RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521150.1

SLIT3-208, Transcript of slit guidance ligand 3, human

TSL 2

Gene SLIT3, Length 987 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLIT3-208	ENST00000521150	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		33.63	■■■□□ 2.97
SLIT3-208	ENST00000521150	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	33.58	■■■□□ 2.97
SLIT3-208	ENST00000521150	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	33.57	■■■□□ 2.96
SLIT3-208	ENST00000521150	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.56	■■■□□ 2.96
SLIT3-208	ENST00000521150	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	33.53	■■■□□ 2.96
SLIT3-208	ENST00000521150	MLEC	Q14165	292 aa		33.52	■■■□□ 2.96
SLIT3-208	ENST00000521150	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		33.52	■■■□□ 2.96
SLIT3-208	ENST00000521150	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.51	■■■□□ 2.96
SLIT3-208	ENST00000521150	ATP10A	O60312	1499 aa		33.5	■■■□□ 2.95
SLIT3-208	ENST00000521150	FBXO41	Q8TF61	875 aa		33.5	■■■□□ 2.95
SLIT3-208	ENST00000521150	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.49	■■■□□ 2.95
SLIT3-208	ENST00000521150	CLIP1	P30622	1438 aa		33.48	■■■□□ 2.95
SLIT3-208	ENST00000521150	KIF14	Q15058	1648 aa		33.48	■■■□□ 2.95
SLIT3-208	ENST00000521150	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.43	■■■□□ 2.94
SLIT3-208	ENST00000521150	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.43	■■■□□ 2.94
SLIT3-208	ENST00000521150	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.42	■■■□□ 2.94
SLIT3-208	ENST00000521150	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		33.42	■■■□□ 2.94
SLIT3-208	ENST00000521150	HSPA2	P54652	639 aa		33.41	■■■□□ 2.94
SLIT3-208	ENST00000521150	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		33.39	■■■□□ 2.94
SLIT3-208	ENST00000521150	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		33.37	■■■□□ 2.93
SLIT3-208	ENST00000521150	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.37	■■■□□ 2.93
SLIT3-208	ENST00000521150	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.36	■■■□□ 2.93
SLIT3-208	ENST00000521150	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.35	■■■□□ 2.93
SLIT3-208	ENST00000521150	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SLIT3-208	ENST00000521150	KDM5C	P41229	1560 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SLIT3-208	ENST00000521150	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.29	■■■□□ 2.92
SLIT3-208	ENST00000521150	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.91
SLIT3-208	ENST00000521150	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.25	■■■□□ 2.91
SLIT3-208	ENST00000521150	PREX2	Q70Z35	1606 aa		33.22	■■■□□ 2.91
SLIT3-208	ENST00000521150	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.21	■■■□□ 2.91
SLIT3-208	ENST00000521150	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.21	■■■□□ 2.91
SLIT3-208	ENST00000521150	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.2	■■■□□ 2.91
SLIT3-208	ENST00000521150	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SLIT3-208	ENST00000521150	ABCC1	P33527	1531 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SLIT3-208	ENST00000521150	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		33.14	■■■□□ 2.9
SLIT3-208	ENST00000521150	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.13	■■■□□ 2.89
SLIT3-208	ENST00000521150	AGL	P35573	1532 aa		33.12	■■■□□ 2.89
SLIT3-208	ENST00000521150	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.11	■■■□□ 2.89
SLIT3-208	ENST00000521150	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
SLIT3-208	ENST00000521150	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.11	■■■□□ 2.89
SLIT3-208	ENST00000521150	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
SLIT3-208	ENST00000521150	CERK	Q8TCT0	537 aa		33.1	■■■□□ 2.89
SLIT3-208	ENST00000521150	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
SLIT3-208	ENST00000521150	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		33.07	■■■□□ 2.88
SLIT3-208	ENST00000521150	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.07	■■■□□ 2.88
SLIT3-208	ENST00000521150	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
SLIT3-208	ENST00000521150	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SLIT3-208	ENST00000521150	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.02	■■■□□ 2.88
SLIT3-208	ENST00000521150	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33	■■■□□ 2.87
SLIT3-208	ENST00000521150	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
SLIT3-208	ENST00000521150	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
SLIT3-208	ENST00000521150	C3	P01024	1663 aa		32.98	■■■□□ 2.87
SLIT3-208	ENST00000521150	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.97	■■■□□ 2.87
SLIT3-208	ENST00000521150	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SLIT3-208	ENST00000521150	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SLIT3-208	ENST00000521150	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32.95	■■■□□ 2.87
SLIT3-208	ENST00000521150	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		32.95	■■■□□ 2.86
SLIT3-208	ENST00000521150	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SLIT3-208	ENST00000521150	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SLIT3-208	ENST00000521150	PTPRT	O14522	1441 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SLIT3-208	ENST00000521150	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SLIT3-208	ENST00000521150	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SLIT3-208	ENST00000521150	NPAT	Q14207	1427 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SLIT3-208	ENST00000521150	A2M	P01023	1474 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SLIT3-208	ENST00000521150	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
SLIT3-208	ENST00000521150	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SLIT3-208	ENST00000521150	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
SLIT3-208	ENST00000521150	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
SLIT3-208	ENST00000521150	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.76	■■■□□ 2.84
SLIT3-208	ENST00000521150	GGT6	Q6P531	493 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SLIT3-208	ENST00000521150	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SLIT3-208	ENST00000521150	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SLIT3-208	ENST00000521150	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SLIT3-208	ENST00000521150	TIAM1	Q13009	1591 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SLIT3-208	ENST00000521150	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SLIT3-208	ENST00000521150	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SLIT3-208	ENST00000521150	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
SLIT3-208	ENST00000521150	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SLIT3-208	ENST00000521150	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SLIT3-208	ENST00000521150	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SLIT3-208	ENST00000521150	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SLIT3-208	ENST00000521150	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
SLIT3-208	ENST00000521150	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SLIT3-208	ENST00000521150	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SLIT3-208	ENST00000521150	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SLIT3-208	ENST00000521150	PKD2	Q13563	968 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SLIT3-208	ENST00000521150	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SLIT3-208	ENST00000521150	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SLIT3-208	ENST00000521150	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SLIT3-208	ENST00000521150	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SLIT3-208	ENST00000521150	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
SLIT3-208	ENST00000521150	KIF3B	O15066	747 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SLIT3-208	ENST00000521150	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SLIT3-208	ENST00000521150	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
SLIT3-208	ENST00000521150	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SLIT3-208	ENST00000521150	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
SLIT3-208	ENST00000521150	TSPY4	P0CV99	314 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SLIT3-208	ENST00000521150	TSPY10	P0CW01	314 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SLIT3-208	ENST00000521150	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
SLIT3-208	ENST00000521150	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		32.45	■■■□□ 2.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms