RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520904.3

GYG2-208, Transcript of glycogenin 2, human

TSL 3

Gene GYG2, Length 624 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GYG2-208	ENST00000520904	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
GYG2-208	ENST00000520904	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
GYG2-208	ENST00000520904	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		33.13	■■■□□ 2.89
GYG2-208	ENST00000520904	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		33.12	■■■□□ 2.89
GYG2-208	ENST00000520904	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
GYG2-208	ENST00000520904	RAPGEF3	O95398	923 aa		33.07	■■■□□ 2.88
GYG2-208	ENST00000520904	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		33.07	■■■□□ 2.88
GYG2-208	ENST00000520904	KDM6B	O15054	1643 aa		33.05	■■■□□ 2.88
GYG2-208	ENST00000520904	PREX2	Q70Z35	1606 aa		33.05	■■■□□ 2.88
GYG2-208	ENST00000520904	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.05	■■■□□ 2.88
GYG2-208	ENST00000520904	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		33.04	■■■□□ 2.88
GYG2-208	ENST00000520904	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.04	■■■□□ 2.88
GYG2-208	ENST00000520904	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
GYG2-208	ENST00000520904	ADGRL1	O94910	1474 aa		33.03	■■■□□ 2.88
GYG2-208	ENST00000520904	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
GYG2-208	ENST00000520904	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.01	■■■□□ 2.87
GYG2-208	ENST00000520904	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.99	■■■□□ 2.87
GYG2-208	ENST00000520904	MIA2	Q96PC5	1412 aa		32.97	■■■□□ 2.87
GYG2-208	ENST00000520904	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		32.96	■■■□□ 2.87
GYG2-208	ENST00000520904	AFAP1	Q8N556	730 aa		32.96	■■■□□ 2.87
GYG2-208	ENST00000520904	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.94	■■■□□ 2.86
GYG2-208	ENST00000520904	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.93	■■■□□ 2.86
GYG2-208	ENST00000520904	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		32.92	■■■□□ 2.86
GYG2-208	ENST00000520904	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		32.91	■■■□□ 2.86
GYG2-208	ENST00000520904	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		32.89	■■■□□ 2.86
GYG2-208	ENST00000520904	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		32.88	■■■□□ 2.85
GYG2-208	ENST00000520904	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		32.88	■■■□□ 2.85
GYG2-208	ENST00000520904	ABCC1	P33527	1531 aa		32.87	■■■□□ 2.85
GYG2-208	ENST00000520904	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.85	■■■□□ 2.85
GYG2-208	ENST00000520904	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		32.84	■■■□□ 2.85
GYG2-208	ENST00000520904	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.82	■■■□□ 2.84
GYG2-208	ENST00000520904	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.82	■■■□□ 2.84
GYG2-208	ENST00000520904	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		32.81	■■■□□ 2.84
GYG2-208	ENST00000520904	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32.8	■■■□□ 2.84
GYG2-208	ENST00000520904	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		32.79	■■■□□ 2.84
GYG2-208	ENST00000520904	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
GYG2-208	ENST00000520904	TSPY4	P0CV99	314 aa		32.77	■■■□□ 2.84
GYG2-208	ENST00000520904	TSPY10	P0CW01	314 aa		32.77	■■■□□ 2.84
GYG2-208	ENST00000520904	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		32.77	■■■□□ 2.84
GYG2-208	ENST00000520904	RICTOR	Q6R327	1708 aa		32.77	■■■□□ 2.84
GYG2-208	ENST00000520904	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
GYG2-208	ENST00000520904	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
GYG2-208	ENST00000520904	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		32.72	■■■□□ 2.83
GYG2-208	ENST00000520904	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		32.72	■■■□□ 2.83
GYG2-208	ENST00000520904	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.71	■■■□□ 2.83
GYG2-208	ENST00000520904	KDM5C	P41229	1560 aa		32.7	■■■□□ 2.83
GYG2-208	ENST00000520904	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32.67	■■■□□ 2.82
GYG2-208	ENST00000520904	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		32.67	■■■□□ 2.82
GYG2-208	ENST00000520904	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.65	■■■□□ 2.82
