RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518916.5

MSC-AS1-204, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 864 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-204ENST00000518916 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.43■■□□□ 1.18
MSC-AS1-204ENST00000518916 PREX2Q70Z35 1606 aa22.42■■□□□ 1.18
MSC-AS1-204ENST00000518916 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
MSC-AS1-204ENST00000518916 KCNH8Q96L42 1107 aa22.4■■□□□ 1.18
MSC-AS1-204ENST00000518916 CD109Q6YHK3 1445 aa22.4■■□□□ 1.18
MSC-AS1-204ENST00000518916 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.39■■□□□ 1.17
MSC-AS1-204ENST00000518916 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
MSC-AS1-204ENST00000518916 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
MSC-AS1-204ENST00000518916 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
MSC-AS1-204ENST00000518916 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
MSC-AS1-204ENST00000518916 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
MSC-AS1-204ENST00000518916 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.34■■□□□ 1.17
MSC-AS1-204ENST00000518916 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.33■■□□□ 1.17
MSC-AS1-204ENST00000518916 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.33■■□□□ 1.16
MSC-AS1-204ENST00000518916 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.31■■□□□ 1.16
MSC-AS1-204ENST00000518916 PLCH2O75038 1416 aa22.29■■□□□ 1.16
MSC-AS1-204ENST00000518916 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.25■■□□□ 1.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.25■■□□□ 1.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 ITGAEP38570 1179 aa22.25■■□□□ 1.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.25■■□□□ 1.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 NEO1Q92859 1461 aa22.22■■□□□ 1.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.21■■□□□ 1.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.2■■□□□ 1.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 FANCAO15360 1455 aa22.2■■□□□ 1.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 DAPK1P53355 1430 aa22.19■■□□□ 1.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.19■■□□□ 1.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 ABCC1P33527 1531 aa22.17■■□□□ 1.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.17■■□□□ 1.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.15■■□□□ 1.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.14■■□□□ 1.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.14■■□□□ 1.13
MSC-AS1-204ENST00000518916 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.14■■□□□ 1.13
MSC-AS1-204ENST00000518916 ABCC5O15440 1437 aa22.14■■□□□ 1.13
MSC-AS1-204ENST00000518916 ADGRL1O94910 1474 aa22.1■■□□□ 1.13
MSC-AS1-204ENST00000518916 MBD5Q9P267 1494 aa22.1■■□□□ 1.13
MSC-AS1-204ENST00000518916 PTPRKQ15262 1439 aa22.1■■□□□ 1.13
MSC-AS1-204ENST00000518916 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.1■■□□□ 1.13
MSC-AS1-204ENST00000518916 AKNAQ7Z591 1439 aa22.09■■□□□ 1.13
MSC-AS1-204ENST00000518916 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.07■■□□□ 1.12
MSC-AS1-204ENST00000518916 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.07■■□□□ 1.12
MSC-AS1-204ENST00000518916 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
MSC-AS1-204ENST00000518916 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.06■■□□□ 1.12
MSC-AS1-204ENST00000518916 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
MSC-AS1-204ENST00000518916 ROCK1Q13464 1354 aa22.06■■□□□ 1.12
MSC-AS1-204ENST00000518916 HFM1A2PYH4 1435 aa22.06■■□□□ 1.12
MSC-AS1-204ENST00000518916 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.05■■□□□ 1.12
MSC-AS1-204ENST00000518916 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.05■■□□□ 1.12
MSC-AS1-204ENST00000518916 ADGRL2O95490 1459 aa22.04■■□□□ 1.12
MSC-AS1-204ENST00000518916 TSPY4P0CV99 314 aa22.04■■□□□ 1.12
MSC-AS1-204ENST00000518916 TSPY10P0CW01 314 aa22.04■■□□□ 1.12
MSC-AS1-204ENST00000518916 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.04■■□□□ 1.12
MSC-AS1-204ENST00000518916 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.04■■□□□ 1.12
MSC-AS1-204ENST00000518916 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.03■■□□□ 1.12
MSC-AS1-204ENST00000518916 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.02■■□□□ 1.12
MSC-AS1-204ENST00000518916 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.02■■□□□ 1.12
MSC-AS1-204ENST00000518916 RAPGEF3O95398 923 aa22.01■■□□□ 1.11
MSC-AS1-204ENST00000518916 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
MSC-AS1-204ENST00000518916 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22■■□□□ 1.11
MSC-AS1-204ENST00000518916 NAIPQ13075 1403 aa21.99■■□□□ 1.11
MSC-AS1-204ENST00000518916 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.99■■□□□ 1.11
MSC-AS1-204ENST00000518916 RICTORQ6R327 1708 aa21.99■■□□□ 1.11
MSC-AS1-204ENST00000518916 PLXNC1O60486 1568 aa21.98■■□□□ 1.11
MSC-AS1-204ENST00000518916 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.98■■□□□ 1.11
MSC-AS1-204ENST00000518916 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.97■■□□□ 1.11
MSC-AS1-204ENST00000518916 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.97■■□□□ 1.11
MSC-AS1-204ENST00000518916 NCOA1Q15788 1441 aa21.97■■□□□ 1.11
MSC-AS1-204ENST00000518916 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.96■■□□□ 1.11
MSC-AS1-204ENST00000518916 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.95■■□□□ 1.1
MSC-AS1-204ENST00000518916 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
MSC-AS1-204ENST00000518916 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
MSC-AS1-204ENST00000518916 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.94■■□□□ 1.1
MSC-AS1-204ENST00000518916 KDM5CP41229 1560 aa21.94■■□□□ 1.1
MSC-AS1-204ENST00000518916 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.93■■□□□ 1.1
MSC-AS1-204ENST00000518916 ATP7AQ04656 1500 aa21.93■■□□□ 1.1
MSC-AS1-204ENST00000518916 KIF15Q9NS87 1388 aa21.92■■□□□ 1.1
MSC-AS1-204ENST00000518916 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.91■■□□□ 1.1
MSC-AS1-204ENST00000518916 HRCP23327 699 aa21.89■■□□□ 1.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 AFAP1Q8N556 730 aa21.89■■□□□ 1.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.88■■□□□ 1.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.88■■□□□ 1.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.87■■□□□ 1.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.86■■□□□ 1.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.85■■□□□ 1.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.84■■□□□ 1.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 ERBINQ96RT1 1412 aa21.82■■□□□ 1.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.8■■□□□ 1.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 ABCA6Q8N139 1617 aa21.78■■□□□ 1.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.78■■□□□ 1.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.76■■□□□ 1.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 ATP10AO60312 1499 aa21.76■■□□□ 1.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.75■■□□□ 1.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 TRIM52Q96A61 297 aa21.75■■□□□ 1.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 UNC13BO14795 1591 aa21.74■■□□□ 1.07
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