RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
TRPS1-211ENST00000520276 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.15□□□□□ -0.14
TRPS1-211ENST00000520276 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
TRPS1-211ENST00000520276 CD109Q6YHK3 1445 aa14.13□□□□□ -0.15
TRPS1-211ENST00000520276 SAMD9Q5K651 1589 aa14.13□□□□□ -0.15
TRPS1-211ENST00000520276 SHROOM2Q13796 1616 aa14.13□□□□□ -0.15
TRPS1-211ENST00000520276 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM52Q96A61 297 aa14.11□□□□□ -0.15
TRPS1-211ENST00000520276 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa14.11□□□□□ -0.15
TRPS1-211ENST00000520276 WDR7Q9Y4E6 1490 aa14.1□□□□□ -0.15
TRPS1-211ENST00000520276 PLPPR3Q6T4P5 718 aa14.1□□□□□ -0.15
TRPS1-211ENST00000520276 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
TRPS1-211ENST00000520276 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.1□□□□□ -0.15
TRPS1-211ENST00000520276 NBR1Q14596 966 aa14.08□□□□□ -0.16
TRPS1-211ENST00000520276 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.07□□□□□ -0.16
TRPS1-211ENST00000520276 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
TRPS1-211ENST00000520276 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
TRPS1-211ENST00000520276 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
TRPS1-211ENST00000520276 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.05□□□□□ -0.16
TRPS1-211ENST00000520276 ABCA8O94911 1581 aa14.05□□□□□ -0.16
TRPS1-211ENST00000520276 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.05□□□□□ -0.16
TRPS1-211ENST00000520276 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
TRPS1-211ENST00000520276 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14.04□□□□□ -0.16
TRPS1-211ENST00000520276 MLECQ14165 292 aa14.04□□□□□ -0.16
TRPS1-211ENST00000520276 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
TRPS1-211ENST00000520276 IL27Q8NEV9 243 aa14.04□□□□□ -0.16
TRPS1-211ENST00000520276 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP14.04□□□□□ -0.16
TRPS1-211ENST00000520276 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.02□□□□□ -0.16
TRPS1-211ENST00000520276 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.02□□□□□ -0.16
TRPS1-211ENST00000520276 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.02□□□□□ -0.16
TRPS1-211ENST00000520276 NCOA2Q15596 1464 aa14.02□□□□□ -0.17
TRPS1-211ENST00000520276 RAPGEF3O95398 923 aa14.01□□□□□ -0.17
TRPS1-211ENST00000520276 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
TRPS1-211ENST00000520276 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa14□□□□□ -0.17
TRPS1-211ENST00000520276 KIF14Q15058 1648 aa14□□□□□ -0.17
TRPS1-211ENST00000520276 TIAM1Q13009 1591 aa14□□□□□ -0.17
TRPS1-211ENST00000520276 AFAP1Q8N556 730 aa14□□□□□ -0.17
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
TRPS1-211ENST00000520276 SCAPERQ9BY12 1400 aa13.99□□□□□ -0.17
TRPS1-211ENST00000520276 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
TRPS1-211ENST00000520276 ERICH6BQ5W0A0 696 aa13.98□□□□□ -0.17
TRPS1-211ENST00000520276 ADCY10Q96PN6 1610 aa13.98□□□□□ -0.17
TRPS1-211ENST00000520276 MYOM3Q5VTT5 1437 aa13.97□□□□□ -0.17
TRPS1-211ENST00000520276 GGT6Q6P531 493 aa13.96□□□□□ -0.17
TRPS1-211ENST00000520276 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
TRPS1-211ENST00000520276 ABCC10Q5T3U5 1492 aa13.96□□□□□ -0.17
TRPS1-211ENST00000520276 FANCAO15360 1455 aa13.96□□□□□ -0.17
TRPS1-211ENST00000520276 PHLDB1Q86UU1 1377 aa13.95□□□□□ -0.18
TRPS1-211ENST00000520276 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa13.94□□□□□ -0.18
TRPS1-211ENST00000520276 PLCH2O75038 1416 aa13.94□□□□□ -0.18