GYG2-208	ENST00000520904	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		32.65	■■■□□ 2.82
GYG2-208	ENST00000520904	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.64	■■■□□ 2.82	3e-6	■■□□□ 11.9
GYG2-208	ENST00000520904	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		32.62	■■■□□ 2.81
GYG2-208	ENST00000520904	ABCC5	O15440	1437 aa		32.62	■■■□□ 2.81
GYG2-208	ENST00000520904	ATP10A	O60312	1499 aa		32.61	■■■□□ 2.81
GYG2-208	ENST00000520904	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
GYG2-208	ENST00000520904	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		32.58	■■■□□ 2.81
GYG2-208	ENST00000520904	DAPK1	P53355	1430 aa		32.57	■■■□□ 2.8
GYG2-208	ENST00000520904	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.54	■■■□□ 2.8
GYG2-208	ENST00000520904	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
GYG2-208	ENST00000520904	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.53	■■■□□ 2.8
GYG2-208	ENST00000520904	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		32.52	■■■□□ 2.8
GYG2-208	ENST00000520904	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		32.52	■■■□□ 2.8
GYG2-208	ENST00000520904	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		32.52	■■■□□ 2.8
GYG2-208	ENST00000520904	ITGAE	P38570	1179 aa		32.5	■■■□□ 2.79
GYG2-208	ENST00000520904	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
GYG2-208	ENST00000520904	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
GYG2-208	ENST00000520904	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		32.47	■■■□□ 2.79
GYG2-208	ENST00000520904	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		32.46	■■■□□ 2.79
GYG2-208	ENST00000520904	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
GYG2-208	ENST00000520904	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GYG2-208	ENST00000520904	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GYG2-208	ENST00000520904	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.44	■■■□□ 2.78
GYG2-208	ENST00000520904	ABCA6	Q8N139	1617 aa		32.43	■■■□□ 2.78
GYG2-208	ENST00000520904	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.43	■■■□□ 2.78
GYG2-208	ENST00000520904	A2M	P01023	1474 aa		32.42	■■■□□ 2.78
GYG2-208	ENST00000520904	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.39	■■■□□ 2.78
GYG2-208	ENST00000520904	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.38	■■■□□ 2.77
GYG2-208	ENST00000520904	MLEC	Q14165	292 aa		32.37	■■■□□ 2.77
GYG2-208	ENST00000520904	KIF15	Q9NS87	1388 aa		32.35	■■■□□ 2.77
GYG2-208	ENST00000520904	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		32.35	■■■□□ 2.77
GYG2-208	ENST00000520904	AGL	P35573	1532 aa		32.35	■■■□□ 2.77
GYG2-208	ENST00000520904	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.34	■■■□□ 2.77
GYG2-208	ENST00000520904	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.33	■■■□□ 2.77
GYG2-208	ENST00000520904	KIF3B	O15066	747 aa		32.33	■■■□□ 2.77
GYG2-208	ENST00000520904	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.31	■■■□□ 2.76
GYG2-208	ENST00000520904	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.29	■■■□□ 2.76
GYG2-208	ENST00000520904	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.28	■■■□□ 2.76
GYG2-208	ENST00000520904	GGT6	Q6P531	493 aa		32.28	■■■□□ 2.76
GYG2-208	ENST00000520904	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		32.27	■■■□□ 2.76
GYG2-208	ENST00000520904	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.26	■■■□□ 2.75
GYG2-208	ENST00000520904	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		32.26	■■■□□ 2.75
GYG2-208	ENST00000520904	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
GYG2-208	ENST00000520904	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		32.19	■■■□□ 2.74
GYG2-208	ENST00000520904	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.18	■■■□□ 2.74
GYG2-208	ENST00000520904	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		32.17	■■■□□ 2.74
GYG2-208	ENST00000520904	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		32.13	■■■□□ 2.73
GYG2-208	ENST00000520904	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.1	■■■□□ 2.73
GYG2-208	ENST00000520904	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		32.09	■■■□□ 2.73
GYG2-208	ENST00000520904	NAIP	Q13075	1403 aa		32.09	■■■□□ 2.73
GYG2-208	ENST00000520904	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms