1-210ENST00000524152 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
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MSC-AS1-210ENST00000524152 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa15.06■□□□□ 0
MSC-AS1-210ENST00000524152 VPS8Q8N3P4 1428 aa15.04■□□□□ -0
MSC-AS1-210ENST00000524152 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.04■□□□□ -0
MSC-AS1-210ENST00000524152 LTBP4Q8N2S1 1624 aa15.03■□□□□ -0
MSC-AS1-210ENST00000524152 MYO3AQ8NEV4 1616 aa15.03■□□□□ -0
MSC-AS1-210ENST00000524152 PLA2R1Q13018 1463 aa15.03■□□□□ -0
MSC-AS1-210ENST00000524152 KIF3BO15066 747 aa15.03■□□□□ -0
MSC-AS1-210ENST00000524152 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
MSC-AS1-210ENST00000524152 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa15.02■□□□□ -0
MSC-AS1-210ENST00000524152 PKD2Q13563 968 aa15.02■□□□□ -0
MSC-AS1-210ENST00000524152 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa15.01□□□□□ -0.01
MSC-AS1-210ENST00000524152 TSPY4P0CV99 314 aa15.01□□□□□ -0.01
MSC-AS1-210ENST00000524152 TSPY10P0CW01 314 aa15.01□□□□□ -0.01
MSC-AS1-210ENST00000524152 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
MSC-AS1-210ENST00000524152 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
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