TRPS1-211ENST00000520276 ADGRL1O94910 1474 aa13.93□□□□□ -0.18
TRPS1-211ENST00000520276 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
TRPS1-211ENST00000520276 AKNAQ7Z591 1439 aa13.93□□□□□ -0.18
TRPS1-211ENST00000520276 MAP3K1Q13233 1512 aa13.93□□□□□ -0.18
TRPS1-211ENST00000520276 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
TRPS1-211ENST00000520276 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa13.92□□□□□ -0.18
TRPS1-211ENST00000520276 KIF3BO15066 747 aa13.92□□□□□ -0.18
TRPS1-211ENST00000520276 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
TRPS1-211ENST00000520276 FGD6Q6ZV73 1430 aa13.91□□□□□ -0.18
TRPS1-211ENST00000520276 MAPKBP1O60336 1514 aa13.9□□□□□ -0.18
TRPS1-211ENST00000520276 STAG3Q9UJ98 1225 aa13.9□□□□□ -0.18
TRPS1-211ENST00000520276 MIA2Q96PC5 1412 aa13.89□□□□□ -0.19
TRPS1-211ENST00000520276 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
TRPS1-211ENST00000520276 KANK1Q14678 1352 aa13.87□□□□□ -0.19
TRPS1-211ENST00000520276 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
TRPS1-211ENST00000520276 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
TRPS1-211ENST00000520276 TSPOAP1O95153 1857 aa13.86□□□□□ -0.19
TRPS1-211ENST00000520276 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
TRPS1-211ENST00000520276 CHGAP10645 457 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
TRPS1-211ENST00000520276 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa13.83□□□□□ -0.2
TRPS1-211ENST00000520276 NEO1Q92859 1461 aa13.83□□□□□ -0.2
TRPS1-211ENST00000520276 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
TRPS1-211ENST00000520276 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP13.82□□□□□ -0.2
TRPS1-211ENST00000520276 POGZQ7Z3K3 1410 aa13.82□□□□□ -0.2
TRPS1-211ENST00000520276 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa13.81□□□□□ -0.2
TRPS1-211ENST00000520276 CCER2I3L3R5 266 aa13.8□□□□□ -0.2
TRPS1-211ENST00000520276 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa13.8□□□□□ -0.2
TRPS1-211ENST00000520276 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC141Q6ZP82 1450 aa13.79□□□□□ -0.2
TRPS1-211ENST00000520276 KIF15Q9NS87 1388 aa13.79□□□□□ -0.2
TRPS1-211ENST00000520276 ANP32CO43423 234 aa13.79□□□□□ -0.2
TRPS1-211ENST00000520276 CFAP43Q8NDM7 1665 aa13.79□□□□□ -0.2
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa13.79□□□□□ -0.2
TRPS1-211ENST00000520276 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa13.78□□□□□ -0.2
TRPS1-211ENST00000520276 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP13.78□□□□□ -0.2
TRPS1-211ENST00000520276 C9orf84Q5VXU9 1444 aa13.78□□□□□ -0.2
TRPS1-211ENST00000520276 ITSN2Q9NZM3 1697 aa13.77□□□□□ -0.2
TRPS1-211ENST00000520276 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa13.77□□□□□ -0.2
TRPS1-211ENST00000520276 PPP4R2Q9NY27 417 aa13.77□□□□□ -0.21
TRPS1-211ENST00000520276 DIP2BQ9P265 1576 aa13.76□□□□□ -0.21
TRPS1-211ENST00000520276 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
TRPS1-211ENST00000520276 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa13.75□□□□□ -0.21
TRPS1-211ENST00000520276 NUP155O75694 1391 aa13.75□□□□□ -0.21
TRPS1-211ENST00000520276 MYO5CQ9NQX4 1742 aa13.74□□□□□ -0.21
TRPS1-211ENST00000520276 TTC37Q6PGP7 1564 aa13.74□□□□□ -0.21
TRPS1-211ENST00000520276 CFAP74Q9C0B2 1584 aa13.74□□□□□ -0.21
TRPS1-211ENST00000520276 SYCP2Q9BX26 1530 aa13.74□□□□□ -0.21
TRPS1-211ENST00000520276 DAPK1P53355 1430 aa13.73□□□□□ -0.21
TRPS1-211ENST00000520276 GLI2P10070 1586 aa13.73□□□□□ -0.21
TRPS1-211ENST00000520276 KDM6BO15054 1643 aa13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms